More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0560 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 940 aa  1936    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0599  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.31 
 
 		 957 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.53 
 
 		 881 aa  487  1e-136  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1722  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.46 
 
 		 1007 aa  464  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.608863  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.61 
 
 		 995 aa  449  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.78 
 
 		 738 aa  442  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0559  multi-sensor hybrid histidine kinase  55.67 
 
 		 704 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.11 
 
 		 767 aa  428  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3113  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.75 
 
 		 898 aa  420  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.265974  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0562  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  48.2 
 
 		 743 aa  410  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0578  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  50.12 
 
 		 667 aa  404  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0558  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.15 
 
 		 893 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.843554  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2684  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  49.88 
 
 		 645 aa  391  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0566  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  44.83 
 
 		 1193 aa  387  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  38.46 
 
 		 982 aa  381  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2682  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  50 
 
 		 827 aa  379  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.616307  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.62 
 
 		 896 aa  373  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0361  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.88 
 
 		 647 aa  374  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00025473 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.88 
 
 		 647 aa  372  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  47.42 
 
 		 882 aa  371  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0107  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.6 
 
 		 774 aa  371  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1051  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.72 
 
 		 862 aa  367  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0565  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.33 
 
 		 947 aa  367  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1285  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  37.06 
 
 		 772 aa  360  6e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2532  histidine kinase  47.18 
 
 		 399 aa  356  1e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0679268  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  30.87 
 
 		 2035 aa  355  2e-96  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0191  histidine kinase  45.91 
 
 		 666 aa  348  3e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.49 
 
 		 1078 aa  343  8e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.86 
 
 		 1055 aa  341  5e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.08 
 
 		 1287 aa  340  5e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.51 
 
 		 1177 aa  339  9.999999999999999e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.35 
 
 		 1069 aa  339  1.9999999999999998e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1424  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 		 1050 aa  337  5e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.4662  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0564  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.43 
 
 		 627 aa  337  5e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.211254  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1227  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.34 
 
 		 1229 aa  335  2e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1409  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.96 
 
 		 778 aa  333  8e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.44 
 
 		 882 aa  333  9e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.43 
 
 		 902 aa  332  1e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3872  PAS  37.43 
 
 		 853 aa  332  2e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  44.36 
 
 		 717 aa  331  4e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.69 
 
 		 763 aa  331  4e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  37.64 
 
 		 1560 aa  330  6e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  32.33 
 
 		 823 aa  330  6e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3686  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  44.58 
 
 		 620 aa  329  2.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.926172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.75 
 
 		 1313 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2003  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.36 
 
 		 1109 aa  328  3e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.86 
 
 		 765 aa  327  6e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.52 
 
 		 1044 aa  327  9e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227424  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.49 
 
 		 1075 aa  325  2e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1360  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.45 
 
 		 974 aa  325  2e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1353  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.14 
 
 		 1029 aa  324  4e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283316  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.89 
 
 		 916 aa  323  7e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.02 
 
 		 969 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3722  ATP-binding region, ATPase-like protein  33.86 
 
 		 1120 aa  322  3e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.58 
 
 		 1116 aa  320  5e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.96 
 
 		 1127 aa  320  1e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1426  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.65 
 
 		 1079 aa  318  2e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.688315  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.3 
 
 		 939 aa  318  4e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.660448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2934  PAS  36.11 
 
 		 955 aa  317  8e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000914767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.42 
 
 		 973 aa  316  9.999999999999999e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0664  ATP-binding region, ATPase-like protein  43.03 
 
 		 853 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0831  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.01 
 
 		 957 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2784  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.13 
 
 		 1222 aa  314  3.9999999999999997e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0520121 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0244  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.55 
 
 		 1066 aa  314  5.999999999999999e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.74 
 
 		 674 aa  313  7.999999999999999e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.86 
 
 		 785 aa  313  1e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.78 
 
 		 982 aa  312  1e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.288363 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.28 
 
 		 1363 aa  313  1e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.68 
 
 		 1199 aa  313  1e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2957  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.78 
 
 		 810 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0811  Hpt sensor hybrid histidine kinase  44.33 
 
 		 724 aa  310  5.9999999999999995e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1570  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.08 
 
 		 1039 aa  310  8e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.184468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4006  histidine kinase  42.27 
 
 		 736 aa  310  9e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155316  hitchhiker  0.00128379 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3110  putative integral membrane sensor protein  34.42 
 
 		 1141 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0940316 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1087  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.9 
 
 		 1121 aa  309  1.0000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.740067  hitchhiker  0.00000751372 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4002  sensory transduction histidine kinase  30.47 
 
 		 1689 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2628  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.73 
 
 		 902 aa  309  2.0000000000000002e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2929  histidine kinase  43.14 
 
 		 606 aa  309  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.03 
 
 		 1369 aa  309  2.0000000000000002e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2946  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.02 
 
 		 1303 aa  308  4.0000000000000004e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 		 1358 aa  307  5.0000000000000004e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.117306 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.5 
 
 		 863 aa  307  5.0000000000000004e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0981  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.86 
 
 		 1791 aa  307  6e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3450  Hpt sensor hybrid histidine kinase  43.38 
 
 		 718 aa  306  1.0000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000325842 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2187  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.59 
 
 		 705 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3277  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  42.75 
 
 		 741 aa  306  2.0000000000000002e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.81 
 
 		 1767 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.81 
 
 		 1767 aa  306  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1251  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.2 
 
 		 1101 aa  305  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000252838 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0342  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.25 
 
 		 827 aa  305  3.0000000000000004e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0480  putative PAS/PAC sensor protein  29.81 
 
 		 1686 aa  304  5.000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2504  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.29 
 
 		 1132 aa  304  5.000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43670  putative sensor/response regulator hybrid  43.84 
 
 		 651 aa  304  6.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1982  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.09 
 
 		 1058 aa  303  7.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  43.18 
 
 		 661 aa  303  7.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25170  hybrid histidine kinase  42.99 
 
 		 642 aa  303  7.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2483  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.45 
 
 		 1071 aa  303  7.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1642  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.52 
 
 		 1131 aa  303  1e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0330659  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2847  PAS  39.87 
 
 		 764 aa  301  3e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.445085  normal  0.0351705 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2468  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.56 
 
 		 631 aa  301  3e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633599  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>