More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1051 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1051  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
862 aa  1752    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.72 
 
 
940 aa  367  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.07 
 
 
1055 aa  361  2e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  34.55 
 
 
982 aa  353  8.999999999999999e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.48 
 
 
676 aa  353  1e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00629905  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1982  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.58 
 
 
1058 aa  352  2e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.01 
 
 
738 aa  349  1e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.6 
 
 
1078 aa  343  7e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2628  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.25 
 
 
902 aa  342  2e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0831  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.9 
 
 
957 aa  334  5e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1409  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.27 
 
 
778 aa  333  6e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.43 
 
 
896 aa  333  7.000000000000001e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.88 
 
 
763 aa  329  1.0000000000000001e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1722  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.04 
 
 
1007 aa  329  2.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.608863  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.44 
 
 
785 aa  328  4.0000000000000003e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.47 
 
 
995 aa  327  9e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.34 
 
 
1069 aa  326  1e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1424  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.05 
 
 
1050 aa  325  2e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.4662  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0565  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.89 
 
 
947 aa  325  2e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2187  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.67 
 
 
705 aa  323  8e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0577  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.45 
 
 
1005 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0920445  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.47 
 
 
969 aa  322  1.9999999999999998e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.24 
 
 
969 aa  321  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2101  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.14 
 
 
678 aa  320  6e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.007905  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0599  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.12 
 
 
957 aa  320  7e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1251  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.63 
 
 
1101 aa  319  2e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000252838 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.13 
 
 
1369 aa  318  2e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.88 
 
 
767 aa  317  4e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1426  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.51 
 
 
1079 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.688315  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.42 
 
 
1044 aa  315  2.9999999999999996e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227424  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0566  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  37 
 
 
1193 aa  313  9e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0179  histidine kinase  44.78 
 
 
758 aa  311  2e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.2 
 
 
1075 aa  312  2e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0558  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.24 
 
 
893 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.843554  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.09 
 
 
973 aa  311  4e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0658  histidine kinase  44.56 
 
 
627 aa  311  4e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1770  histidine kinase  43.67 
 
 
742 aa  310  5.9999999999999995e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0743  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.11 
 
 
869 aa  309  1.0000000000000001e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.39 
 
 
1195 aa  310  1.0000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.24 
 
 
1313 aa  309  2.0000000000000002e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2033  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.45 
 
 
866 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3113  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.17 
 
 
898 aa  308  3e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.265974  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0181  multi-sensor hybrid histidine kinase  43 
 
 
837 aa  308  3e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.415169  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1628  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.64 
 
 
1070 aa  307  4.0000000000000004e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.4 
 
 
881 aa  308  4.0000000000000004e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1570  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.35 
 
 
1039 aa  307  6e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.184468  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.38 
 
 
1363 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0973  histidine kinase  44.91 
 
 
733 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000797186 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0331  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.83 
 
 
955 aa  304  5.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.383184 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.28 
 
 
1177 aa  303  9e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0562  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.35 
 
 
743 aa  303  1e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  36.88 
 
 
882 aa  301  3e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.72 
 
 
1199 aa  301  4e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2929  histidine kinase  42.03 
 
 
606 aa  301  5e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0987  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.75 
 
 
846 aa  300  6e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.594505  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.69 
 
 
1358 aa  300  6e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.117306 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1425  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.16 
 
 
1096 aa  300  8e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.579353  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0578  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43 
 
 
667 aa  299  1e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1413  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.39 
 
 
918 aa  299  1e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.28 
 
 
780 aa  300  1e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0392  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.07 
 
 
762 aa  298  2e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.5363 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2536  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.77 
 
 
801 aa  299  2e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.087707 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.9 
 
 
874 aa  299  2e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0387  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.75 
 
 
1068 aa  298  3e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.3 
 
 
674 aa  298  3e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  33.48 
 
 
823 aa  296  1e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.45 
 
 
1266 aa  295  2e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0634  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.85 
 
 
1000 aa  295  3e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.932649  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.69 
 
 
1433 aa  295  3e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1285  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  34.62 
 
 
772 aa  295  4e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1582  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.42 
 
 
788 aa  294  4e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2487  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.51 
 
 
1535 aa  293  7e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.162467  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.32 
 
 
882 aa  293  8e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.09 
 
 
902 aa  293  1e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  32.36 
 
 
1763 aa  293  1e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2483  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.1 
 
 
1071 aa  292  2e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0361  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 
647 aa  292  2e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00025473 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1642  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.34 
 
 
1131 aa  291  3e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0330659  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.51 
 
 
1548 aa  290  9e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.2 
 
 
916 aa  290  1e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2222  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.31 
 
 
1120 aa  289  1e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.201183 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1277  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.52 
 
 
969 aa  288  2.9999999999999996e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0559  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.32 
 
 
704 aa  287  5e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1227  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.91 
 
 
1229 aa  287  5e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.33 
 
 
647 aa  287  7e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1360  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.41 
 
 
974 aa  286  8e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.42 
 
 
791 aa  286  9e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108732  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.98 
 
 
846 aa  286  1.0000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0981  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.78 
 
 
1791 aa  286  1.0000000000000001e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3030  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.85 
 
 
1596 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010791 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  34.41 
 
 
1028 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0318  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.53 
 
 
1223 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.455432  normal  0.438074 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.59 
 
 
863 aa  284  4.0000000000000003e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1697  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  41.44 
 
 
907 aa  284  5.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3753  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.1 
 
 
913 aa  283  8.000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0468324  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2769  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.63 
 
 
773 aa  283  9e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1153  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.22 
 
 
1143 aa  283  9e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648529  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2468  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.31 
 
 
631 aa  283  1e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633599  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.66 
 
 
1452 aa  283  1e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03166  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.92 
 
 
959 aa  282  2e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>