More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0144 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0185  GAF sensor hybrid histidine kinase  62.08 
 
 
1214 aa  1298    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467777  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5202  GAF sensor hybrid histidine kinase  56.33 
 
 
1478 aa  1196    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0874625 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3548  GAF sensor hybrid histidine kinase  52.42 
 
 
1942 aa  1075    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  53.95 
 
 
1954 aa  1120    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2076  GAF sensor hybrid histidine kinase  52.89 
 
 
2107 aa  1027    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0666  GAF sensor hybrid histidine kinase  60.69 
 
 
1400 aa  1050    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.982341 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5171  GAF sensor hybrid histidine kinase  51.59 
 
 
1857 aa  999    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472035  normal  0.0675906 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5109  GAF sensor hybrid histidine kinase  51.61 
 
 
2099 aa  1002    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0669819 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4117  GAF sensor hybrid histidine kinase  66.48 
 
 
1588 aa  1144    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0887298  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3328  GAF sensor hybrid histidine kinase  65.17 
 
 
1482 aa  1124    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4523  GAF sensor hybrid histidine kinase  58.45 
 
 
1179 aa  1184    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522992  decreased coverage  0.00180703 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1943  GAF sensor hybrid histidine kinase  59.21 
 
 
1468 aa  1126    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1136  GAF sensor hybrid histidine kinase  53.03 
 
 
1896 aa  1026    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270239  normal  0.51439 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0286  GAF sensor hybrid histidine kinase  59.19 
 
 
1406 aa  1258    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2644  GAF sensor hybrid histidine kinase  63.39 
 
 
1303 aa  1330    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.229306  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1989  GAF sensor hybrid histidine kinase  53.33 
 
 
1937 aa  1058    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5393  GAF sensor hybrid histidine kinase  51.7 
 
 
2099 aa  998    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0480029  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3493  GAF sensor hybrid histidine kinase  53.31 
 
 
1782 aa  1055    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0298684  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1053  GAF sensor hybrid histidine kinase  55.49 
 
 
1458 aa  1138    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4696  GAF sensor hybrid histidine kinase  54.11 
 
 
1917 aa  1125    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257042  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6353  GAF sensor hybrid histidine kinase  52.43 
 
 
1839 aa  1001    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6993  GAF sensor hybrid histidine kinase  60.2 
 
 
1159 aa  1260    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.922616  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4122  GAF sensor hybrid histidine kinase  53.44 
 
 
1853 aa  1080    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4049  GAF sensor hybrid histidine kinase  61.56 
 
 
1406 aa  1067    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4316  sensor histidine kinase  52.86 
 
 
1695 aa  1018    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.946527 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5091  GAF sensor hybrid histidine kinase  59.67 
 
 
1479 aa  1234    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.493325  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0401  sensor histidine kinase/response regulator  62.57 
 
 
1392 aa  1318    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0144  GAF sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
1119 aa  2251    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6441  GAF sensor hybrid histidine kinase  53.43 
 
 
1937 aa  1048    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4276  GAF sensor hybrid histidine kinase  53.85 
 
 
1847 aa  1081    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0325  GAF sensor hybrid histidine kinase  52.11 
 
 
2037 aa  1038    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4103  ATPase domain-containing protein  57.79 
 
 
1179 aa  1152    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.972573  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4253  GAF sensor hybrid histidine kinase  53.87 
 
 
1843 aa  1080    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0540  GAF sensor hybrid histidine kinase  56.36 
 
 
1816 aa  1084    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.46685  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2473  GAF sensor hybrid histidine kinase  50.96 
 
 
1792 aa  963    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.443525 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5629  GAF sensor hybrid histidine kinase  53.53 
 
 
2010 aa  1072    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.117507 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3210  GAF sensor hybrid histidine kinase  53.15 
 
 
1936 aa  1058    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596339  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  53.17 
 
 
1964 aa  1065    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.370442 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1671  histidine kinase  53.33 
 
 
1937 aa  1058    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2180  GAF sensor hybrid histidine kinase  44.33 
 
 
922 aa  608  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.238731  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3009  GAF sensor hybrid histidine kinase  42.23 
 
 
920 aa  567  1e-160  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.59521  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1267  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.74 
 
 
916 aa  568  1e-160  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4229  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.9 
 
 
1150 aa  550  1e-155  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4779  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.85 
 
 
1195 aa  534  1e-150  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.133558  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3894  putative sensor histidine kinase  68.47 
 
