More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1719 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1719  histidine kinase  100 
 
 		 1257 aa  2460    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0583268  normal  0.402469 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  28.1 
 
 		 1366 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  40.45 
 
 		 2051 aa  358  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4246  histidine kinase  28 
 
 		 1280 aa  358  3.9999999999999996e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.921248  normal  0.11404 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1117  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.16 
 
 		 770 aa  338  5e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5184  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.29 
 
 		 939 aa  336  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.0776559 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6560  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  44.11 
 
 		 720 aa  328  3e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.646619 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6547  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.27 
 
 		 865 aa  325  3e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.325935 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6237  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  44.42 
 
 		 721 aa  320  1e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703753 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4135  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.21 
 
 		 922 aa  318  5e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000370631  normal  0.0140414 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0808  multi-sensor hybrid histidine kinase  46 
 
 		 929 aa  316  1.9999999999999998e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3975  Cache sensor hybrid histidine kinase  35.43 
 
 		 811 aa  311  4e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000222358  hitchhiker  0.00723661 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1852  histidine kinase  30.84 
 
 		 1074 aa  306  1.0000000000000001e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.496494  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.97 
 
 		 1127 aa  303  2e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3211  histidine kinase  37.14 
 
 		 781 aa  302  3e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.306218  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1017  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.92 
 
 		 1323 aa  302  3e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0385374  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0072  histidine kinase  39.22 
 
 		 810 aa  301  4e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2148  Cache sensor hybrid histidine kinase  37.47 
 
 		 937 aa  300  1e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3135  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.65 
 
 		 1187 aa  300  1e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2508  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.84 
 
 		 784 aa  295  4e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.033945 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3243  PAS sensor protein  39.78 
 
 		 1323 aa  295  5e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.88 
 
 		 935 aa  292  2e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1762  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.46 
 
 		 1146 aa  287  8e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.468259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.6 
 
 		 1058 aa  286  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3586  sensor histidine kinase/response regulator  40.5 
 
 		 1153 aa  286  2.0000000000000002e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1855  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.35 
 
 		 1285 aa  286  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1349  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.81 
 
 		 1578 aa  285  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1082  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.5 
 
 		 1068 aa  285  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31862 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.58 
 
 		 1611 aa  284  7.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4225  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.35 
 
 		 1322 aa  282  2e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4154  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.8 
 
 		 750 aa  280  9e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.22479  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4464  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.58 
 
 		 945 aa  276  1.0000000000000001e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.29 
 
 		 989 aa  276  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2699  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.97 
 
 		 1099 aa  276  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117538 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2948  histidine kinase  40.47 
 
 		 800 aa  276  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3146  histidine kinase  41.21 
 
 		 1140 aa  275  3e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.353593  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0819  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.23 
 
 		 844 aa  275  6e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0848  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.23 
 
 		 844 aa  275  6e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.97 
 
 		 989 aa  274  8.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1586  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.11 
 
 		 1178 aa  271  5e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.830805  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1273  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.43 
 
 		 1090 aa  268  4e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0219  histidine kinase  38.39 
 
 		 1166 aa  268  4e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.803779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1302  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.43 
 
 		 1090 aa  268  5e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0842919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1574  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.08 
 
 		 841 aa  268  7e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0232  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  37.18 
 
 		 738 aa  259  2e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1446  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  35.12 
 
 		 1131 aa  260  2e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.705679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1511  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.26 
 
 		 1002 aa  259  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1712  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  42.94 
 
 		 1173 aa  259  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0980923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1484  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.26 
 
 		 1002 aa  259  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0592  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.16 
 
 		 1113 aa  258  6e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0114606 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1836  two component AraC family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 1341 aa  258  6e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2168  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.73 
 
 		 1204 aa  258  7e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172741 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1353  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.69 
 
 		 1197 aa  257  9e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1005  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.82 
 
 		 747 aa  257  9e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0670  sensor histidine kinase/response regulator  39.34 
 
 		 1170 aa  257  1.0000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.315036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3398  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.11 
 
 		 1202 aa  256  2.0000000000000002e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.613847  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5067  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.16 
 
 		 1002 aa  255  3e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2222  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.83 
 
 		 1120 aa  255  4.0000000000000004e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201183 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0975  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.37 
 
 		 1130 aa  254  6e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.537982 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3868  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.44 
 
 		 1127 aa  254  1e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4180  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 1126 aa  253  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0796198 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2174  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.26 
 
 		 633 aa  251  7e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.634157  normal  0.649523 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  38.21 
 
 		 1028 aa  251  8e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3846  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.63 
 
 		 860 aa  251  9e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4079  sensor histidine kinase/response regulator  34.65 
 
 		 1161 aa  250  1e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  25.63 
 
 		 1407 aa  248  4e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.93 
 
 		 1691 aa  248  4e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3065  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.92 
 
 		 1128 aa  248  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.41 
 
 		 817 aa  248  6e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3865  ATP-binding region, ATPase-like  33.46 
 
 		 1122 aa  248  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1217  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.01 
 
 		 803 aa  247  9.999999999999999e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.503931  normal  0.0882093 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1251  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.01 
 
 		 1122 aa  246  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0612415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3731  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.29 
 
 		 1140 aa  245  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4637  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.29 
 
 		 1140 aa  245  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.619414  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3320  histidine kinase  34.58 
 
 		 1128 aa  245  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.515444 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5667  histidine kinase  40.29 
 
 		 1140 aa  245  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2985  fused histidine kinase sensor/response regulator  32.57 
 
 		 1121 aa  244  7.999999999999999e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.446873 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0978  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.91 
 
 		 1175 aa  243  1e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  37.9 
 
 		 651 aa  243  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0648  sensor protein TorS  39.37 
 
 		 984 aa  242  2.9999999999999997e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.53 
 
 		 977 aa  242  2.9999999999999997e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3525  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.39 
 
 		 1197 aa  242  2.9999999999999997e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471601 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1730  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.83 
 
 		 1195 aa  241  6.999999999999999e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.479441  normal  0.752594 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3691  histidine kinase  37.14 
 
 		 1071 aa  240  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2976  two-component hybrid sensor and regulator  32.99 
 
 		 1132 aa  240  1e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.210238 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3699  histidine kinase  38.89 
 
 		 998 aa  240  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43670  putative sensor/response regulator hybrid  39.27 
 
 		 651 aa  240  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1772  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.51 
 
 		 1169 aa  239  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.914739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3573  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.67 
 
 		 1120 aa  239  3e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4037  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  37.39 
 
 		 659 aa  239  3e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3382  ATPase domain-containing protein  36.95 
 
 		 1071 aa  239  3e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525319  normal  0.740946 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000317  sensor protein TorS  38.54 
 
 		 987 aa  238  4e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.598131  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06119  histidine kinase  38.26 
 
 		 985 aa  238  4e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1442  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.94 
 
 		 1122 aa  238  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0653  sensor histidine kinase  32.94 
 
 		 1124 aa  238  6e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.450749  normal  0.469118 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.75 
 
 		 870 aa  237  1.0000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.28 
 
 		 1075 aa  236  1.0000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1782  PAS sensor protein  39.71 
 
 		 1125 aa  236  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.522243 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1353  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.64 
 
 		 1029 aa  236  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283316  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4574  histidine kinase  38.55 
 
 		 900 aa  236  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>