More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6237 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6237  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 721 aa  1457    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703753 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6560  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  61.51 
 
 		 720 aa  840    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.646619 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5184  multi-sensor hybrid histidine kinase  53.91 
 
 		 939 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.0776559 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  53.52 
 
 		 989 aa  449  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  52.02 
 
 		 989 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  41.92 
 
 		 2051 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3975  Cache sensor hybrid histidine kinase  41.56 
 
 		 811 aa  362  1e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000222358  hitchhiker  0.00723661 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1117  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.68 
 
 		 770 aa  356  5.999999999999999e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4154  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.72 
 
 		 750 aa  345  2e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.22479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2148  Cache sensor hybrid histidine kinase  37.57 
 
 		 937 aa  343  9e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1017  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.65 
 
 		 1323 aa  341  2e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0385374  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3243  PAS sensor protein  43.4 
 
 		 1323 aa  337  5.999999999999999e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6547  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.51 
 
 		 865 aa  333  8e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.325935 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2508  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.99 
 
 		 784 aa  332  1e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.033945 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3211  histidine kinase  39.5 
 
 		 781 aa  323  8e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.306218  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.94 
 
 		 935 aa  316  9.999999999999999e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.96 
 
 		 1127 aa  309  1.0000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4135  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.92 
 
 		 922 aa  306  6e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000370631  normal  0.0140414 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4464  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.1 
 
 		 945 aa  306  1.0000000000000001e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0072  histidine kinase  41.19 
 
 		 810 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1762  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.71 
 
 		 1146 aa  303  8.000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.468259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 		 631 aa  302  1e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0808  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.84 
 
 		 929 aa  302  2e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07038  histidine kinase  32.74 
 
 		 641 aa  301  4e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1719  histidine kinase  43.36 
 
 		 1257 aa  300  6e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0583268  normal  0.402469 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.98 
 
 		 1611 aa  300  9e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1349  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.77 
 
 		 1578 aa  296  9e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2985  fused histidine kinase sensor/response regulator  39.45 
 
 		 1121 aa  295  2e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.446873 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2948  histidine kinase  39.86 
 
 		 800 aa  293  8e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549542  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2475  sensor histidine kinase/response regulator  33.08 
 
 		 784 aa  292  2e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.446979  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3586  sensor histidine kinase/response regulator  41.88 
 
 		 1153 aa  290  7e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1855  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.98 
 
 		 1285 aa  289  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4225  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.24 
 
 		 1322 aa  288  2.9999999999999996e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4079  sensor histidine kinase/response regulator  38 
 
 		 1161 aa  288  4e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5715  putative two-component sensor  36.19 
 
 		 750 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.901003  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65860  putative two-component sensor  36.19 
 
 		 770 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.407883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.66 
 
 		 1058 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1484  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.65 
 
 		 1002 aa  280  7e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1511  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.65 
 
 		 1002 aa  280  8e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0653  sensor histidine kinase  37.64 
 
 		 1124 aa  279  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.450749  normal  0.469118 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3868  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.21 
 
 		 1127 aa  279  1e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1251  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.39 
 
 		 1122 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0612415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3135  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.73 
 
 		 1187 aa  276  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3065  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.87 
 
 		 1128 aa  276  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0819  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.5 
 
 		 844 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1586  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.15 
 
 		 1178 aa  275  2.0000000000000002e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.830805  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0848  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.5 
 
 		 844 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3320  histidine kinase  40.09 
 
 		 1128 aa  272  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.515444 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3146  histidine kinase  40.27 
 
 		 1140 aa  271  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.353593  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3865  ATP-binding region, ATPase-like  38.8 
 
 		 1122 aa  270  8e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1082  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.68 
 
 		 1068 aa  268  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31862 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1302  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.1 
 
 		 1090 aa  267  4e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0842919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1273  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.1 
 
 		 1090 aa  267  5e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2687  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.08 
 
 		 784 aa  266  1e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.762737  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1442  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.57 
 
 		 1122 aa  264  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5667  histidine kinase  39.53 
 
 		 1140 aa  264  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2178  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.03 
 
 		 750 aa  264  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00477296  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3728  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.14 
 
 		 750 aa  263  8.999999999999999e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0975  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.48 
 
 		 1130 aa  263  1e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.537982 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2174  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.43 
 
 		 633 aa  261  2e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.634157  normal  0.649523 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3731  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.06 
 
 		 1140 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4637  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.06 
 
 		 1140 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.619414  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5067  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.34 
 
 		 1002 aa  261  3e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1353  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.56 
 
 		 1197 aa  261  3e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.18 
 
 		 1452 aa  259  1e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3498  two component sensor kinase  40.56 
 
 		 1125 aa  258  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1712  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.99 
 
 		 1173 aa  258  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0980923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4180  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.41 
 
 		 1126 aa  258  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0796198 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0592  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.48 
 
 		 1113 aa  259  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0114606 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3686  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  34.92 
 
 		 620 aa  258  3e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.926172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.67 
 
 		 995 aa  258  3e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.46 
 
 		 1433 aa  257  4e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1574  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.58 
 
 		 841 aa  258  4e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.66 
 
 		 1691 aa  257  4e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1087  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.92 
 
 		 1121 aa  256  7e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.740067  hitchhiker  0.00000751372 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2035  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.35 
 
 		 750 aa  256  7e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.8 
 
 		 932 aa  257  7e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1446  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  35.86 
 
 		 1131 aa  256  9e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.705679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2699  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.58 
 
 		 1099 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117538 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2218  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.21 
 
 		 1070 aa  256  1.0000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0765203 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3382  ATPase domain-containing protein  40.27 
 
 		 1071 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525319  normal  0.740946 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3398  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.12 
 
 		 1202 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.613847  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1082  histidine kinase  36.59 
 
 		 1220 aa  254  3e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1730  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.2 
 
 		 1195 aa  254  3e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.479441  normal  0.752594 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  42.56 
 
 		 1028 aa  254  3e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3691  histidine kinase  39.13 
 
 		 1071 aa  254  3e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  41.09 
 
 		 827 aa  255  3e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2976  two-component hybrid sensor and regulator  35.93 
 
 		 1132 aa  255  3e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.210238 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0401  sensor histidine kinase/response regulator  38.4 
 
 		 1392 aa  254  6e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0185  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.83 
 
 		 1214 aa  253  7e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467777  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.16 
 
 		 1199 aa  253  8.000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0342  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.4 
 
 		 827 aa  253  8.000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.01 
 
 		 817 aa  253  1e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4006  histidine kinase  34.67 
 
 		 736 aa  253  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155316  hitchhiker  0.00128379 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0658  histidine kinase  30.84 
 
 		 627 aa  253  1e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1217  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.99 
 
 		 803 aa  252  1e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.503931  normal  0.0882093 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2222  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.08 
 
 		 1120 aa  253  1e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201183 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.6 
 
 		 765 aa  253  1e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3573  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.31 
 
 		 1120 aa  251  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.17 
 
 		 977 aa  252  2e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>