78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6438 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6438  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  100 
 
 		 573 aa  1157    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  63.69 
 
 		 555 aa  713    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4079  sensor histidine kinase/response regulator  56.1 
 
 		 1161 aa  620  1e-176  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  55.84 
 
 		 1127 aa  609  1e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1762  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  51.95 
 
 		 1146 aa  589  1e-167  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.468259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3586  sensor histidine kinase/response regulator  54.7 
 
 		 1153 aa  585  1e-166  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5667  histidine kinase  52.05 
 
 		 1140 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4637  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  52.05 
 
 		 1140 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.619414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3731  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  52.05 
 
 		 1140 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1353  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  51.96 
 
 		 1197 aa  583  1.0000000000000001e-165  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1712  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  52.91 
 
 		 1173 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0980923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3398  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  52.12 
 
 		 1202 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.613847  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3146  histidine kinase  55.9 
 
 		 1140 aa  574  1.0000000000000001e-162  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.353593  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1586  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  54.6 
 
 		 1178 aa  572  1.0000000000000001e-162  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.830805  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3865  ATP-binding region, ATPase-like  51.5 
 
 		 1122 aa  569  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1251  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.87 
 
 		 1122 aa  571  1e-161  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0612415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2976  two-component hybrid sensor and regulator  52.23 
 
 		 1132 aa  565  1e-160  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.210238 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1442  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  50.75 
 
 		 1122 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0653  sensor histidine kinase  53 
 
 		 1124 aa  561  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.450749  normal  0.469118 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0670  sensor histidine kinase/response regulator  51.87 
 
 		 1170 aa  556  1e-157  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.315036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3868  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  52.34 
 
 		 1127 aa  554  1e-156  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4239  histidine kinase  50 
 
 		 1211 aa  552  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0219  histidine kinase  53.85 
 
 		 1166 aa  550  1e-155  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.803779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1280  hypothetical protein  52.6 
 
 		 596 aa  546  1e-154  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.961931  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3525  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  49.2 
 
 		 1197 aa  548  1e-154  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471601 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0978  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  50.56 
 
 		 1175 aa  545  1e-154  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1730  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  50.93 
 
 		 1195 aa  547  1e-154  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.479441  normal  0.752594 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1446  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  49.72 
 
 		 1131 aa  545  1e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.705679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1082  histidine kinase  50.09 
 
 		 1220 aa  541  9.999999999999999e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0610  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin family protein  53.26 
 
 		 568 aa  535  1e-151  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2001  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  50 
 
 		 1121 aa  535  1e-150  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0975  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  50.37 
 
 		 1130 aa  534  1e-150  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.537982 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1894  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.72 
 
 		 1085 aa  531  1e-149  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3320  histidine kinase  47.97 
 
 		 1128 aa  513  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.515444 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3065  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  48.98 
 
 		 1128 aa  514  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3405  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  49.83 
 
 		 570 aa  511  1e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.286515  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0592  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  50.28 
 
 		 1113 aa  509  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0114606 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0985  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  51.44 
 
 		 575 aa  506  9.999999999999999e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0012046 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2985  fused histidine kinase sensor/response regulator  45.83 
 
 		 1121 aa  504  1e-141  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.446873 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0961  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  47.04 
 
 		 1154 aa  504  1e-141  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.544458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4180  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  46.94 
 
 		 1126 aa  501  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0796198 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3498  two component sensor kinase  47.68 
 
 		 1125 aa  493  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00879  two-component hybrid sensor and regulator  46.18 
 
 		 1100 aa  493  9.999999999999999e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3573  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  47.75 
 
 		 1120 aa  484  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5513  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  47.58 
 
 		 1124 aa  480  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.168644  normal  0.269782 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3568  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.61 
 
 		 874 aa  456  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.489697 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3382  ATPase domain-containing protein  48.86 
 
 		 1071 aa  444  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525319  normal  0.740946 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3691  histidine kinase  48.86 
 
 		 1071 aa  444  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13491  integral membrane protein  50.49 
 
 		 443 aa  395  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.134076 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4598  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  26.24 
 
 		 493 aa  123  9e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13490  transmembrane protein  57.47 
 
 		 110 aa  111  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0601054 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2198  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.5 
 
 		 445 aa  63.2  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0171933  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2476  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.59 
 
 		 431 aa  61.6  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.584476  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0815  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.02 
 
 		 438 aa  60.8  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2380  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  22.8 
 
 		 432 aa  59.3  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.87122  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1044  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.22 
 
 		 438 aa  58.5  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.955284  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4194  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.16 
 
 		 431 aa  56.6  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3279  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.7 
 
 		 431 aa  56.6  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00201301  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3367  putative cytosine permease  26.7 
 
 		 439 aa  55.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.130336  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3584  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  23.21 
 
 		 438 aa  55.5  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22900  purine-cytosine permease-like transporter  25 
 
 		 455 aa  54.7  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.383587 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0413  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  22.63 
 
 		 432 aa  54.3  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1545  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  22.58 
 
 		 441 aa  52.8  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1965  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  24.74 
 
 		 439 aa  52  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6285  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin tranporter  25.45 
 
 		 451 aa  50.8  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.359285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2161  hypothetical protein  28.04 
 
 		 451 aa  50.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0269  hypothetical protein  28.04 
 
 		 451 aa  50.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.14281  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1184  hypothetical protein  28.04 
 
 		 451 aa  50.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.171029  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0898  hypothetical protein  28.04 
 
 		 448 aa  50.1  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1718  hypothetical protein  27.27 
 
 		 451 aa  50.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1885  hypothetical protein  28.04 
 
 		 451 aa  50.1  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0364  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  27.1 
 
 		 451 aa  49.7  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4407  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin tranporter  26.02 
 
 		 440 aa  48.9  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0426  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  23.99 
 
 		 448 aa  48.5  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.203282  normal  0.440595 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0360  hypothetical protein  27.1 
 
 		 451 aa  48.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3201  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  23.26 
 
 		 424 aa  46.2  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3060  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  21.92 
 
 		 460 aa  44.3  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2956  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin transporter  22.28 
 
 		 451 aa  43.5  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0619223  normal  0.882833 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>