More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2118 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_1782  PAS sensor protein  98.22 
 
 
1125 aa  2209    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.522243 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2118  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
1125 aa  2252    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187673  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1728  multi-sensor hybrid histidine kinase  85.6 
 
 
1120 aa  1751    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405777  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3683  multi-sensor hybrid histidine kinase  56.12 
 
 
1124 aa  1141    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.781779 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1767  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.28 
 
 
1157 aa  616  9.999999999999999e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.878  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3466  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.77 
 
 
1362 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.185791  normal  0.474676 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.73 
 
 
1350 aa  512  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4802  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.62 
 
 
910 aa  499  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.150201 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3030  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.4 
 
 
1596 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010791 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.97 
 
 
984 aa  459  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279424  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0144  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.87 
 
 
1009 aa  450  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162275  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4574  histidine kinase  52.56 
 
 
900 aa  399  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3041  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  52.86 
 
 
873 aa  383  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616698  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3783  histidine kinase  45.17 
 
 
737 aa  378  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18481  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.81 
 
 
1433 aa  379  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  33.54 
 
 
1560 aa  348  3e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3965  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.25 
 
 
1158 aa  348  3e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1217  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.76 
 
 
803 aa  346  1e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.503931  normal  0.0882093 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1627  histidine kinase  48.91 
 
 
538 aa  335  4e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.67 
 
 
969 aa  330  7e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1896  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.44 
 
 
865 aa  328  3e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0472  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  50.26 
 
 
517 aa  325  2e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723652 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1746  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.23 
 
 
903 aa  325  2e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5786  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  49.13 
 
 
589 aa  324  6e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0113735 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1642  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.15 
 
 
1131 aa  320  1e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0330659  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.51 
 
 
1075 aa  319  2e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2525  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.99 
 
 
785 aa  317  7e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.985854  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.73 
 
 
1044 aa  314  5.999999999999999e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227424  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.41 
 
 
765 aa  313  9e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  37.66 
 
 
968 aa  312  2e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3846  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.63 
 
 
860 aa  310  8e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5292  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.02 
 
 
524 aa  309  2.0000000000000002e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.84 
 
 
896 aa  308  3e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.18 
 
 
1369 aa  308  3e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2154  hypothetical protein  34.34 
 
 
786 aa  308  6e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0411448  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.96 
 
 
785 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.1 
 
 
1452 aa  306  1.0000000000000001e-81  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.25 
 
 
973 aa  306  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.72 
 
 
1177 aa  306  2.0000000000000002e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3367  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.64 
 
 
1059 aa  305  3.0000000000000004e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.049018 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0244  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.99 
 
 
1066 aa  304  6.000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1933  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.17 
 
 
650 aa  304  6.000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.77937  normal  0.846715 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1353  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.37 
 
 
1029 aa  303  9e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283316  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.9 
 
 
1202 aa  303  9e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3798  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.27 
 
 
864 aa  303  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1263  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  46.56 
 
 
687 aa  303  2e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.618033  normal  0.0213865 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1497  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.42 
 
 
880 aa  303  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  40.19 
 
 
1023 aa  301  4e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.99 
 
 
882 aa  301  4e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1227  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.15 
 
 
1229 aa  301  5e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2033  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.23 
 
 
866 aa  301  6e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0099  signal transduction histidine kinase-like protein  31.57 
 
 
938 aa  300  8e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.878773 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.21 
 
 
764 aa  300  8e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.57 
 
 
817 aa  299  2e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.29 
 
 
781 aa  298  3e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4904  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.15 
 
 
873 aa  298  4e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.683005  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3532  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.04 
 
 
1271 aa  298  4e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.8 
 
 
1110 aa  298  5e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000219546 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.32 
 
 
1199 aa  297  8e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.15 
 
 
969 aa  297  8e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  34.8 
 
 
982 aa  296  1e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.77 
 
 
1407 aa  296  1e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2265  histidine kinase  44.19 
 
 
559 aa  295  2e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.592554  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1877  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.73 
 
 
863 aa  295  3e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.07 
 
 
1611 aa  294  5e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1349  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.07 
 
 
1578 aa  294  8e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6017  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.15 
 
 
1044 aa  293  1e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1424  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.74 
 
 
1050 aa  293  2e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.4662  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.91 
 
 
1127 aa  292  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1355  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.35 
 
 
895 aa  292  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1683  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.49 
 
 
1659 aa  292  2e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2784  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.11 
 
 
1222 aa  292  3e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0520121 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0065  histidine kinase  42.78 
 
 
578 aa  290  7e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0516  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.69 
 
 
850 aa  290  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.377634 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0046  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.79 
 
 
901 aa  289  2e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.135172  normal  0.385882 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10770  putative sensor/response regulator hybrid  35.99 
 
 
1417 aa  289  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.903284 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3872  PAS  34.6 
 
 
853 aa  289  2.9999999999999996e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.28 
 
 
902 aa  288  5e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2218  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.65 
 
 
1070 aa  288  5e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0765203 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2222  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.68 
 
 
1120 aa  287  5.999999999999999e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.201183 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2168  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.92 
 
 
1204 aa  287  8e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.172741 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.87 
 
 
846 aa  287  9e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.35 
 
 
1501 aa  287  9e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1087  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.85 
 
 
1121 aa  286  2.0000000000000002e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.740067  hitchhiker  0.00000751372 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1062  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.29 
 
 
695 aa  286  2.0000000000000002e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0307  response regulator, histidine kinase  33.02 
 
 
755 aa  285  3.0000000000000004e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 
1195 aa  285  3.0000000000000004e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1277  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.55 
 
 
969 aa  285  4.0000000000000003e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.75 
 
 
932 aa  285  4.0000000000000003e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0718  sensory box histidine kinase/response regulator  39.8 
 
 
589 aa  285  5.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.97168  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1441  PAS  39.83 
 
 
794 aa  284  5.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876573  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.55 
 
 
1287 aa  285  5.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1342  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.04 
 
 
944 aa  284  7.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1614  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.39 
 
 
873 aa  284  9e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.499982  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2393  histidine kinase  43.26 
 
 
735 aa  284  9e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.774182  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1928  sensor histidine kinase/response regulator  38.57 
 
 
793 aa  283  1e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2839  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.54 
 
 
1478 aa  283  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95588 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4279  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.89 
 
 
951 aa  283  1e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4224  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.73 
 
 
877 aa  282  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.27 
 
 
1499 aa  282  2e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>