More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1770 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1770  histidine kinase  100 
 
 
742 aa  1495    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0392  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.04 
 
 
762 aa  486  1e-136  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.5363 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2628  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.85 
 
 
902 aa  379  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0831  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.04 
 
 
957 aa  376  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50.89 
 
 
1055 aa  375  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1424  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  51.64 
 
 
1050 aa  370  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.4662  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1582  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.97 
 
 
788 aa  365  2e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2101  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  51.23 
 
 
678 aa  365  2e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.007905  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1426  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.47 
 
 
1079 aa  364  3e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.688315  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.06 
 
 
1078 aa  362  1e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.33 
 
 
676 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00629905  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2187  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.17 
 
 
705 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1409  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.46 
 
 
778 aa  351  3e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0577  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.85 
 
 
1005 aa  344  4e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0920445  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0743  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.07 
 
 
869 aa  343  8e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1251  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.06 
 
 
1101 aa  342  1e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000252838 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0181  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.82 
 
 
837 aa  342  2e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.415169  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1425  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.13 
 
 
1096 aa  337  3.9999999999999995e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.579353  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.94 
 
 
1044 aa  335  2e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227424  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1153  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.64 
 
 
1143 aa  334  3e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648529  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.91 
 
 
1358 aa  330  4e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.117306 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0634  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.57 
 
 
1000 aa  326  1e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.932649  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3821  Cache sensor hybrid histidine kinase  32.87 
 
 
759 aa  325  2e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0769557 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1628  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.45 
 
 
1070 aa  325  2e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  45.34 
 
 
882 aa  317  7e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1413  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.5 
 
 
918 aa  316  9.999999999999999e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1982  multi-sensor hybrid histidine kinase  52.11 
 
 
1058 aa  315  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0562  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.36 
 
 
743 aa  314  4.999999999999999e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2487  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  46.55 
 
 
1535 aa  311  2e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.162467  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1051  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.67 
 
 
862 aa  310  5.9999999999999995e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0973  histidine kinase  36.18 
 
 
733 aa  308  3e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000797186 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2021  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  39.67 
 
 
645 aa  307  6e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.798842  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2212  sensor histidine kinase/response regulator  38.96 
 
 
641 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1642  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.2 
 
 
1131 aa  306  1.0000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0330659  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.96 
 
 
785 aa  304  5.000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  39.77 
 
 
631 aa  301  2e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0565  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.51 
 
 
947 aa  300  7e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.42 
 
 
846 aa  299  1e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0718  sensory box histidine kinase/response regulator  41.9 
 
 
589 aa  298  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.97168  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0578  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.86 
 
 
667 aa  298  2e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2929  histidine kinase  43.83 
 
 
606 aa  297  6e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  38.33 
 
 
651 aa  296  9e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1570  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.19 
 
 
1039 aa  295  2e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.184468  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.67 
 
 
881 aa  295  3e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0191  histidine kinase  43.04 
 
 
666 aa  293  7e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.46 
 
 
1199 aa  292  1e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.95 
 
 
763 aa  291  2e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.2 
 
 
738 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0179  histidine kinase  39.64 
 
 
758 aa  290  7e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4006  histidine kinase  40.93 
 
 
736 aa  290  8e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155316  hitchhiker  0.00128379 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.42 
 
 
1055 aa  288  2e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  42.67 
 
 
982 aa  288  2e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0257  histidine kinase  43.84 
 
 
847 aa  289  2e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.952647  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.73 
 
 
932 aa  288  2e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3496  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.51 
 
 
643 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43670  putative sensor/response regulator hybrid  39.91 
 
 
651 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1722  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.04 
 
 
1007 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.608863  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.65 
 
 
1127 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0658  histidine kinase  40.25 
 
 
627 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1360  GAF sensor hybrid histidine kinase  43.08 
 
 
974 aa  285  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0120  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.33 
 
 
839 aa  284  4.0000000000000003e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.554495  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0331  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.58 
 
 
955 aa  284  4.0000000000000003e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.383184 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0318  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.65 
 
 
1223 aa  284  4.0000000000000003e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.455432  normal  0.438074 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3051  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.28 
 
 
947 aa  284  5.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0566  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  40.61 
 
 
1193 aa  284  5.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  42.46 
 
 
661 aa  283  6.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.77 
 
 
643 aa  283  1e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1199  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.36 
 
 
962 aa  283  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.67 
 
 
647 aa  283  1e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0361  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.51 
 
 
647 aa  282  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00025473 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2265  histidine kinase  42.34 
 
 
559 aa  282  2e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.592554  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1285  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  42.89 
 
 
772 aa  281  3e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.39 
 
 
1287 aa  281  3e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3367  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.84 
 
 
1059 aa  280  5e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.049018 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4173  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.77 
 
 
643 aa  280  6e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.06 
 
 
902 aa  280  7e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2784  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.12 
 
 
1222 aa  280  7e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0520121 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0578  histidine kinase  37 
 
 
732 aa  280  8e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2393  histidine kinase  42.06 
 
 
735 aa  279  2e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.774182  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4715  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.15 
 
 
1350 aa  278  2e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.726459  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0559  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.54 
 
 
704 aa  279  2e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2693  histidine kinase  43.1 
 
 
571 aa  279  2e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0909214 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.22 
 
 
817 aa  278  3e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.26 
 
 
1433 aa  278  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0064  histidine kinase  38.35 
 
 
598 aa  277  4e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.8 
 
 
767 aa  277  4e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2483  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.73 
 
 
1071 aa  277  6e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1277  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.13 
 
 
969 aa  276  8e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0981  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.82 
 
 
1791 aa  276  9e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5761  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.32 
 
 
1204 aa  276  1.0000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.122146 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3744  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.18 
 
 
643 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  42.31 
 
 
1028 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3312  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.3 
 
 
1226 aa  275  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3686  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  37.78 
 
 
620 aa  275  3e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.926172  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3786  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.55 
 
 
606 aa  275  3e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1560  response regulator, histidine kinase  36.58 
 
 
697 aa  275  3e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0213368  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0307  response regulator, histidine kinase  36.63 
 
 
755 aa  274  4.0000000000000004e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.64 
 
 
896 aa  274  5.000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.26 
 
 
765 aa  273  6e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.06 
 
 
874 aa  273  6e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>