More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1526 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1526  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 975 aa  1960    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0213  multi-sensor hybrid histidine kinase  82.17 
 
 		 974 aa  1570    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0934932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.78 
 
 		 858 aa  412  1e-113  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  44.12 
 
 		 970 aa  412  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  43.32 
 
 		 977 aa  391  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3764  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.78 
 
 		 917 aa  382  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.432635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2159  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.58 
 
 		 796 aa  380  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.758044 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3699  histidine kinase  40.77 
 
 		 998 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.84 
 
 		 687 aa  369  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3446  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.07 
 
 		 791 aa  362  2e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285515  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2672  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.57 
 
 		 991 aa  358  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.646953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  42.05 
 
 		 1361 aa  357  5.999999999999999e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3876  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.74 
 
 		 1022 aa  356  8.999999999999999e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.32 
 
 		 1362 aa  355  2e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4734  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.13 
 
 		 798 aa  355  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00660973 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1705  histidine kinase  39.81 
 
 		 910 aa  353  8e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  35 
 
 		 823 aa  350  7e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4217  PAS sensor protein  41.67 
 
 		 792 aa  346  1e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.423052  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4587  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.67 
 
 		 803 aa  346  2e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0699795  normal  0.0670662 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  37.16 
 
 		 1046 aa  339  1.9999999999999998e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.16 
 
 		 1003 aa  339  1.9999999999999998e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.284418 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2805  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.25 
 
 		 927 aa  335  3e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2143  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.2 
 
 		 755 aa  323  7e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3558  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.09 
 
 		 984 aa  320  7.999999999999999e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.299477 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.05 
 
 		 1271 aa  318  2e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0022  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.42 
 
 		 1356 aa  305  3.0000000000000004e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4779  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.95 
 
 		 1195 aa  301  4e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.133558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5353  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.2 
 
 		 1143 aa  300  1e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.385348 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9103  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.72 
 
 		 1145 aa  294  5e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4696  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.76 
 
 		 1917 aa  293  8e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4784  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.28 
 
 		 1141 aa  291  3e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1989  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.17 
 
 		 1937 aa  291  4e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1671  histidine kinase  36.64 
 
 		 1937 aa  290  1e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4316  sensor histidine kinase  35.89 
 
 		 1695 aa  288  2.9999999999999996e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.946527 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1555  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.92 
 
 		 1172 aa  288  4e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0698206 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5566  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.66 
 
 		 1203 aa  288  5e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0247633 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3210  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.78 
 
 		 1936 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1035  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.83 
 
 		 1201 aa  285  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6353  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.05 
 
 		 1839 aa  283  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1960  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.86 
 
 		 1680 aa  283  1e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.0344276 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.01 
 
 		 1954 aa  281  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2587  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.68 
 
 		 1158 aa  281  4e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2076  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.85 
 
 		 2107 aa  280  9e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2080  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein  34.94 
 
 		 1158 aa  280  1e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.264996 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1961  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.19 
 
 		 1713 aa  279  1e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.280335  normal  0.123564 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1136  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.55 
 
 		 1896 aa  279  2e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270239  normal  0.51439 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2002  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.63 
 
 		 1155 aa  279  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00831305 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1942  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.51 
 
 		 1038 aa  279  2e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.91 
 
 		 1165 aa  278  3e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.985282 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0169  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.83 
 
 		 1168 aa  278  3e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3761  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.44 
 
 		 1155 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.358181  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.1 
 
 		 1090 aa  276  1.0000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5109  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 		 2099 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0669819 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.24 
 
 		 1155 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.22 
 
 		 1267 aa  274  7e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2142  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.06 
 
 		 1149 aa  273  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.694825  hitchhiker  0.00121197 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0626  histidine kinase  35.06 
 
 		 1137 aa  273  1e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2646  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.41 
 
 		 1163 aa  272  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3493  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.67 
 
 		 1782 aa  272  2e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0298684  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6441  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.91 
 
 		 1937 aa  271  4e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1464  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.98 
 
 		 1135 aa  271  4e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.396763 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.44 
 
 		 2213 aa  271  4e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.88 
 
 		 1137 aa  271  5e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3786  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.21 
 
 		 1155 aa  270  8.999999999999999e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.41 
 
 		 1352 aa  270  8.999999999999999e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5393  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.08 
 
 		 2099 aa  270  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0480029  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0587  ATP-binding region ATPase domain protein  34.49 
 
 		 1161 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1135  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.58 
 
 		 1142 aa  266  1e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0522922  normal  0.044499 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2712  sensor histidine kinase/response regulator  35.35 
 
 		 1170 aa  265  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340753  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3831  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.34 
 
 		 1177 aa  265  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195944  normal  0.0220401 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3996  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.28 
 
 		 1159 aa  265  4e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2445  response regulator receiver  34.87 
 
 		 1172 aa  264  6.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00053345 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4240  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.27 
 
 		 1064 aa  263  8e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0393  histidine kinase  31.92 
 
 		 1200 aa  263  1e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.564913 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.92 
 
 		 1002 aa  262  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1082  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.5 
 
 		 1068 aa  262  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31862 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.65 
 
 		 1398 aa  262  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3719  sensor histidine kinase  32.28 
 
 		 1278 aa  263  2e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3174  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.93 
 
 		 1087 aa  260  7e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134389 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1000  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.58 
 
 		 1161 aa  261  7e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4248  ATP-binding region ATPase domain protein  32.39 
 
 		 1196 aa  261  7e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.98 
 
 		 1326 aa  259  1e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2502  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.21 
 
 		 957 aa  260  1e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000217317 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1977  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.12 
 
 		 1072 aa  259  1e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732577  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.5 
 
 		 1397 aa  259  2e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1216  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.04 
 
 		 1194 aa  259  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.469894 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3354  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.65 
 
 		 1189 aa  259  2e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.426502  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.62 
 
 		 1284 aa  258  4e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0401  sensor histidine kinase/response regulator  37.55 
 
 		 1392 aa  257  8e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.69 
 
 		 1964 aa  257  9e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.370442 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0325  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.22 
 
 		 2037 aa  256  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.94 
 
 		 833 aa  252  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0803  histidine kinase  36.55 
 
 		 718 aa  251  3e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0571523  hitchhiker  0.00843936 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3648  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.56 
 
 		 1237 aa  252  3e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.289797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.13 
 
 		 1305 aa  251  5e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.33 
 
 		 1622 aa  251  6e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3548  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.67 
 
 		 1942 aa  251  7e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1648  histidine kinase  32.35 
 
 		 1374 aa  250  9e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.102759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5091  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.28 
 
 		 1479 aa  249  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.493325  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3612  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.45 
 
 		 770 aa  249  1e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.019984 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>