More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0120 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0120  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
839 aa  1683    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.554495  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.63 
 
 
1044 aa  410  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227424  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1251  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.85 
 
 
1101 aa  337  7.999999999999999e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000252838 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1409  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.49 
 
 
778 aa  320  1e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2483  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.84 
 
 
1071 aa  316  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.9 
 
 
1078 aa  311  2.9999999999999997e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0634  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.81 
 
 
1000 aa  308  4.0000000000000004e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.932649  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0577  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.24 
 
 
1005 aa  302  2e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0920445  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0831  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.43 
 
 
957 aa  302  2e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0743  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.48 
 
 
869 aa  300  9e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2187  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.73 
 
 
705 aa  296  1e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.62 
 
 
1055 aa  296  1e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2628  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.64 
 
 
902 aa  295  2e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1426  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.95 
 
 
1079 aa  293  1e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.688315  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1425  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.8 
 
 
1096 aa  291  4e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.579353  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.47 
 
 
1358 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.117306 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1770  histidine kinase  43.33 
 
 
742 aa  284  4.0000000000000003e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2101  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.39 
 
 
678 aa  281  4e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.007905  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1570  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.14 
 
 
1039 aa  281  5e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.184468  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.05 
 
 
916 aa  279  1e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0392  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  44.25 
 
 
762 aa  280  1e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.5363 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1153  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.92 
 
 
1143 aa  279  1e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648529  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0181  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.27 
 
 
837 aa  278  3e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.415169  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.2 
 
 
1055 aa  277  5e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1722  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.92 
 
 
1007 aa  277  7e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.608863  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1582  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.13 
 
 
788 aa  276  1.0000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1424  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.23 
 
 
1050 aa  274  4.0000000000000004e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.4662  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  31.59 
 
 
982 aa  274  5.000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1628  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.77 
 
 
1070 aa  273  7e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1413  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.23 
 
 
918 aa  273  9e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3312  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.12 
 
 
1226 aa  273  1e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.57 
 
 
738 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.23 
 
 
1127 aa  270  8.999999999999999e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.93 
 
 
676 aa  270  1e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00629905  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2784  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.57 
 
 
1222 aa  268  5e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0520121 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0331  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.22 
 
 
955 aa  266  8.999999999999999e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.383184 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  38.69 
 
 
631 aa  266  1e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.43 
 
 
902 aa  266  1e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1051  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.06 
 
 
862 aa  266  1e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  36.27 
 
 
882 aa  266  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0562  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.26 
 
 
743 aa  266  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0973  histidine kinase  42.59 
 
 
733 aa  262  2e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000797186 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1642  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.74 
 
 
1131 aa  262  2e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0330659  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.1 
 
 
881 aa  262  3e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.16 
 
 
1195 aa  260  6e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2929  histidine kinase  35.05 
 
 
606 aa  260  6e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.44 
 
 
785 aa  260  8e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2487  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  38.17 
 
 
1535 aa  260  9e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.162467  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.07 
 
 
940 aa  259  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1982  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.92 
 
 
1058 aa  257  7e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.12 
 
 
1177 aa  256  1.0000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.51 
 
 
1199 aa  254  3e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.45 
 
 
896 aa  254  5.000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3367  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.77 
 
 
1059 aa  254  5.000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.049018 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5761  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.06 
 
 
1204 aa  254  5.000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.122146 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0191  histidine kinase  38.16 
 
 
666 aa  253  1e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2693  histidine kinase  39.17 
 
 
571 aa  252  2e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0909214 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.81 
 
 
717 aa  250  7e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0599  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.44 
 
 
957 aa  250  8e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0566  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  32.95 
 
 
1193 aa  250  8e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1285  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  32.42 
 
 
772 aa  250  9e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.33 
 
 
1287 aa  249  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0179  histidine kinase  35.75 
 
 
758 aa  249  1e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0658  histidine kinase  38.65 
 
 
627 aa  249  1e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.4 
 
 
767 aa  249  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2468  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37 
 
 
631 aa  249  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633599  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.74 
 
 
939 aa  249  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.660448  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0688  histidine kinase  35.73 
 
 
691 aa  249  2e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3744  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.34 
 
 
643 aa  249  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.32 
 
 
882 aa  249  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.05 
 
 
643 aa  247  6e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.06 
 
 
1433 aa  247  6e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1227  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.8 
 
 
1229 aa  247  6.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0244  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.36 
 
 
1066 aa  246  9e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.17 
 
 
817 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1760  histidine kinase  36.36 
 
 
671 aa  246  9.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2838  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.05 
 
 
860 aa  246  1.9999999999999999e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0565  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.44 
 
 
947 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0558  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.39 
 
 
893 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.843554  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3686  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  38.54 
 
 
620 aa  245  3e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.926172  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3496  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39 
 
 
643 aa  245  3e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1451  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.56 
 
 
877 aa  244  3.9999999999999997e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2393  histidine kinase  38.55 
 
 
735 aa  243  7.999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.774182  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.26 
 
 
764 aa  243  1e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  35.28 
 
 
651 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  36.53 
 
 
661 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0578  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.17 
 
 
667 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.44 
 
 
827 aa  241  4e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1187  two component system histidine kinase  28.91 
 
 
683 aa  241  5e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.572633  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3846  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.64 
 
 
860 aa  240  6.999999999999999e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0844  PAS/histidine kinase/ATPase domain-containing protein  28.91 
 
 
669 aa  240  6.999999999999999e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.644717  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.13 
 
 
791 aa  240  8e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108732  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1639  histidine kinase  37.26 
 
 
676 aa  239  2e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.576569  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2525  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.3 
 
 
785 aa  239  2e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.985854  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.23 
 
 
780 aa  238  3e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.12 
 
 
1075 aa  238  3e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1522  histidine kinase  39.43 
 
 
544 aa  238  4e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4173  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.05 
 
 
643 aa  237  8e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2021  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  37 
 
 
645 aa  236  9e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.798842  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.2 
 
 
1452 aa  237  9e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>