 
590 aa  529  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04479  Histidine kinase J7 [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6WJ24]  60.38 
 
 
1297 aa  502  1e-140  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.930158  normal  0.687649 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03340  protein-histidine kinase, putative  60.36 
 
 
1390 aa  494  9.999999999999999e-139  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.205996  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1163  sensor histidine kinase/response regulator  37.31 
 
 
896 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0917  sensor histidine kinase  36.9 
 
 
896 aa  491  1e-137  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1090  sensor histidine kinase/response regulator  36.73 
 
 
896 aa  489  1e-136  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.358618  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1037  sensor histidine kinase/response regulator  37.26 
 
 
896 aa  489  1e-136  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0932  sensor histidine kinase/response regulator  36.64 
 
 
896 aa  485  1e-135  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0900  sensor histidine kinase  36.73 
 
 
896 aa  484  1e-135  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4266  sensor histidine kinase/response regulator  36.81 
 
 
896 aa  483  1e-135  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000252034 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0996  sensor histidine kinase/response regulator  36.64 
 
 
896 aa  485  1e-135  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1072  sensor histidine kinase/response regulator  36.71 
 
 
896 aa  482  1e-134  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.88167e-43 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0907  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.62 
 
 
896 aa  480  1e-134  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3786  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.84 
 
 
1155 aa  469  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73542  histidine kinase osmosensor  58.49 
 
 
1118 aa  468  9.999999999999999e-131  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1960  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.35 
 
 
1680 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.0344276 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2642  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.96 
 
 
1216 aa  414  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.974276  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1961  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.95 
 
 
1713 aa  413  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.280335  normal  0.123564 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0587  ATP-binding region ATPase domain protein  34.82 
 
 
1161 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3719  sensor histidine kinase  33.57 
 
 
1278 aa  398  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5566  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.15 
 
 
1203 aa  394  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0247633 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2646  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.84 
 
 
1163 aa  395  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2445  response regulator receiver  34.41 
 
 
1172 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00053345 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.04 
 
 
1155 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0169  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.97 
 
 
1168 aa  392  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3761  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.26 
 
 
1155 aa  389  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.358181  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2002  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.12 
 
 
1155 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00831305 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0393  histidine kinase  33.79 
 
 
1200 aa  386  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.564913 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2712  sensor histidine kinase/response regulator  35.41 
 
 
1170 aa  382  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340753  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2587  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.21 
 
 
1158 aa  380  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2080  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein  33.53 
 
 
1158 aa  381  1e-104  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.264996 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1035  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.37 
 
 
1201 aa  378  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2142  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.35 
 
 
1149 aa  379  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.694825  hitchhiker  0.00121197 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9103  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.38 
 
 
1145 aa  377  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1942  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.83 
 
 
1038 aa  379  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0626  histidine kinase  35.66 
 
 
1137 aa  377  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0022  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.28 
 
 
1356 aa  375  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5353  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.18 
 
 
1143 aa  372  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.385348 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.01 
 
 
1165 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.985282 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1215  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  45.22 
 
 
944 aa  367  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.960151  normal  0.101285 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.32 
 
 
1137 aa  364  5.0000000000000005e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1073  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.76 
 
 
1158 aa  363  7.0000000000000005e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00830683  normal  0.406928 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1031  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.56 
 
 
1131 aa  363  7.0000000000000005e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.768055  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3996  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.58 
 
 
1159 aa  363  1e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374046  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3831  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.5 
 
 
1177 aa  360  9.999999999999999e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195944  normal  0.0220401 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5390  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.06 
 
 
1195 aa  359  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.596605  hitchhiker  0.00757911 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1216  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.65 
 
 
1194 aa  357  8.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.469894 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4784  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.85 
 
 
1141 aa  355  2e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1648  histidine kinase  31.67 
 
 
1374 aa  351  5e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.102759  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4386  histidine kinase  48.75 
 
 
411 aa  350  8e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4248  ATP-binding region ATPase domain protein  31.78 
 
 
1196 aa  348  3e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2257  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.29 
 
 
1162 aa  348  4e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3354  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.69 
 
 
1189 aa  337  7.999999999999999e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.426502  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2112  Cache sensor hybrid histidine kinase  31.44 
 
 
1361 aa  328  3e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1135  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.09 
 
 
1142 aa  323  1.9999999999999998e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0522922  normal  0.044499 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1000  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.57 
 
 
1161 aa  317  8e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>