More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5761 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5761  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 1204 aa  2484    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.122146 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3312  multi-sensor hybrid histidine kinase  60.65 
 
 		 1226 aa  1479    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2784  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.39 
 
 		 1222 aa  1003    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0520121 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  34.8 
 
 		 982 aa  348  4e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1227  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.35 
 
 		 1229 aa  334  6e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.31 
 
 		 1195 aa  325  2e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  34.84 
 
 		 1023 aa  322  1.9999999999999998e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.09 
 
 		 882 aa  322  1.9999999999999998e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.3 
 
 		 1433 aa  320  7.999999999999999e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.44 
 
 		 1350 aa  320  1e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  34.7 
 
 		 968 aa  318  4e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.87 
 
 		 817 aa  317  8e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2628  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.82 
 
 		 902 aa  316  1.9999999999999998e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.18 
 
 		 1767 aa  315  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.18 
 
 		 1767 aa  315  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1342  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.64 
 
 		 944 aa  314  5.999999999999999e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.92 
 
 		 1452 aa  314  6.999999999999999e-84  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.24 
 
 		 812 aa  314  6.999999999999999e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0973  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.33 
 
 		 1064 aa  312  2.9999999999999997e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.11 
 
 		 1767 aa  312  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  34.01 
 
 		 1765 aa  310  1.0000000000000001e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.59 
 
 		 982 aa  310  1.0000000000000001e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.288363 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.38 
 
 		 1075 aa  309  2.0000000000000002e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.64 
 
 		 1326 aa  308  3e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.22 
 
 		 1369 aa  307  8.000000000000001e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  29.89 
 
 		 1560 aa  306  1.0000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3367  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.92 
 
 		 1059 aa  307  1.0000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.049018 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.54 
 
 		 1199 aa  305  4.0000000000000003e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.07 
 
 		 1287 aa  304  6.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.9 
 
 		 969 aa  304  8.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.01 
 
 		 1127 aa  303  9e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.89 
 
 		 1313 aa  303  9e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.92 
 
 		 932 aa  303  1e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0144  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.03 
 
 		 1009 aa  303  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162275  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3030  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.47 
 
 		 1596 aa  303  1e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010791 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  34.96 
 
 		 1763 aa  302  2e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.14 
 
 		 780 aa  302  3e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.42 
 
 		 1177 aa  300  8e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1794  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.16 
 
 		 965 aa  300  1e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0332193  normal  0.80092 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03166  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.96 
 
 		 959 aa  299  2e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.34 
 
 		 1363 aa  299  2e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2847  PAS  36.69 
 
 		 764 aa  299  2e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.445085  normal  0.0351705 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 		 1771 aa  298  3e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3242  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.77 
 
 		 1027 aa  297  1e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.073449  normal  0.0177381 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.69 
 
 		 1548 aa  296  2e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.9 
 
 		 1055 aa  296  2e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.99 
 
 		 902 aa  296  2e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5573  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 		 1203 aa  296  2e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.805596  normal  0.315829 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.57 
 
 		 939 aa  295  3e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.660448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.53 
 
 		 785 aa  295  4e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  35.71 
 
 		 1028 aa  295  5e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.99 
 
 		 916 aa  294  9e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1449  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.51 
 
 		 945 aa  293  1e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0831  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.1 
 
 		 957 aa  292  2e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.64 
 
 		 1069 aa  292  3e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.86 
 
 		 881 aa  291  4e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.66 
 
 		 1611 aa  291  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.94 
 
 		 896 aa  291  6e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.4 
 
 		 973 aa  291  6e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.98 
 
 		 874 aa  291  6e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1277  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.98 
 
 		 969 aa  290  9e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1349  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.57 
 
 		 1578 aa  290  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1722  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.38 
 
 		 1007 aa  290  1e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.608863  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.24 
 
 		 717 aa  289  2.9999999999999996e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.04 
 
 		 1611 aa  288  4e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  39.91 
 
 		 544 aa  288  4e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.27 
 
 		 1768 aa  288  4e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0599  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.81 
 
 		 957 aa  288  5e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  39.45 
 
 		 631 aa  287  7e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.26 
 
 		 940 aa  287  8e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.82 
 
 		 1765 aa  287  8e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3965  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.1 
 
 		 1158 aa  287  9e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.33 
 
 		 1622 aa  287  9e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0244  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.52 
 
 		 1066 aa  286  1.0000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3051  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.32 
 
 		 947 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.58 
 
 		 995 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1628  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.04 
 
 		 1070 aa  286  1.0000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0065  histidine kinase  40.9 
 
 		 578 aa  287  1.0000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0057  histidine kinase  40.69 
 
 		 588 aa  286  2.0000000000000002e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000185994 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.4 
 
 		 738 aa  286  2.0000000000000002e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0981  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.4 
 
 		 1791 aa  286  2.0000000000000002e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  33.15 
 
 		 882 aa  285  3.0000000000000004e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3872  PAS  30.55 
 
 		 853 aa  285  5.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0260  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.02 
 
 		 1287 aa  285  5.000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.579693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.78 
 
 		 984 aa  284  6.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279424  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.13 
 
 		 765 aa  284  7.000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2168  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.15 
 
 		 1204 aa  284  7.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172741 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2393  histidine kinase  43.01 
 
 		 735 aa  284  8.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.774182  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3821  Cache sensor hybrid histidine kinase  39.9 
 
 		 759 aa  283  1e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0769557 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1782 aa  283  1e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.15 
 
 		 763 aa  283  1e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.67 
 
 		 1784 aa  283  1e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0566  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  33.71 
 
 		 1193 aa  283  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.79 
 
 		 764 aa  282  3e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.44 
 
 		 767 aa  281  4e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1409  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.25 
 
 		 778 aa  281  4e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 		 631 aa  281  4e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1051  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.57 
 
 		 862 aa  281  4e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1896  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.98 
 
 		 865 aa  281  5e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.98 
 
 		 676 aa  281  5e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00629905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>