More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0770 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0770  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
911 aa  1877    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3532  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.15 
 
 
1271 aa  427  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.52 
 
 
1313 aa  386  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.93 
 
 
1177 aa  380  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.01 
 
 
969 aa  375  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.27 
 
 
882 aa  372  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.87 
 
 
1116 aa  367  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2536  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.61 
 
 
801 aa  365  2e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.087707 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.19 
 
 
1075 aa  363  5.0000000000000005e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3403  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.34 
 
 
957 aa  350  5e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3242  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.97 
 
 
1027 aa  347  5e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.073449  normal  0.0177381 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2951  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.68 
 
 
1118 aa  339  1.9999999999999998e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.38957  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.2 
 
 
791 aa  338  2.9999999999999997e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108732  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.8 
 
 
674 aa  337  3.9999999999999995e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2222  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.61 
 
 
1120 aa  337  5e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.201183 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  45.48 
 
 
544 aa  325  3e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.55 
 
 
780 aa  322  1.9999999999999998e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3000  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.76 
 
 
968 aa  317  7e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3075  histidine kinase  43.51 
 
 
550 aa  314  3.9999999999999997e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798755 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.73 
 
 
1691 aa  310  5.9999999999999995e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3355  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  47.03 
 
 
685 aa  310  1.0000000000000001e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0162851  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  32.11 
 
 
982 aa  303  6.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.97 
 
 
1369 aa  304  6.000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.48 
 
 
995 aa  301  3e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  44.77 
 
 
968 aa  298  3e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1426  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.86 
 
 
1079 aa  298  4e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.688315  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.46 
 
 
902 aa  295  2e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1409  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.25 
 
 
778 aa  294  4e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.42 
 
 
973 aa  293  7e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.38 
 
 
1363 aa  293  1e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1722  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.53 
 
 
1007 aa  293  1e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.608863  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2957  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.24 
 
 
810 aa  293  1e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3051  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.01 
 
 
947 aa  292  2e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  31.8 
 
 
823 aa  288  2e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3367  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.48 
 
 
1059 aa  287  5e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.049018 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.04 
 
 
982 aa  286  8e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.288363 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3346  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.53 
 
 
781 aa  286  1.0000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.570391  normal  0.852351 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1217  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.27 
 
 
803 aa  286  1.0000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.503931  normal  0.0882093 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0565  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.09 
 
 
947 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1087  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.86 
 
 
1121 aa  285  2.0000000000000002e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.740067  hitchhiker  0.00000751372 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.91 
 
 
1433 aa  285  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.02 
 
 
969 aa  285  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.86 
 
 
874 aa  284  5.000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.73 
 
 
1287 aa  283  1e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.5 
 
 
1127 aa  283  1e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2934  PAS  33.61 
 
 
955 aa  283  2e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000914767  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.67 
 
 
939 aa  282  3e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.660448  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.24 
 
 
785 aa  281  5e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.37 
 
 
1350 aa  280  7e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.77 
 
 
881 aa  280  7e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.83 
 
 
916 aa  280  1e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.49 
 
 
1078 aa  280  1e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.84 
 
 
1407 aa  278  2e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.39 
 
 
846 aa  279  2e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3416  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.72 
 
 
878 aa  278  3e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4471  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.91 
 
 
627 aa  278  3e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.611462  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3113  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.17 
 
 
898 aa  278  4e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.265974  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1560  response regulator, histidine kinase  37.91 
 
 
697 aa  278  4e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0213368  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  38.41 
 
 
882 aa  277  5e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5184  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 
939 aa  278  5e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.0776559 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.02 
 
 
767 aa  277  5e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1199  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.73 
 
 
962 aa  277  6e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2218  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.79 
 
 
1070 aa  277  8e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0765203 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2670  histidine kinase  40.98 
 
 
667 aa  277  8e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.754609  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2769  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.85 
 
 
773 aa  276  9e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2619  histidine kinase  40.98 
 
 
667 aa  276  9e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.01076  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.45 
 
 
1199 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0566  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  36.75 
 
 
1193 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.81 
 
 
763 aa  275  2.0000000000000002e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  43.72 
 
 
764 aa  275  2.0000000000000002e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4076  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.22 
 
 
876 aa  275  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3312  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.26 
 
 
1226 aa  274  5.000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  37.92 
 
 
1023 aa  273  9e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0342  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.91 
 
 
827 aa  273  9e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2784  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.83 
 
 
1222 aa  273  9e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0520121 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4904  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.57 
 
 
873 aa  273  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.683005  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0634  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.82 
 
 
1000 aa  273  1e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.932649  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.74 
 
 
896 aa  273  1e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2468  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 
631 aa  273  1e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633599  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6017  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.79 
 
 
1044 aa  272  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0144  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.8 
 
 
1009 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162275  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1360  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.85 
 
 
644 aa  271  2.9999999999999997e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.528402  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5292  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.47 
 
 
524 aa  271  2.9999999999999997e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.43 
 
 
1452 aa  271  2.9999999999999997e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3030  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.66 
 
 
1596 aa  271  4e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010791 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2699  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.18 
 
 
1099 aa  271  5e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117538 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.85 
 
 
738 aa  271  5e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2415  PAS sensor protein  32.71 
 
 
810 aa  271  5e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5573  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.63 
 
 
1203 aa  270  5.9999999999999995e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.805596  normal  0.315829 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  40.69 
 
 
827 aa  271  5.9999999999999995e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0387  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.4 
 
 
1068 aa  270  7e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4224  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.46 
 
 
877 aa  270  1e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.42 
 
 
863 aa  268  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1644  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.34 
 
 
789 aa  269  2e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.841521  normal  0.594738 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3769  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.63 
 
 
710 aa  268  2.9999999999999995e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.312808  normal  0.729669 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0370  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.75 
 
 
1070 aa  268  4e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0564  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.38 
 
 
627 aa  268  4e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.211254  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3466  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.39 
 
 
1362 aa  268  5e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.185791  normal  0.474676 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43670  putative sensor/response regulator hybrid  42.82 
 
 
651 aa  267  5.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2033  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.09 
 
 
866 aa  267  7e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>