More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3876 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  67.13 
 
 		 1003 aa  1325    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.284418 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3876  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 1022 aa  2068    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.82 
 
 		 858 aa  410  1e-113  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2159  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.46 
 
 		 796 aa  404  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.758044 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  42 
 
 		 977 aa  399  1e-109  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2672  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.94 
 
 		 991 aa  399  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.646953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4734  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.77 
 
 		 798 aa  396  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00660973 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1705  histidine kinase  41.42 
 
 		 910 aa  395  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  41.76 
 
 		 970 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3699  histidine kinase  40.68 
 
 		 998 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  28.6 
 
 		 1046 aa  387  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4587  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.7 
 
 		 803 aa  385  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0699795  normal  0.0670662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4217  PAS sensor protein  38.54 
 
 		 792 aa  382  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.423052  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3764  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.14 
 
 		 917 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.432635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3446  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.14 
 
 		 791 aa  362  2e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285515  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3558  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.6 
 
 		 984 aa  354  5e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.299477 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2805  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.23 
 
 		 927 aa  346  1e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0213  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.29 
 
 		 974 aa  346  1e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0934932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1526  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.17 
 
 		 975 aa  342  2e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.4 
 
 		 823 aa  332  2e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  37.03 
 
 		 1361 aa  330  8e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.94 
 
 		 1362 aa  328  4.0000000000000003e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3007  two component system histidine kinase  30.96 
 
 		 729 aa  322  3e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0422303  hitchhiker  0.00299589 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.78 
 
 		 1271 aa  322  3e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.52 
 
 		 687 aa  313  7.999999999999999e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4696  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.5 
 
 		 1917 aa  302  2e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.63 
 
 		 1363 aa  300  7e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.63 
 
 		 767 aa  294  5e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1555  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.21 
 
 		 1172 aa  286  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0698206 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3786  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.28 
 
 		 1155 aa  279  2e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4779  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.51 
 
 		 1195 aa  276  1.0000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.133558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5353  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.54 
 
 		 1143 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.385348 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0022  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.8 
 
 		 1356 aa  275  4.0000000000000004e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.4 
 
 		 1326 aa  274  5.000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.01 
 
 		 940 aa  273  1e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 		 738 aa  273  1e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1648  histidine kinase  33.45 
 
 		 1374 aa  272  2.9999999999999997e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.102759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3648  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.39 
 
 		 1237 aa  272  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.289797  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5109  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.39 
 
 		 2099 aa  271  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0669819 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.81 
 
 		 1352 aa  270  7e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2143  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.99 
 
 		 755 aa  270  1e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.74 
 
 		 1954 aa  268  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1989  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.4 
 
 		 1937 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1671  histidine kinase  35.04 
 
 		 1937 aa  268  4e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.83 
 
 		 2213 aa  265  2e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  33.38 
 
 		 1763 aa  266  2e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3210  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.79 
 
 		 1936 aa  265  3e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4316  sensor histidine kinase  33.04 
 
 		 1695 aa  265  4e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.946527 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.01 
 
 		 1267 aa  265  4e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2587  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.21 
 
 		 1158 aa  264  8e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5393  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.81 
 
 		 2099 aa  263  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0480029  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.52 
 
 		 881 aa  263  1e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2142  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.52 
 
 		 1149 aa  263  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.694825  hitchhiker  0.00121197 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4248  ATP-binding region ATPase domain protein  32.29 
 
 		 1196 aa  263  2e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2646  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.69 
 
 		 1163 aa  262  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6353  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.42 
 
 		 1839 aa  263  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3761  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.65 
 
 		 1155 aa  262  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.358181  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1960  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.52 
 
 		 1680 aa  262  3e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.0344276 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2642  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.62 
 
 		 1216 aa  261  5.0000000000000005e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.974276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1942  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.11 
 
 		 1038 aa  260  9e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2002  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.46 
 
 		 1155 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00831305 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.42 
 
 		 1199 aa  259  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0141  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.44 
 
 		 778 aa  259  3e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.3 
 
 		 785 aa  258  3e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3719  sensor histidine kinase  31.2 
 
 		 1278 aa  258  3e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.96 
 
 		 1548 aa  258  5e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.65 
 
 		 870 aa  257  7e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.27 
 
 		 1165 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.985282 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.21 
 
 		 1155 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1083  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.03 
 
 		 887 aa  255  2.0000000000000002e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.240403  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2628  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.64 
 
 		 902 aa  255  3e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3831  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.7 
 
 		 1177 aa  254  5.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195944  normal  0.0220401 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.67 
 
 		 1058 aa  254  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6441  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.26 
 
 		 1937 aa  253  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0169  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.26 
 
 		 1168 aa  253  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1961  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.13 
 
 		 1713 aa  253  1e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.280335  normal  0.123564 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.2 
 
 		 1767 aa  253  1e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.34 
 
 		 1768 aa  252  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1035  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.73 
 
 		 1201 aa  252  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5573  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.99 
 
 		 1203 aa  253  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.805596  normal  0.315829 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0185  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.32 
 
 		 1214 aa  253  2e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467777  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.59 
 
 		 1765 aa  252  3e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  37.31 
 
 		 1407 aa  251  4e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2445  response regulator receiver  32.78 
 
 		 1172 aa  251  5e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00053345 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3493  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.03 
 
 		 1782 aa  251  5e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0298684  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  33.23 
 
 		 1135 aa  251  5e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.73 
 
 		 1767 aa  251  6e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.73 
 
 		 1767 aa  251  6e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0587  ATP-binding region ATPase domain protein  30.64 
 
 		 1161 aa  251  7e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2712  sensor histidine kinase/response regulator  33.77 
 
 		 1170 aa  250  8e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340753  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0118  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.14 
 
 		 1927 aa  250  8e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.125924 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.14 
 
 		 933 aa  250  8e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  0.0000359369 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.36 
 
 		 882 aa  249  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  33.46 
 
 		 982 aa  249  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0401  sensor histidine kinase/response regulator  37.67 
 
 		 1392 aa  249  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2718  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.62 
 
 		 1255 aa  249  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403107 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.91 
 
 		 989 aa  249  3e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.24 
 
 		 1310 aa  249  3e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.82 
 
 		 1238 aa  248  4e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1136  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.23 
 
 		 1896 aa  248  4e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270239  normal  0.51439 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>