More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0975 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1442  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  59.73 
 
 		 1122 aa  1369    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3586  sensor histidine kinase/response regulator  52.84 
 
 		 1153 aa  1117    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3868  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  55 
 
 		 1127 aa  1197    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4079  sensor histidine kinase/response regulator  51.11 
 
 		 1161 aa  1131    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3498  two component sensor kinase  52.6 
 
 		 1125 aa  1140    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4239  histidine kinase  47 
 
 		 1211 aa  1004    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2985  fused histidine kinase sensor/response regulator  48.9 
 
 		 1121 aa  1107    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.446873 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0592  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  57.35 
 
 		 1113 aa  1216    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0114606 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1446  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  50.31 
 
 		 1131 aa  1065    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.705679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0219  histidine kinase  47.94 
 
 		 1166 aa  966    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.803779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3525  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  47.46 
 
 		 1197 aa  1019    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471601 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1586  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  48.8 
 
 		 1178 aa  1070    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.830805  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0653  sensor histidine kinase  59.41 
 
 		 1124 aa  1346    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.450749  normal  0.469118 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5513  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  54.88 
 
 		 1124 aa  1168    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.168644  normal  0.269782 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3320  histidine kinase  53.62 
 
 		 1128 aa  1189    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.515444 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3065  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  53.53 
 
 		 1128 aa  1188    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1251  multi-sensor hybrid histidine kinase  60.35 
 
 		 1122 aa  1394    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0612415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3398  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  48.08 
 
 		 1202 aa  1033    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.613847  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3573  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  56.76 
 
 		 1120 aa  1190    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2976  two-component hybrid sensor and regulator  51.1 
 
 		 1132 aa  1141    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.210238 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1762  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  49.25 
 
 		 1146 aa  1099    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.468259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  51.38 
 
 		 1127 aa  1118    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1353  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  48.57 
 
 		 1197 aa  1037    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1712  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  49.6 
 
 		 1173 aa  1039    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0980923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2001  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  51.9 
 
 		 1121 aa  1092    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3865  ATP-binding region, ATPase-like  59.56 
 
 		 1122 aa  1377    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5667  histidine kinase  49.52 
 
 		 1140 aa  1041    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4180  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  53.68 
 
 		 1126 aa  1177    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0796198 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3731  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  49.52 
 
 		 1140 aa  1040    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00879  two-component hybrid sensor and regulator  47.68 
 
 		 1100 aa  985    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1730  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  48.23 
 
 		 1195 aa  1020    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.479441  normal  0.752594 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0670  sensor histidine kinase/response regulator  48.36 
 
 		 1170 aa  1027    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.315036  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3146  histidine kinase  50.66 
 
 		 1140 aa  1045    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.353593  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4637  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  49.52 
 
 		 1140 aa  1040    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.619414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3691  histidine kinase  56.86 
 
 		 1071 aa  1129    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0975  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 1130 aa  2307    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.537982 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0961  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  47.46 
 
 		 1154 aa  1013    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.544458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1082  histidine kinase  47.22 
 
 		 1220 aa  1009    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0978  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  48.59 
 
 		 1175 aa  1026    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3382  ATPase domain-containing protein  56.77 
 
 		 1071 aa  1128    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525319  normal  0.740946 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1894  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.09 
 
 		 1085 aa  581  1e-164  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6438  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  50.37 
 
 		 573 aa  540  9.999999999999999e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.37 
 
 		 555 aa  538  1e-151  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3568  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.05 
 
 		 874 aa  511  1e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.489697 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0610  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin family protein  40.99 
 
 		 568 aa  399  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1280  hypothetical protein  40.26 
 
 		 596 aa  382  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.961931  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0985  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  39.55 
 
 		 575 aa  370  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0012046 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3405  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  38.39 
 
 		 570 aa  365  3e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.286515  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  37.8 
 
 		 2051 aa  306  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5184  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.6 
 
 		 939 aa  303  9e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.0776559 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4135  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.78 
 
 		 922 aa  295  3e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000370631  normal  0.0140414 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3211  histidine kinase  38.33 
 
 		 781 aa  286  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.306218  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2508  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.53 
 
 		 784 aa  285  3.0000000000000004e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.033945 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6547  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.29 
 
 		 865 aa  282  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.325935 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3243  PAS sensor protein  35.58 
 
 		 1323 aa  280  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1017  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.47 
 
 		 1323 aa  277  8e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0385374  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1664  histidine kinase  37.68 
 
 		 530 aa  277  8e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.586003  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13491  integral membrane protein  38.43 
 
 		 443 aa  275  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.134076 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3975  Cache sensor hybrid histidine kinase  35.52 
 
 		 811 aa  270  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000222358  hitchhiker  0.00723661 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1117  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.91 
 
 		 770 aa  263  1e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6237  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.48 
 
 		 721 aa  262  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703753 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0072  histidine kinase  38.57 
 
 		 810 aa  257  9e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1855  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.83 
 
 		 1285 aa  257  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.77 
 
 		 989 aa  254  7e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2148  Cache sensor hybrid histidine kinase  32.46 
 
 		 937 aa  253  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4154  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.02 
 
 		 750 aa  252  3e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.22479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.02 
 
 		 989 aa  250  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4225  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.54 
 
 		 1322 aa  249  2e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.49 
 
 		 1611 aa  249  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1082  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.46 
 
 		 1068 aa  249  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31862 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1349  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.63 
 
 		 1578 aa  247  9e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0808  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.46 
 
 		 929 aa  245  3e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2948  histidine kinase  36.72 
 
 		 800 aa  243  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.54 
 
 		 935 aa  243  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4464  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.77 
 
 		 945 aa  241  5.999999999999999e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6560  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 		 720 aa  240  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.646619 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5067  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.44 
 
 		 1002 aa  239  2e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2699  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.01 
 
 		 1099 aa  238  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117538 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0819  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.21 
 
 		 844 aa  238  6e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1302  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.78 
 
 		 1090 aa  238  6e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0842919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0848  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.21 
 
 		 844 aa  238  7e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1273  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.78 
 
 		 1090 aa  238  7e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.01 
 
 		 1058 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1005  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.19 
 
 		 747 aa  236  1.0000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1484  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.57 
 
 		 1002 aa  234  8.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1511  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.57 
 
 		 1002 aa  234  8.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1719  histidine kinase  34.91 
 
 		 1257 aa  234  9e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0583268  normal  0.402469 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3135  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.84 
 
 		 1187 aa  228  6e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1574  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.24 
 
 		 841 aa  227  1e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.1 
 
 		 1768 aa  226  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  33.5 
 
 		 1331 aa  224  8e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  35.49 
 
 		 544 aa  221  5e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.11 
 
 		 674 aa  221  7.999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.86 
 
 		 870 aa  220  1e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.84 
 
 		 1193 aa  220  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.84 
 
 		 1193 aa  219  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3312  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.14 
 
 		 1226 aa  218  7e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.65 
 
 		 1765 aa  218  7e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  35.6 
 
 		 1763 aa  215  3.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  34.74 
 
 		 1028 aa  213  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.101634 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>