More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0876 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0876  response regulator receiver  100 
 
 		 526 aa  1075    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183507 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2525  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.07 
 
 		 785 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.985854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4006  histidine kinase  41.56 
 
 		 736 aa  302  8.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155316  hitchhiker  0.00128379 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0578  histidine kinase  41.4 
 
 		 732 aa  299  1e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3925  GAF sensor hybrid histidine kinase  40.26 
 
 		 662 aa  294  3e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.150145  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.98 
 
 		 863 aa  291  2e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4243  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.1 
 
 		 653 aa  289  8e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.506182  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4224  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.27 
 
 		 877 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  40.62 
 
 		 982 aa  286  8e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4076  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.44 
 
 		 876 aa  286  8e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.16 
 
 		 1110 aa  282  1e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000219546 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1277  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.8 
 
 		 969 aa  281  1e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3528  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.19 
 
 		 690 aa  281  3e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.148332  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0562  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.6 
 
 		 743 aa  279  7e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.9 
 
 		 846 aa  278  2e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.75 
 
 		 763 aa  278  2e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2393  histidine kinase  40.53 
 
 		 735 aa  278  2e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.774182  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4904  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.18 
 
 		 873 aa  277  3e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.683005  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.82 
 
 		 785 aa  277  3e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.31 
 
 		 1287 aa  277  4e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2684  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.08 
 
 		 645 aa  277  4e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  38.81 
 
 		 631 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  33.33 
 
 		 651 aa  274  3e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1051  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.56 
 
 		 862 aa  274  3e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.03 
 
 		 995 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0065  histidine kinase  39.3 
 
 		 578 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.53 
 
 		 717 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43670  putative sensor/response regulator hybrid  33.85 
 
 		 651 aa  273  8.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4427  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.14 
 
 		 772 aa  272  9e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.84 
 
 		 868 aa  271  2.9999999999999997e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.766824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.97 
 
 		 1055 aa  270  4e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0578  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.05 
 
 		 667 aa  270  5e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.95 
 
 		 902 aa  270  5e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.16 
 
 		 940 aa  270  7e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.09 
 
 		 874 aa  269  7e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0057  histidine kinase  39.84 
 
 		 588 aa  268  1e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000185994 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4037  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  35.14 
 
 		 659 aa  269  1e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2468  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.79 
 
 		 631 aa  268  1e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1342  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.07 
 
 		 944 aa  269  1e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  37.11 
 
 		 631 aa  268  2e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3786  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.27 
 
 		 606 aa  268  2e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.95 
 
 		 781 aa  268  2e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07038  histidine kinase  34.9 
 
 		 641 aa  268  2e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  38.69 
 
 		 823 aa  268  2e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2101  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.36 
 
 		 678 aa  268  2e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.007905  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3686  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  33.82 
 
 		 620 aa  266  7e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.926172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0831  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.87 
 
 		 957 aa  266  7e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1760  histidine kinase  40.05 
 
 		 671 aa  265  1e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  37.44 
 
 		 1871 aa  265  1e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4211  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 		 633 aa  264  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79688  normal  0.233659 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  37.91 
 
 		 661 aa  265  2e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1355  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.53 
 
 		 895 aa  265  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3277  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.49 
 
 		 741 aa  265  2e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0981  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.17 
 
 		 1791 aa  265  2e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.92 
 
 		 1075 aa  265  2e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.38 
 
 		 932 aa  264  3e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0181  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.2 
 
 		 837 aa  263  4e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.415169  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1181  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.63 
 
 		 601 aa  264  4e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  37.47 
 
 		 1560 aa  264  4e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.06 
 
 		 1199 aa  263  4e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2168  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.74 
 
 		 1204 aa  263  4e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172741 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2682  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.67 
 
 		 827 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.616307  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3000  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.16 
 
 		 968 aa  263  4.999999999999999e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.31 
 
 		 827 aa  262  1e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2946  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  33.07 
 
 		 777 aa  261  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1409  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.2 
 
 		 778 aa  261  2e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0516  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.44 
 
 		 850 aa  261  3e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.377634 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.63 
 
 		 939 aa  261  3e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.660448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5761  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.93 
 
 		 1204 aa  260  4e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.122146 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1570  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.68 
 
 		 1039 aa  260  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.184468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2628  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.91 
 
 		 902 aa  260  6e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.75 
 
 		 1407 aa  259  7e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  37.19 
 
 		 544 aa  259  8e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.6 
 
 		 1127 aa  259  9e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1614  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.01 
 
 		 873 aa  259  1e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.499982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.4 
 
 		 817 aa  259  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.08 
 
 		 969 aa  259  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0387  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.95 
 
 		 1068 aa  259  1e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1464  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.18 
 
 		 1135 aa  258  2e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.396763 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  35.59 
 
 		 882 aa  258  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  36.95 
 
 		 1023 aa  258  2e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0370  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.27 
 
 		 1070 aa  258  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.72 
 
 		 1078 aa  258  2e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.19 
 
 		 1195 aa  257  3e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0191  histidine kinase  36.25 
 
 		 666 aa  257  3e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3466  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.92 
 
 		 1362 aa  258  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.185791  normal  0.474676 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.78 
 
 		 738 aa  257  3e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1934  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.26 
 
 		 1015 aa  257  4e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.452261  normal  0.114848 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2033  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.86 
 
 		 866 aa  257  4e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1522  histidine kinase  36.23 
 
 		 544 aa  256  6e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  35.24 
 
 		 1028 aa  256  8e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0743  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.48 
 
 		 869 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3051  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.58 
 
 		 947 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3312  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.28 
 
 		 1226 aa  256  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3872  PAS  35.82 
 
 		 853 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1449  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.18 
 
 		 945 aa  255  1.0000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0659  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.8 
 
 		 570 aa  255  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.833549 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1285  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  35.94 
 
 		 772 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5254  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.86 
 
 		 579 aa  254  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601488  normal  0.0228125 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1822  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  36.67 
 
 		 582 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.146561 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>