More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0099 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0099  signal transduction histidine kinase-like protein  100 
 
 		 938 aa  1864    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.878773 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3167  signal transduction histidine kinase-like protein  38.01 
 
 		 1077 aa  317  6e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540842 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1409  Signal transduction histidine kinase-like  34.05 
 
 		 685 aa  312  2e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2118  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.07 
 
 		 1125 aa  306  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1782  PAS sensor protein  30.7 
 
 		 1125 aa  303  1e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.522243 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2494  signal transduction histidine kinase-like protein  34.6 
 
 		 1317 aa  302  2e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.206751 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3683  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.61 
 
 		 1124 aa  288  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.781779 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0534  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.87 
 
 		 697 aa  287  5.999999999999999e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.608337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3690  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.24 
 
 		 833 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0862317  normal  0.782884 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1728  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.91 
 
 		 1120 aa  274  5.000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2093  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38 
 
 		 530 aa  270  7e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.874358  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0186  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.13 
 
 		 657 aa  262  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00908915 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3548  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.63 
 
 		 1007 aa  258  3e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.508984  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6413  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  39.31 
 
 		 404 aa  258  4e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.341429  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1939  PAS  36.47 
 
 		 779 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.627435  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2129  sensory box histidine kinase/response regulator  36.55 
 
 		 746 aa  253  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.706377  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5383  Signal transduction histidine kinase  35.7 
 
 		 784 aa  251  5e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.626951  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.02 
 
 		 969 aa  248  3e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2390  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.34 
 
 		 618 aa  247  6.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.868312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1924  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.69 
 
 		 901 aa  247  8e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1019  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.11 
 
 		 869 aa  245  3e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.02 
 
 		 1369 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  26.79 
 
 		 1765 aa  244  7e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.23 
 
 		 1611 aa  243  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2068  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.22 
 
 		 948 aa  243  1e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1349  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.23 
 
 		 1578 aa  242  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.29 
 
 		 1767 aa  241  5e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.44 
 
 		 1767 aa  237  7e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.57 
 
 		 1767 aa  237  8e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2066  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.44 
 
 		 1167 aa  234  4.0000000000000004e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.082343  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2356  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.73 
 
 		 602 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.52 
 
 		 1501 aa  234  5e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.67 
 
 		 1765 aa  233  9e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.81 
 
 		 1350 aa  233  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1124  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.88 
 
 		 502 aa  232  2e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.963767  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1913  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.52 
 
 		 1118 aa  232  3e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  27.72 
 
 		 1763 aa  232  3e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1918  ATP-binding region, ATPase-like protein  37.02 
 
 		 935 aa  231  4e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.82 
 
 		 1786 aa  231  7e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2159  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.16 
 
 		 796 aa  229  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.758044 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1845  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.07 
 
 		 878 aa  230  1e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.187428  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.9 
 
 		 989 aa  230  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1189  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.05 
 
 		 971 aa  229  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1767  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.64 
 
 		 1157 aa  229  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.79 
 
 		 1771 aa  228  3e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.66 
 
 		 1784 aa  228  6e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.93 
 
 		 1792 aa  226  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.5 
 
 		 1782 aa  226  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1643  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.07 
 
 		 633 aa  226  2e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.231435  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0144  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.43 
 
 		 1009 aa  224  4e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162275  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.91 
 
 		 1768 aa  224  4.9999999999999996e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2487  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  29.07 
 
 		 1535 aa  223  9e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.162467  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2100  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.12 
 
 		 637 aa  223  9.999999999999999e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.269626 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4184  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.23 
 
 		 783 aa  222  3e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3072  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.48 
 
 		 689 aa  218  4e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0145505 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.17 
 
 		 1363 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.96 
 
 		 989 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0336  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.64 
 
 		 657 aa  215  2.9999999999999995e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.63 
 
 		 1287 aa  215  3.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.15 
 
 		 984 aa  214  9e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279424  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3030  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.73 
 
 		 1596 aa  213  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010791 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1896  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.08 
 
 		 865 aa  213  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0133  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.54 
 
 		 766 aa  213  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.834667 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1087  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.69 
 
 		 1121 aa  211  4e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.740067  hitchhiker  0.00000751372 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0368  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.16 
 
 		 695 aa  211  5e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0590374 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.37 
 
 		 969 aa  211  5e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3466  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.69 
 
 		 1362 aa  211  6e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.185791  normal  0.474676 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  32.82 
 
 		 882 aa  210  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.7 
 
 		 973 aa  210  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3242  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.48 
 
 		 1027 aa  209  3e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.073449  normal  0.0177381 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4734  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.85 
 
 		 798 aa  206  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00660973 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.63 
 
 		 1433 aa  206  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  34.59 
 
 		 970 aa  206  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1217  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.6 
 
 		 803 aa  206  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.503931  normal  0.0882093 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1642  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.23 
 
 		 1131 aa  204  5e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0330659  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1117  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.24 
 
 		 770 aa  204  6e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4037  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  36.43 
 
 		 659 aa  204  7e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1950  PAS sensor protein  23.25 
 
 		 1179 aa  203  9.999999999999999e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.488377  hitchhiker  0.000911769 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.31 
 
 		 1075 aa  203  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  30.82 
 
 		 1560 aa  202  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3431  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.23 
 
 		 756 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.75 
 
 		 1177 aa  201  5e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6237  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.09 
 
 		 721 aa  201  7e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703753 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2218  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.9 
 
 		 1070 aa  201  7.999999999999999e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0765203 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9103  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.64 
 
 		 1145 aa  200  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4715  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.36 
 
 		 1350 aa  199  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.726459  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.83 
 
 		 870 aa  199  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3164  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.41 
 
 		 1245 aa  200  1.0000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.26571  hitchhiker  0.00125378 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2508  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.6 
 
 		 784 aa  199  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.033945 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3120  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.39 
 
 		 752 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.19 
 
 		 1195 aa  198  5.000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4312  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 		 640 aa  198  5.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  33.41 
 
 		 2051 aa  197  6e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6560  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.34 
 
 		 720 aa  197  8.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.646619 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.53 
 
 		 1078 aa  196  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2675  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.54 
 
 		 708 aa  196  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877  normal  0.897929 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.19 
 
 		 816 aa  196  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3786  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.6 
 
 		 606 aa  196  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3367  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.72 
 
 		 1059 aa  196  2e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.049018 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.25 
 
 		 1331 aa  196  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>