More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2508 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2508  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 784 aa  1611    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.033945 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  41.7 
 
 		 2051 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3975  Cache sensor hybrid histidine kinase  42.21 
 
 		 811 aa  382  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000222358  hitchhiker  0.00723661 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4135  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.76 
 
 		 922 aa  382  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000370631  normal  0.0140414 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4154  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  42.28 
 
 		 750 aa  374  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.22479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2148  Cache sensor hybrid histidine kinase  38.37 
 
 		 937 aa  368  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5184  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.02 
 
 		 939 aa  366  1e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.0776559 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1017  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.94 
 
 		 1323 aa  351  2e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0385374  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1117  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.4 
 
 		 770 aa  352  2e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3211  histidine kinase  41.16 
 
 		 781 aa  343  5.999999999999999e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.306218  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3243  PAS sensor protein  42.66 
 
 		 1323 aa  343  9e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6237  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.99 
 
 		 721 aa  332  1e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703753 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1855  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.12 
 
 		 1285 aa  330  4e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4225  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 1322 aa  325  2e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.38 
 
 		 935 aa  322  1.9999999999999998e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6547  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.27 
 
 		 865 aa  320  6e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.325935 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0819  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.53 
 
 		 844 aa  319  1e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0848  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.53 
 
 		 844 aa  319  1e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.84 
 
 		 989 aa  317  5e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2948  histidine kinase  44.44 
 
 		 800 aa  316  8e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6560  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.42 
 
 		 720 aa  316  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.646619 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.16 
 
 		 989 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0808  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.83 
 
 		 929 aa  311  2e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4464  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.15 
 
 		 945 aa  311  2e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.72 
 
 		 1058 aa  309  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.08 
 
 		 1611 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1349  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.87 
 
 		 1578 aa  303  8.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1273  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.44 
 
 		 1090 aa  297  5e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1302  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.44 
 
 		 1090 aa  297  5e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0842919  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4079  sensor histidine kinase/response regulator  38.97 
 
 		 1161 aa  297  6e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1511  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.8 
 
 		 1002 aa  295  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1484  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.8 
 
 		 1002 aa  295  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1082  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.55 
 
 		 1068 aa  295  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31862 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5067  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.76 
 
 		 1002 aa  290  6e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2699  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.94 
 
 		 1099 aa  288  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117538 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3000  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.64 
 
 		 968 aa  289  2e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1353  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.16 
 
 		 1197 aa  288  2.9999999999999996e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0975  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.53 
 
 		 1130 aa  286  1.0000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.537982 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.14 
 
 		 1313 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1719  histidine kinase  40.04 
 
 		 1257 aa  285  3.0000000000000004e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0583268  normal  0.402469 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3065  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.27 
 
 		 1128 aa  283  7.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3320  histidine kinase  36.4 
 
 		 1128 aa  283  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.515444 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3135  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.09 
 
 		 1187 aa  280  5e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3868  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.13 
 
 		 1127 aa  281  5e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.69 
 
 		 1075 aa  280  7e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0072  histidine kinase  38.9 
 
 		 810 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2985  fused histidine kinase sensor/response regulator  36.71 
 
 		 1121 aa  279  2e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.446873 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1574  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.05 
 
 		 841 aa  277  5e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1762  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 		 1146 aa  277  5e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.468259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0961  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.34 
 
 		 1154 aa  276  1.0000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.544458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3498  two component sensor kinase  37.09 
 
 		 1125 aa  275  3e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3398  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.07 
 
 		 1202 aa  274  4.0000000000000004e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.613847  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  41.83 
 
 		 1028 aa  274  6e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1446  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  36.98 
 
 		 1131 aa  271  2.9999999999999997e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.705679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3965  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.27 
 
 		 1158 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  39.8 
 
 		 882 aa  271  5e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3586  sensor histidine kinase/response regulator  38.24 
 
 		 1153 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3865  ATP-binding region, ATPase-like  35.33 
 
 		 1122 aa  269  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0670  sensor histidine kinase/response regulator  36.11 
 
 		 1170 aa  268  2e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.315036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.6 
 
 		 1127 aa  268  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4180  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.01 
 
 		 1126 aa  268  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0796198 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3846  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.77 
 
 		 860 aa  268  4e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3686  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  42.03 
 
 		 620 aa  267  5.999999999999999e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.926172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0978  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.4 
 
 		 1175 aa  265  2e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2174  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.2 
 
 		 633 aa  265  3e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.634157  normal  0.649523 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1442  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36 
 
 		 1122 aa  265  3e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  31.67 
 
 		 982 aa  264  4e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1009  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  40.83 
 
 		 655 aa  263  1e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2934  PAS  40.22 
 
 		 955 aa  263  1e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000914767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1896  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.09 
 
 		 865 aa  262  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.34 
 
 		 982 aa  262  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.288363 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4037  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  39.77 
 
 		 659 aa  262  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.23 
 
 		 1078 aa  262  2e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  29.65 
 
 		 823 aa  261  3e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1251  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.36 
 
 		 1122 aa  261  4e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0612415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1586  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.96 
 
 		 1178 aa  261  4e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.830805  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1082  histidine kinase  36.38 
 
 		 1220 aa  260  8e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.58 
 
 		 674 aa  259  9e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4631  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.62 
 
 		 1672 aa  259  1e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.659803  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1730  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.09 
 
 		 1195 aa  259  1e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.479441  normal  0.752594 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1712  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.62 
 
 		 1173 aa  258  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0980923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0653  sensor histidine kinase  34.43 
 
 		 1124 aa  259  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.450749  normal  0.469118 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.41 
 
 		 717 aa  258  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1441  PAS  37.5 
 
 		 794 aa  258  3e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  37.71 
 
 		 661 aa  258  4e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.12 
 
 		 1410 aa  258  4e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0592  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.4 
 
 		 1113 aa  258  4e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0114606 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3146  histidine kinase  38.1 
 
 		 1140 aa  257  6e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.353593  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1217  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.8 
 
 		 803 aa  257  6e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.503931  normal  0.0882093 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0387  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.09 
 
 		 1068 aa  256  8e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2628  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.9 
 
 		 902 aa  256  1.0000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  39.44 
 
 		 1023 aa  256  1.0000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1005  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.85 
 
 		 747 aa  256  1.0000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.64 
 
 		 995 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.43 
 
 		 1195 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0973  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.57 
 
 		 1064 aa  255  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2946  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  40.43 
 
 		 777 aa  255  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.51 
 
 		 882 aa  255  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.73 
 
 		 738 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0770  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.39 
 
 		 911 aa  255  3e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.989546 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>