More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1124 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1124  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 502 aa  998    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.963767  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1643  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.91 
 
 		 633 aa  319  7e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.231435  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2093  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.98 
 
 		 530 aa  291  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.874358  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6413  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  42.82 
 
 		 404 aa  276  9e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.341429  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1939  PAS  39.49 
 
 		 779 aa  270  5e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.627435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2390  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.25 
 
 		 618 aa  269  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.868312  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2129  sensory box histidine kinase/response regulator  39.72 
 
 		 746 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.706377  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3548  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.25 
 
 		 1007 aa  264  3e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.508984  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0534  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.87 
 
 		 697 aa  263  6e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.608337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1409  Signal transduction histidine kinase-like  36.57 
 
 		 685 aa  262  1e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3167  signal transduction histidine kinase-like protein  40.27 
 
 		 1077 aa  259  6e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540842 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2356  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.26 
 
 		 602 aa  259  8e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1924  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.43 
 
 		 901 aa  256  8e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5383  Signal transduction histidine kinase  36.6 
 
 		 784 aa  252  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.626951  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2066  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.89 
 
 		 1167 aa  250  5e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.082343  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3690  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.93 
 
 		 833 aa  249  5e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0862317  normal  0.782884 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0186  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.41 
 
 		 657 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00908915 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1019  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.64 
 
 		 869 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1918  ATP-binding region, ATPase-like protein  37.03 
 
 		 935 aa  238  2e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2068  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.59 
 
 		 948 aa  238  3e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2494  signal transduction histidine kinase-like protein  36.58 
 
 		 1317 aa  237  4e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.206751 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1913  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.81 
 
 		 1118 aa  236  6e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2100  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.1 
 
 		 637 aa  233  7.000000000000001e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.269626 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0099  signal transduction histidine kinase-like protein  38.88 
 
 		 938 aa  233  7.000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.878773 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4184  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 783 aa  225  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2525  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.15 
 
 		 785 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.985854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1845  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.18 
 
 		 878 aa  219  7.999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.187428  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.13 
 
 		 989 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4135  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.37 
 
 		 922 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000370631  normal  0.0140414 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3542  PAS sensor protein  30.45 
 
 		 656 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.11869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.03 
 
 		 863 aa  214  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1189  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.39 
 
 		 971 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4715  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.97 
 
 		 1350 aa  213  5.999999999999999e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.726459  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1035  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.01 
 
 		 1041 aa  212  2e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73134 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.68 
 
 		 791 aa  211  2e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108732  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4225  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.33 
 
 		 1322 aa  211  2e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.88 
 
 		 989 aa  210  5e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.7 
 
 		 1313 aa  206  9e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6237  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.3 
 
 		 721 aa  205  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703753 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1117  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.38 
 
 		 770 aa  205  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.95 
 
 		 1287 aa  204  3e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1005  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.21 
 
 		 747 aa  203  5e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2451  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.21 
 
 		 846 aa  202  8e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00414748 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  34.99 
 
 		 882 aa  202  9e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2998  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.2 
 
 		 807 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.745142 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0420  PAS  34.62 
 
 		 787 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0516903 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3381  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 		 902 aa  202  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.247292 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3211  histidine kinase  33.33 
 
 		 781 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.306218  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0118  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.55 
 
 		 1927 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.125924 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.18 
 
 		 1058 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1950  PAS sensor protein  28.68 
 
 		 1179 aa  200  5e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.488377  hitchhiker  0.000911769 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3009  histidine kinase  33.65 
 
 		 603 aa  200  5e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3120  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.84 
 
 		 752 aa  200  5e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2839  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.6 
 
 		 1478 aa  199  9e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95588 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  35.98 
 
 		 823 aa  199  9e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0107  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.46 
 
 		 774 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4037  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  35.25 
 
 		 659 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1287  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.98 
 
 		 570 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2847  PAS  35.32 
 
 		 764 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.445085  normal  0.0351705 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  35.23 
 
 		 2051 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.88 
 
 		 870 aa  198  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0342  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.47 
 
 		 827 aa  197  3e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1511  multi-sensor hybrid histidine kinase  33 
 
 		 1002 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1484  multi-sensor hybrid histidine kinase  33 
 
 		 1002 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  33.95 
 
 		 1023 aa  197  5.000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.08 
 
 		 1044 aa  197  5.000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227424  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.08 
 
 		 969 aa  197  5.000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3975  Cache sensor hybrid histidine kinase  32.41 
 
 		 811 aa  196  8.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000222358  hitchhiker  0.00723661 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2805  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.68 
 
 		 927 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0808  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.83 
 
 		 929 aa  195  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1017  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.25 
 
 		 1323 aa  195  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0385374  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3284  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.46 
 
 		 856 aa  195  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0250894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.91 
 
 		 995 aa  194  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3242  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 		 1027 aa  195  2e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.073449  normal  0.0177381 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3639  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.67 
 
 		 1210 aa  194  4e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.847136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.33 
 
 		 1331 aa  194  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2508  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.62 
 
 		 784 aa  193  5e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.033945 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3403  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.39 
 
 		 957 aa  193  6e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  35 
 
 		 881 aa  193  6e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.26 
 
 		 1177 aa  193  6e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3243  PAS sensor protein  32.41 
 
 		 1323 aa  192  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2100  two-component sensor protein  31.82 
 
 		 1211 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349009  normal  0.142111 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.86 
 
 		 765 aa  191  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3346  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.7 
 
 		 781 aa  191  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.570391  normal  0.852351 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.86 
 
 		 1501 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43120  periplasmic sensory histidine protein kinase  42.18 
 
 		 830 aa  191  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.49 
 
 		 780 aa  191  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1586  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.72 
 
 		 1178 aa  191  2.9999999999999997e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.830805  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0368  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.38 
 
 		 695 aa  191  2.9999999999999997e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0590374 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1855  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.67 
 
 		 1285 aa  190  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1560  response regulator, histidine kinase  28.81 
 
 		 697 aa  190  4e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0213368  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3431  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.64 
 
 		 756 aa  190  4e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0232  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  33.91 
 
 		 738 aa  190  5e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03280  hybrid sensory histidine protein kinase  37.64 
 
 		 957 aa  190  5e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.558043  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1826  sensor protein TorS  33.42 
 
 		 1000 aa  189  7e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.811683  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2218  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.38 
 
 		 1070 aa  189  7e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0765203 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1181  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.81 
 
 		 601 aa  189  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1349  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.51 
 
 		 1578 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2202  histidine kinase  33.88 
 
 		 613 aa  189  1e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.143763  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.58 
 
 		 926 aa  188  2e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>