More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2208 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
823 aa  1667    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  34.14 
 
 
1361 aa  397  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1362 aa  387  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  44.12 
 
 
977 aa  380  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 
858 aa  371  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  40.26 
 
 
1046 aa  358  2.9999999999999997e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  42.08 
 
 
970 aa  355  1e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2805  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.25 
 
 
927 aa  349  1e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3699  histidine kinase  38.46 
 
 
998 aa  339  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1526  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.45 
 
 
975 aa  337  5e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3876  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.23 
 
 
1022 aa  335  2e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0213  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.27 
 
 
974 aa  335  3e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0934932  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.61 
 
 
687 aa  334  4e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.55 
 
 
1137 aa  333  8e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0626  histidine kinase  37.86 
 
 
1137 aa  330  8e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4784  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.14 
 
 
1141 aa  329  1.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2159  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.84 
 
 
796 aa  329  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.758044 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4779  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.78 
 
 
1195 aa  325  3e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.133558  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0022  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.83 
 
 
1356 aa  324  4e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1035  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.43 
 
 
1201 aa  323  5e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3786  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.01 
 
 
1155 aa  321  3.9999999999999996e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5566  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 
1203 aa  320  7e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0247633 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4734  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.72 
 
 
798 aa  318  3e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660973 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4217  PAS sensor protein  40.44 
 
 
792 aa  317  4e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.423052  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4587  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.44 
 
 
803 aa  317  5e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0699795  normal  0.0670662 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0587  ATP-binding region ATPase domain protein  33.43 
 
 
1161 aa  316  9.999999999999999e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2672  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.79 
 
 
991 aa  316  9.999999999999999e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.646953  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3446  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.43 
 
 
791 aa  315  1.9999999999999998e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285515  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.63 
 
 
1003 aa  314  2.9999999999999996e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.284418 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6353  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.62 
 
 
1839 aa  312  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3719  sensor histidine kinase  36.17 
 
 
1278 aa  313  1e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0393  histidine kinase  28.27 
 
 
1200 aa  311  2e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.564913 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2142  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.2 
 
 
1149 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.694825  hitchhiker  0.00121197 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5171  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.16 
 
 
1857 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472035  normal  0.0675906 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2143  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.64 
 
 
755 aa  309  2.0000000000000002e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5393  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.89 
 
 
2099 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0480029  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2646  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.59 
 
 
1163 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2076  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.09 
 
 
2107 aa  309  2.0000000000000002e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3996  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.22 
 
 
1159 aa  307  4.0000000000000004e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374046  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.48 
 
 
1155 aa  307  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2445  response regulator receiver  36.62 
 
 
1172 aa  307  6e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00053345 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9103  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.5 
 
 
1145 aa  306  1.0000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4316  sensor histidine kinase  32.76 
 
 
1695 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.946527 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5109  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.53 
 
 
2099 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0669819 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1648  histidine kinase  36.27 
 
 
1374 aa  305  3.0000000000000004e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.102759  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3764  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.93 
 
 
917 aa  304  3.0000000000000004e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.432635  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4696  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.46 
 
 
1917 aa  305  3.0000000000000004e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257042  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3493  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.84 
 
 
1782 aa  303  8.000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0298684  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1216  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.26 
 
 
1194 aa  303  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.469894 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0169  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.48 
 
 
1168 aa  302  2e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5353  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.4 
 
 
1143 aa  302  2e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.385348 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.3 
 
 
1352 aa  301  4e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1942  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.93 
 
 
1038 aa  300  6e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2587  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.31 
 
 
1158 aa  300  7e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.48 
 
 
1954 aa  300  7e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2712  sensor histidine kinase/response regulator  35.63 
 
 
1170 aa  299  1e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340753  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1705  histidine kinase  35.33 
 
 
910 aa  299  1e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1136  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.93 
 
 
1896 aa  299  2e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270239  normal  0.51439 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.46 
 
 
1271 aa  298  2e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5390  multi-sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 
1195 aa  298  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.596605  hitchhiker  0.00757911 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1671  histidine kinase  38.12 
 
 
1937 aa  298  3e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1989  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.93 
 
 
1937 aa  296  7e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1961  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.99 
 
 
1713 aa  297  7e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.280335  normal  0.123564 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.37 
 
 
1165 aa  296  8e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.985282 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5091  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.72 
 
 
1479 aa  296  1e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.493325  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2002  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.48 
 
 
1155 aa  296  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00831305 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3761  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.96 
 
 
1155 aa  294  5e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.358181  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1960  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.58 
 
 
1680 aa  290  9e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.0344276 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3354  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.99 
 
 
1189 aa  290  1e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.426502  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3558  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.44 
 
 
984 aa  289  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.299477 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2080  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein  29.75 
 
 
1158 aa  287  5e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.264996 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3210  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.76 
 
 
1936 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596339  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1267  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.49 
 
 
916 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3831  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.19 
 
 
1177 aa  285  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195944  normal  0.0220401 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4248  ATP-binding region ATPase domain protein  33.08 
 
 
1196 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1135  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.18 
 
 
1142 aa  284  5.000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0522922  normal  0.044499 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6441  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.35 
 
 
1937 aa  284  5.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1215  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.61 
 
 
944 aa  283  7.000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.960151  normal  0.101285 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2644  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.47 
 
 
1303 aa  282  2e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.229306  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2642  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.56 
 
 
1216 aa  281  3e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.974276  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1090  sensor histidine kinase/response regulator  31.14 
 
 
896 aa  281  4e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.358618  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0401  sensor histidine kinase/response regulator  32.16 
 
 
1392 aa  280  6e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1073  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.98 
 
 
1158 aa  280  9e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00830683  normal  0.406928 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3648  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.4 
 
 
1237 aa  279  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.289797  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1072  sensor histidine kinase/response regulator  30.82 
 
 
896 aa  278  2e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.88167e-43 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0917  sensor histidine kinase  30.83 
 
 
896 aa  278  3e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1037  sensor histidine kinase/response regulator  30.67 
 
 
896 aa  278  3e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1163  sensor histidine kinase/response regulator  30.83 
 
 
896 aa  278  4e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0144  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.72 
 
 
1119 aa  277  6e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0932  sensor histidine kinase/response regulator  30.66 
 
 
896 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0996  sensor histidine kinase/response regulator  30.66 
 
 
896 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1555  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.9 
 
 
1172 aa  276  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0698206 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0325  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.45 
 
 
2037 aa  275  3e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0900  sensor histidine kinase  30.66 
 
 
896 aa  274  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5629  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.72 
 
 
2010 aa  272  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.117507 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4266  sensor histidine kinase/response regulator  28.18 
 
 
896 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000252034 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2112  Cache sensor hybrid histidine kinase  35.47 
 
 
1361 aa  271  2.9999999999999997e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.92 
 
 
1611 aa  270  8e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0185  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.47 
 
 
1214 aa  268  2e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467777  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2180  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.43 
 
 
922 aa  267  5.999999999999999e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.238731  normal  0.0123004 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>