More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1951 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1951  GAF sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
603 aa  1260    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3925  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.67 
 
 
662 aa  312  1e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.150145  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.12 
 
 
1199 aa  294  3e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4243  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.89 
 
 
653 aa  290  5.0000000000000004e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.506182  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  39.11 
 
 
968 aa  285  2.0000000000000002e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2468  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.55 
 
 
631 aa  281  3e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633599  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  37.39 
 
 
982 aa  278  3e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.62 
 
 
817 aa  276  6e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  40.19 
 
 
631 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43670  putative sensor/response regulator hybrid  39.66 
 
 
651 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  38.7 
 
 
651 aa  275  3e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2154  hypothetical protein  37.39 
 
 
786 aa  273  6e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0411448  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.76 
 
 
781 aa  273  9e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2021  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  38.88 
 
 
645 aa  272  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.798842  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.13 
 
 
932 aa  271  2e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4211  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.76 
 
 
633 aa  271  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79688  normal  0.233659 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.63 
 
 
1078 aa  270  5e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.61 
 
 
1055 aa  267  4e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.19 
 
 
827 aa  267  4e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.7 
 
 
896 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2693  histidine kinase  38.71 
 
 
571 aa  266  8.999999999999999e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0909214 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  36.94 
 
 
1028 aa  265  1e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.5 
 
 
940 aa  265  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.82 
 
 
1127 aa  266  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.1 
 
 
1195 aa  265  2e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0987  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.33 
 
 
846 aa  264  3e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.594505  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1464  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.94 
 
 
1135 aa  264  4e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.396763 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.53 
 
 
881 aa  264  4e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.2 
 
 
643 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0057  histidine kinase  39.71 
 
 
588 aa  261  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000185994 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0981  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.3 
 
 
1791 aa  261  2e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2847  PAS  37.28 
 
 
764 aa  261  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.445085  normal  0.0351705 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0181  multi-sensor hybrid histidine kinase  34 
 
 
837 aa  261  2e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.415169  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0715  histidine kinase  35.33 
 
 
553 aa  261  2e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.519915  normal  0.60104 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0599  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.61 
 
 
957 aa  261  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.44 
 
 
1075 aa  261  2e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  36.26 
 
 
661 aa  261  3e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1484  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.97 
 
 
1002 aa  261  3e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1511  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.97 
 
 
1002 aa  261  3e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4173  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.28 
 
 
643 aa  261  4e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3744  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.05 
 
 
643 aa  261  4e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2212  sensor histidine kinase/response regulator  37.24 
 
 
641 aa  260  6e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3496  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.67 
 
 
643 aa  259  7e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.05 
 
 
969 aa  259  8e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.44 
 
 
765 aa  259  8e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3000  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.01 
 
 
968 aa  259  9e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0065  histidine kinase  38.65 
 
 
578 aa  259  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.3 
 
 
863 aa  258  2e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0562  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.75 
 
 
743 aa  258  3e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2628  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.52 
 
 
902 aa  258  3e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2393  histidine kinase  37.59 
 
 
735 aa  258  3e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.774182  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4029  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.89 
 
 
835 aa  257  5e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.94 
 
 
1177 aa  256  7e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1560  response regulator, histidine kinase  35.49 
 
 
697 aa  255  1.0000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0213368  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0659  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.12 
 
 
570 aa  256  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.833549 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.58 
 
 
969 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1896  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.22 
 
 
865 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  35.6 
 
 
1023 aa  255  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.66 
 
 
1313 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.92 
 
 
1267 aa  254  3e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0565  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.32 
 
 
947 aa  254  3e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.85 
 
 
1433 aa  254  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3312  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 
1226 aa  254  4.0000000000000004e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0831  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.19 
 
 
957 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  37.83 
 
 
544 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.64 
 
 
882 aa  253  6e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1873  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.51 
 
 
923 aa  253  8.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.689502  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.32 
 
 
982 aa  253  1e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.288363 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2265  histidine kinase  38 
 
 
559 aa  252  1e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.592554  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2682  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.3 
 
 
827 aa  251  2e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.616307  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0191  histidine kinase  37.17 
 
 
666 aa  251  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2033  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.65 
 
 
866 aa  251  2e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2108  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.85 
 
 
924 aa  252  2e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.154995  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03166  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.97 
 
 
959 aa  251  2e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2544  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.3 
 
 
572 aa  251  2e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.05 
 
 
780 aa  251  2e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0387  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.71 
 
 
1068 aa  251  3e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.01 
 
 
785 aa  251  3e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.66 
 
 
1044 aa  251  4e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227424  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2929  histidine kinase  36.21 
 
 
606 aa  250  4e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.9 
 
 
676 aa  251  4e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00629905  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.46 
 
 
939 aa  251  4e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.660448  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1697  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.39 
 
 
907 aa  250  5e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.32 
 
 
738 aa  250  5e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1302  sensor histidine kinase/response regulator  37.11 
 
 
835 aa  250  6e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.924984  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.78 
 
 
1452 aa  250  6e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 
631 aa  250  6e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.45 
 
 
846 aa  249  8e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4006  histidine kinase  37.77 
 
 
736 aa  249  9e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155316  hitchhiker  0.00128379 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0566  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  33.4 
 
 
1193 aa  249  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4574  histidine kinase  35.56 
 
 
900 aa  249  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1722  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 
1007 aa  248  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.608863  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0811  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.34 
 
 
724 aa  248  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.71 
 
 
763 aa  248  2e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1251  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.95 
 
 
1101 aa  248  2e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000252838 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37 
 
 
791 aa  248  2e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108732  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.84 
 
 
984 aa  248  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279424  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.9 
 
 
1407 aa  248  3e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07038  histidine kinase  36.16 
 
 
641 aa  248  3e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3466  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.35 
 
 
1362 aa  248  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.185791  normal  0.474676 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>