More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1360 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2986  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.73 
 
 		 1228 aa  676    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.387618 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1360  GAF sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 974 aa  1997    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0820  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.33 
 
 		 1001 aa  775    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.11 
 
 		 896 aa  343  1e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  40.95 
 
 		 982 aa  331  4e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.38 
 
 		 1442 aa  330  7e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  47.2 
 
 		 661 aa  327  8.000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.31 
 
 		 940 aa  323  9.000000000000001e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.8 
 
 		 827 aa  313  1e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3450  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.77 
 
 		 718 aa  313  1e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000325842 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3051  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.19 
 
 		 947 aa  312  2e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 		 1433 aa  311  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1199  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.15 
 
 		 962 aa  311  4e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.77 
 
 		 995 aa  310  9e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0811  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.17 
 
 		 724 aa  309  2.0000000000000002e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4006  histidine kinase  41.67 
 
 		 736 aa  308  3e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155316  hitchhiker  0.00128379 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.99 
 
 		 881 aa  307  5.0000000000000004e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0577  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.76 
 
 		 1005 aa  306  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0920445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.9 
 
 		 1398 aa  306  1.0000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1302  sensor histidine kinase/response regulator  40.27 
 
 		 835 aa  305  3.0000000000000004e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.924984  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.25 
 
 		 1078 aa  305  3.0000000000000004e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1277  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.75 
 
 		 969 aa  305  3.0000000000000004e-81  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.16 
 
 		 902 aa  304  5.000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.81 
 
 		 1397 aa  304  6.000000000000001e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.43 
 
 		 763 aa  304  6.000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0981  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.6 
 
 		 1791 aa  304  6.000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1093  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.33 
 
 		 1721 aa  300  8e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0057  histidine kinase  42.62 
 
 		 588 aa  299  2e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000185994 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0065  histidine kinase  42.13 
 
 		 578 aa  298  3e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1522  histidine kinase  44.13 
 
 		 544 aa  297  8e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1697  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  43.81 
 
 		 907 aa  296  1e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.28 
 
 		 863 aa  295  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0578  histidine kinase  35.91 
 
 		 732 aa  295  3e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3925  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.46 
 
 		 662 aa  294  4e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.150145  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.6 
 
 		 846 aa  294  7e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0191  histidine kinase  44.39 
 
 		 666 aa  293  1e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0387  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.44 
 
 		 1068 aa  293  1e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2929  histidine kinase  40.69 
 
 		 606 aa  293  1e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.25 
 
 		 1055 aa  293  1e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.89 
 
 		 1287 aa  292  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1644  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 789 aa  292  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.841521  normal  0.594738 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.12 
 
 		 939 aa  292  2e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.660448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2101  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.6 
 
 		 678 aa  292  2e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.007905  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.5 
 
 		 785 aa  292  2e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.1 
 
 		 1195 aa  292  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0831  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.61 
 
 		 957 aa  291  3e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0342  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.9 
 
 		 827 aa  291  4e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0915  Hpt sensor hybrid histidine kinase  40.99 
 
 		 822 aa  291  4e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0599  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.37 
 
 		 957 aa  291  6e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.37 
 
 		 676 aa  289  1e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00629905  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.82 
 
 		 1313 aa  290  1e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0664  ATP-binding region, ATPase-like protein  41.35 
 
 		 853 aa  290  1e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3113  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.22 
 
 		 898 aa  289  2e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.265974  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2168  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  44.19 
 
 		 1204 aa  289  2e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172741 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.81 
 
 		 791 aa  289  2e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108732  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1051  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.56 
 
 		 862 aa  288  2.9999999999999996e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.62 
 
 		 982 aa  287  7e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.288363 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3416  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.19 
 
 		 878 aa  287  7e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1628  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.54 
 
 		 1070 aa  287  7e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1770  histidine kinase  42.47 
 
 		 742 aa  287  8e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0566  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  40.5 
 
 		 1193 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  43.56 
 
 		 717 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2682  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.78 
 
 		 827 aa  286  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.616307  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.53 
 
 		 1127 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3089  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein  36.09 
 
 		 856 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.82 
 
 		 1177 aa  285  2.0000000000000002e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0370  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.95 
 
 		 1070 aa  285  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1794  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.88 
 
 		 965 aa  285  3.0000000000000004e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0332193  normal  0.80092 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1582  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.52 
 
 		 788 aa  285  3.0000000000000004e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0318  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.2 
 
 		 1223 aa  284  5.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.455432  normal  0.438074 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2628  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.77 
 
 		 902 aa  284  6.000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0562  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.4 
 
 		 743 aa  284  6.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.53 
 
 		 1350 aa  283  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.45 
 
 		 882 aa  283  1e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5292  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.77 
 
 		 524 aa  283  1e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0559  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.42 
 
 		 704 aa  283  1e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2693  histidine kinase  40.37 
 
 		 571 aa  282  2e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0909214 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2895  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.14 
 
 		 1324 aa  282  2e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.00000343468  normal  0.0609683 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.27 
 
 		 932 aa  282  2e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.12 
 
 		 738 aa  282  3e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.12 
 
 		 1199 aa  281  4e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.55 
 
 		 767 aa  280  7e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3030  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.32 
 
 		 1596 aa  280  7e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010791 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1879  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.36 
 
 		 604 aa  280  9e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.28 
 
 		 973 aa  280  9e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  36.25 
 
 		 968 aa  280  1e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0564  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.3 
 
 		 627 aa  280  1e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.211254  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.71 
 
 		 1452 aa  280  1e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3722  ATP-binding region, ATPase-like protein  42.12 
 
 		 1120 aa  280  1e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.32 
 
 		 1363 aa  280  1e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.72 
 
 		 764 aa  279  1e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1722  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.41 
 
 		 1007 aa  279  2e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.608863  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1601  GAF sensor hybrid histidine kinase  42.04 
 
 		 685 aa  279  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0518398  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.6 
 
 		 916 aa  278  3e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3528  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.22 
 
 		 690 aa  278  3e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.148332  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  36.65 
 
 		 1885 aa  278  4e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0578  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.2 
 
 		 667 aa  278  4e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 		 868 aa  278  4e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.766824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3346  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.14 
 
 		 781 aa  278  4e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.570391  normal  0.852351 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2265  histidine kinase  39.9 
 
 		 559 aa  278  5e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.592554  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>