More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0688 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1639  histidine kinase  48.22 
 
 		 676 aa  659    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.576569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0688  histidine kinase  100 
 
 		 691 aa  1425    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1760  histidine kinase  48.87 
 
 		 671 aa  665    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  44.36 
 
 		 982 aa  346  8.999999999999999e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  42.01 
 
 		 1023 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  41.9 
 
 		 661 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.76 
 
 		 764 aa  305  1.0000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  41.73 
 
 		 968 aa  302  1e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2847  PAS  42.71 
 
 		 764 aa  302  1e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.445085  normal  0.0351705 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.16 
 
 		 781 aa  297  5e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.93 
 
 		 1433 aa  296  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.29 
 
 		 785 aa  295  3e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2393  histidine kinase  40.71 
 
 		 735 aa  294  5e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.774182  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.85 
 
 		 817 aa  294  5e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3786  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.75 
 
 		 606 aa  293  9e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.91 
 
 		 874 aa  292  1e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  39.6 
 
 		 631 aa  291  2e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.57 
 
 		 973 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.88 
 
 		 1407 aa  290  6e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.86 
 
 		 765 aa  289  1e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  38.05 
 
 		 1560 aa  287  4e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3686  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  41.28 
 
 		 620 aa  287  4e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.926172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3051  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.75 
 
 		 947 aa  287  4e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1199  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.33 
 
 		 962 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  39.58 
 
 		 631 aa  286  7e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0244  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.37 
 
 		 1066 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.75 
 
 		 984 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279424  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1409  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.47 
 
 		 778 aa  284  4.0000000000000003e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4715  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.85 
 
 		 1350 aa  284  4.0000000000000003e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.726459  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1441  PAS  42.41 
 
 		 794 aa  283  8.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1464  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.2 
 
 		 1135 aa  283  9e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.396763 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0232  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  38.52 
 
 		 738 aa  283  1e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.39 
 
 		 1452 aa  282  1e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0065  histidine kinase  36.25 
 
 		 578 aa  282  1e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.69 
 
 		 717 aa  282  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  38.63 
 
 		 1028 aa  281  2e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4279  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.83 
 
 		 951 aa  281  3e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3821  Cache sensor hybrid histidine kinase  34.94 
 
 		 759 aa  281  4e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0769557 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1794  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.66 
 
 		 965 aa  280  5e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0332193  normal  0.80092 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1822  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  38.03 
 
 		 582 aa  280  5e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.146561 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0144  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.1 
 
 		 1009 aa  280  5e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162275  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07038  histidine kinase  38.73 
 
 		 641 aa  280  6e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0057  histidine kinase  36.25 
 
 		 588 aa  280  6e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000185994 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0715  histidine kinase  38.26 
 
 		 553 aa  280  6e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.519915  normal  0.60104 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29290  hybrid histidine protein kinase  38.46 
 
 		 826 aa  279  1e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.05 
 
 		 896 aa  279  1e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.08 
 
 		 1499 aa  279  1e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0743  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.26 
 
 		 869 aa  278  2e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.81 
 
 		 932 aa  279  2e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2934  PAS  38.44 
 
 		 955 aa  278  3e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000914767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2946  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  40.42 
 
 		 777 aa  278  3e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1449  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.35 
 
 		 945 aa  278  3e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.36 
 
 		 1287 aa  278  3e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.49 
 
 		 763 aa  278  3e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5292  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.99 
 
 		 524 aa  278  3e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.39 
 
 		 902 aa  277  4e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3450  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.92 
 
 		 718 aa  278  4e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000325842 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.28 
 
 		 969 aa  277  4e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1896  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.33 
 
 		 865 aa  277  5e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.22 
 
 		 1110 aa  277  5e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000219546 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.51 
 
 		 1127 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.44 
 
 		 1313 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.05 
 
 		 1350 aa  275  3e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1770  histidine kinase  37.86 
 
 		 742 aa  274  3e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3872  PAS  40.88 
 
 		 853 aa  274  4.0000000000000004e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.9 
 
 		 1075 aa  274  4.0000000000000004e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1360  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.66 
 
 		 974 aa  273  7e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1009  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  39.02 
 
 		 655 aa  273  8.000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2118  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.15 
 
 		 1125 aa  273  9e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2693  histidine kinase  38.58 
 
 		 571 aa  273  9e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0909214 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1928  sensor histidine kinase/response regulator  37.18 
 
 		 793 aa  272  1e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2929  histidine kinase  37.35 
 
 		 606 aa  272  1e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1879  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.11 
 
 		 604 aa  273  1e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.86 
 
 		 982 aa  271  2e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.288363 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4037  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  38.8 
 
 		 659 aa  271  2e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0811  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.86 
 
 		 724 aa  272  2e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.64 
 
 		 846 aa  272  2e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0718  sensory box histidine kinase/response regulator  38.46 
 
 		 589 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.97168  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1782  PAS sensor protein  39.9 
 
 		 1125 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.522243 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2468  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.2 
 
 		 631 aa  271  4e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2265  histidine kinase  38.06 
 
 		 559 aa  270  7e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.592554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0973  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.9 
 
 		 1064 aa  269  1e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.97 
 
 		 863 aa  269  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.13 
 
 		 738 aa  269  2e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3925  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.35 
 
 		 662 aa  268  2e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.150145  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.44 
 
 		 643 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43670  putative sensor/response regulator hybrid  37.53 
 
 		 651 aa  268  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3852  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.49 
 
 		 879 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0452097  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 995 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.11 
 
 		 827 aa  267  4e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3744  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.79 
 
 		 643 aa  266  7e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.78 
 
 		 1195 aa  266  7e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.51 
 
 		 1199 aa  266  7e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0460  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  36.21 
 
 		 835 aa  266  1e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.980587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0987  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.15 
 
 		 846 aa  266  1e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.594505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1351  histidine kinase  36.83 
 
 		 596 aa  265  1e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57626  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2168  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.36 
 
 		 1204 aa  266  1e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172741 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1227  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.49 
 
 		 1229 aa  265  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03166  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.34 
 
 		 959 aa  265  2e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3496  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.66 
 
 		 643 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>