More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3925 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3925  GAF sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 662 aa  1353    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.150145  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4243  GAF sensor hybrid histidine kinase  60.64 
 
 		 653 aa  814    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.506182  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0578  histidine kinase  42.16 
 
 		 732 aa  367  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4006  histidine kinase  40.21 
 
 		 736 aa  364  4e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155316  hitchhiker  0.00128379 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03205  histidine kinase response regulator hybrid protein  36.31 
 
 		 542 aa  332  1e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.132161  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.46 
 
 		 863 aa  331  3e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.83 
 
 		 868 aa  330  5.0000000000000004e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.766824  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  42.93 
 
 		 982 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2525  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.39 
 
 		 785 aa  315  9.999999999999999e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.985854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  45 
 
 		 544 aa  316  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  36.63 
 
 		 968 aa  315  1.9999999999999998e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  41.36 
 
 		 932 aa  315  1.9999999999999998e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.72 
 
 		 1313 aa  312  1e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1951  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.67 
 
 		 603 aa  312  2e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.63 
 
 		 939 aa  308  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.660448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2895  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.22 
 
 		 1324 aa  307  4.0000000000000004e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.00000343468  normal  0.0609683 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3051  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.62 
 
 		 947 aa  306  7e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3858  PAS sensor protein  45.41 
 
 		 797 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.08 
 
 		 1287 aa  303  6.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1342  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.39 
 
 		 944 aa  301  2e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0065  histidine kinase  41.95 
 
 		 578 aa  300  4e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1199  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.44 
 
 		 962 aa  298  2e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0057  histidine kinase  41.69 
 
 		 588 aa  298  3e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000185994 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0811  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.85 
 
 		 724 aa  298  3e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.81 
 
 		 902 aa  297  4e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.74 
 
 		 995 aa  296  7e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.45 
 
 		 1433 aa  296  9e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.72 
 
 		 882 aa  295  1e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.22 
 
 		 846 aa  295  2e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0876  response regulator receiver  40.26 
 
 		 526 aa  294  4e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183507 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  40.51 
 
 		 631 aa  293  6e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2168  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.38 
 
 		 1204 aa  292  1e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172741 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1360  GAF sensor hybrid histidine kinase  42.71 
 
 		 974 aa  292  1e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.45 
 
 		 1350 aa  292  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1644  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.7 
 
 		 789 aa  292  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.841521  normal  0.594738 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.53 
 
 		 765 aa  291  2e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.88 
 
 		 1195 aa  291  3e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0361  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.54 
 
 		 647 aa  290  6e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00025473 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1896  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 865 aa  290  6e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.47 
 
 		 647 aa  290  8e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0585  ATP-binding region ATPase domain protein  40.33 
 
 		 528 aa  288  2e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.215545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.15 
 
 		 969 aa  288  2e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  41.69 
 
 		 661 aa  288  2.9999999999999996e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3450  Hpt sensor hybrid histidine kinase  40.36 
 
 		 718 aa  287  4e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000325842 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.25 
 
 		 817 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2847  PAS  38.54 
 
 		 764 aa  286  7e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.445085  normal  0.0351705 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1639  histidine kinase  41.33 
 
 		 676 aa  286  9e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.576569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.91 
 
 		 1768 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1760  histidine kinase  40.93 
 
 		 671 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0981  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.08 
 
 		 1791 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.27 
 
 		 973 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2684  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.27 
 
 		 645 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1277  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.51 
 
 		 969 aa  284  4.0000000000000003e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.67 
 
 		 781 aa  284  4.0000000000000003e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3783  histidine kinase  38.16 
 
 		 737 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18481  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.24 
 
 		 1771 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.29 
 
 		 896 aa  283  9e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.09 
 
 		 1765 aa  282  1e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3416  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.21 
 
 		 878 aa  282  1e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0381  sensory box histidine kinase/response regulator  36.69 
 
 		 497 aa  282  1e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  37.47 
 
 		 1763 aa  282  1e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0578  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.95 
 
 		 667 aa  282  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4715  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.73 
 
 		 1350 aa  282  2e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.726459  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5292  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.69 
 
 		 524 aa  281  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.73 
 
 		 982 aa  281  3e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.288363 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.9 
 
 		 785 aa  281  3e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1522  histidine kinase  38.22 
 
 		 544 aa  280  4e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3242  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.27 
 
 		 1027 aa  281  4e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.073449  normal  0.0177381 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.88 
 
 		 874 aa  280  5e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  43.31 
 
 		 2213 aa  280  5e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1697  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 907 aa  280  6e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.84 
 
 		 764 aa  280  6e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0307  response regulator, histidine kinase  40.16 
 
 		 755 aa  280  7e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.12 
 
 		 1452 aa  280  7e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3089  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein  35.92 
 
 		 856 aa  280  7e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0562  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.4 
 
 		 743 aa  280  7e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.87 
 
 		 1127 aa  280  8e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3325  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.41 
 
 		 667 aa  279  1e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.92 
 
 		 1767 aa  279  1e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  40.16 
 
 		 882 aa  278  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0599  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.04 
 
 		 957 aa  278  2e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1873  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.73 
 
 		 923 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.689502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0370  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 1070 aa  278  3e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.67 
 
 		 1767 aa  277  3e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.67 
 
 		 1767 aa  278  3e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.08 
 
 		 1199 aa  277  4e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.8 
 
 		 969 aa  277  4e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6270  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.8 
 
 		 952 aa  276  6e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.988146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.47 
 
 		 984 aa  277  6e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279424  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2784  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.69 
 
 		 1222 aa  276  7e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0520121 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2682  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.3 
 
 		 827 aa  276  8e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.616307  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2456  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.05 
 
 		 1128 aa  276  8e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165433 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  36.41 
 
 		 1765 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0229  histidine kinase  41.04 
 
 		 724 aa  276  1.0000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0610831  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3846  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.52 
 
 		 860 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4037  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  39.1 
 
 		 659 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3000  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.03 
 
 		 968 aa  276  1.0000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3683  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.03 
 
 		 1124 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.781779 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3030  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.08 
 
 		 1596 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010791 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.3 
 
 		 1442 aa  275  2.0000000000000002e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>