More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1728 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1728  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 1120 aa  2229    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2118  multi-sensor hybrid histidine kinase  85.96 
 
 		 1125 aa  1802    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1782  PAS sensor protein  85.78 
 
 		 1125 aa  1798    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.522243 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3683  multi-sensor hybrid histidine kinase  55.92 
 
 		 1124 aa  1124    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.781779 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1767  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.78 
 
 		 1157 aa  621  1e-176  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3466  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.69 
 
 		 1362 aa  581  1e-164  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.185791  normal  0.474676 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.91 
 
 		 1350 aa  491  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4802  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.93 
 
 		 910 aa  486  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.150201 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3030  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.19 
 
 		 1596 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010791 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.72 
 
 		 984 aa  459  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279424  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0144  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.65 
 
 		 1009 aa  445  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162275  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4574  histidine kinase  52.38 
 
 		 900 aa  386  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3783  histidine kinase  45.84 
 
 		 737 aa  379  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18481  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.97 
 
 		 1433 aa  372  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3041  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  52.01 
 
 		 873 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616698  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3965  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.1 
 
 		 1158 aa  353  8e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0472  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  51.29 
 
 		 517 aa  340  9e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723652 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1627  histidine kinase  50 
 
 		 538 aa  336  2e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1217  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.39 
 
 		 803 aa  335  4e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.503931  normal  0.0882093 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1746  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.79 
 
 		 903 aa  333  2e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1896  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.96 
 
 		 865 aa  332  3e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  32.84 
 
 		 1560 aa  330  1.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5786  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  48.89 
 
 		 589 aa  327  7e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0113735 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2525  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.91 
 
 		 785 aa  326  2e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.985854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.09 
 
 		 969 aa  322  3e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.68 
 
 		 765 aa  320  9e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.58 
 
 		 1044 aa  318  3e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227424  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.66 
 
 		 1075 aa  318  3e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1950  PAS sensor protein  27.43 
 
 		 1179 aa  315  2.9999999999999996e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.488377  hitchhiker  0.000911769 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.38 
 
 		 973 aa  312  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3367  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.38 
 
 		 1059 aa  312  2.9999999999999997e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.049018 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.48 
 
 		 1202 aa  310  6.999999999999999e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1227  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.99 
 
 		 1229 aa  310  9e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2033  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.48 
 
 		 866 aa  310  9e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.79 
 
 		 896 aa  309  2.0000000000000002e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1062  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.96 
 
 		 695 aa  307  7e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1349  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.85 
 
 		 1578 aa  307  9.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2784  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.99 
 
 		 1222 aa  306  1.0000000000000001e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0520121 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  37.24 
 
 		 968 aa  306  1.0000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.54 
 
 		 1611 aa  306  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0244  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.96 
 
 		 1066 aa  305  4.0000000000000003e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1642  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.48 
 
 		 1131 aa  305  4.0000000000000003e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0330659  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1933  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.37 
 
 		 650 aa  304  8.000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.77937  normal  0.846715 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.71 
 
 		 785 aa  302  2e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.96 
 
 		 1452 aa  303  2e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.34 
 
 		 969 aa  302  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.5 
 
 		 1199 aa  302  3e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1263  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  46.72 
 
 		 687 aa  301  4e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.618033  normal  0.0213865 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1353  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.88 
 
 		 1029 aa  301  4e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283316  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.44 
 
 		 882 aa  301  5e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.29 
 
 		 1195 aa  301  5e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.52 
 
 		 1369 aa  301  5e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5292  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.04 
 
 		 524 aa  300  9e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0046  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.03 
 
 		 901 aa  300  1e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.135172  normal  0.385882 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.4 
 
 		 1177 aa  300  1e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6017  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.38 
 
 		 1044 aa  300  1e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  42.6 
 
 		 1023 aa  299  3e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3846  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.51 
 
 		 860 aa  298  3e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1877  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.93 
 
 		 863 aa  297  6e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.48 
 
 		 1407 aa  296  1e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2154  hypothetical protein  34.54 
 
 		 786 aa  295  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0411448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1497  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.61 
 
 		 880 aa  294  7e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.34 
 
 		 817 aa  292  2e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.01 
 
 		 764 aa  293  2e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.44 
 
 		 902 aa  291  4e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4016  putative PAS/PAC sensor protein  35.58 
 
 		 1626 aa  291  4e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.35 
 
 		 1501 aa  291  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3872  PAS  40.29 
 
 		 853 aa  291  5.0000000000000004e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2168  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  44.91 
 
 		 1204 aa  291  5.0000000000000004e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172741 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  41.34 
 
 		 982 aa  290  8e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.7 
 
 		 1110 aa  290  8e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000219546 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.54 
 
 		 1127 aa  290  1e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1277  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.62 
 
 		 969 aa  289  2e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4904  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.13 
 
 		 873 aa  289  2e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.683005  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.09 
 
 		 1287 aa  288  2.9999999999999996e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1285  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  34.62 
 
 		 772 aa  288  4e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1342  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.87 
 
 		 944 aa  288  4e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3532  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.84 
 
 		 1271 aa  288  5e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0099  signal transduction histidine kinase-like protein  30.67 
 
 		 938 aa  287  5.999999999999999e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.878773 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0565  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.97 
 
 		 947 aa  288  5.999999999999999e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  41.85 
 
 		 781 aa  287  7e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3798  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.32 
 
 		 864 aa  287  7e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3366  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.52 
 
 		 762 aa  286  2.0000000000000002e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1087  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.88 
 
 		 1121 aa  285  2.0000000000000002e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.740067  hitchhiker  0.00000751372 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.71 
 
 		 932 aa  285  3.0000000000000004e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1355  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.85 
 
 		 895 aa  285  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.88 
 
 		 863 aa  285  4.0000000000000003e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.65 
 
 		 846 aa  285  4.0000000000000003e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1614  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.26 
 
 		 873 aa  284  5.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.499982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3563  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.51 
 
 		 1023 aa  284  5.000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3242  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.1 
 
 		 1027 aa  284  6.000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.073449  normal  0.0177381 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0770  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.24 
 
 		 911 aa  284  7.000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1441  PAS  40.09 
 
 		 794 aa  283  9e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0065  histidine kinase  42.82 
 
 		 578 aa  283  1e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3450  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.91 
 
 		 718 aa  283  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000325842 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.21 
 
 		 1499 aa  282  2e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4279  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.76 
 
 		 951 aa  282  2e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4224  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.21 
 
 		 877 aa  281  3e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0318  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.59 
 
 		 1223 aa  282  3e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.455432  normal  0.438074 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2218  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.03 
 
 		 1070 aa  281  4e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0765203 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>