42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2476 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2476  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  100 
 
 		 431 aa  858    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.584476  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2380  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  85.71 
 
 		 432 aa  734    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.87122  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1718  hypothetical protein  67.23 
 
 		 451 aa  518  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1184  hypothetical protein  67.23 
 
 		 451 aa  518  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.171029  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1885  hypothetical protein  67.23 
 
 		 451 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2161  hypothetical protein  67.23 
 
 		 451 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0269  hypothetical protein  67.23 
 
 		 451 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.14281  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0360  hypothetical protein  67.23 
 
 		 451 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0898  hypothetical protein  67.23 
 
 		 448 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6285  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin tranporter  65.87 
 
 		 451 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.359285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2956  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin transporter  65.7 
 
 		 451 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0619223  normal  0.882833 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0364  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  66.91 
 
 		 451 aa  495  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4407  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin tranporter  61.23 
 
 		 440 aa  444  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4598  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  25.06 
 
 		 493 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.04 
 
 		 555 aa  67  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3525  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  25.51 
 
 		 1197 aa  61.6  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471601 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1446  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  24.66 
 
 		 1131 aa  61.6  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.705679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0978  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  24.89 
 
 		 1175 aa  56.6  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6438  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.13 
 
 		 573 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3398  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  23.8 
 
 		 1202 aa  55.1  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.613847  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1730  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  24.04 
 
 		 1195 aa  54.3  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.479441  normal  0.752594 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  24.59 
 
 		 1127 aa  53.9  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1353  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  24.54 
 
 		 1197 aa  53.5  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4637  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  24.48 
 
 		 1140 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.619414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3731  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  24.48 
 
 		 1140 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0670  sensor histidine kinase/response regulator  23.89 
 
 		 1170 aa  52.8  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.315036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1762  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  23.71 
 
 		 1146 aa  52.8  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.468259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5667  histidine kinase  24.24 
 
 		 1140 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00879  two-component hybrid sensor and regulator  22.89 
 
 		 1100 aa  51.6  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1251  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.38 
 
 		 1122 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0612415  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4079  sensor histidine kinase/response regulator  26.46 
 
 		 1161 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4239  histidine kinase  23.39 
 
 		 1211 aa  50.4  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2001  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  23.88 
 
 		 1121 aa  49.7  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3498  two component sensor kinase  23.56 
 
 		 1125 aa  48.5  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3868  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  23.33 
 
 		 1127 aa  47  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2985  fused histidine kinase sensor/response regulator  23.16 
 
 		 1121 aa  46.2  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.446873 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3320  histidine kinase  23.39 
 
 		 1128 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.515444 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3065  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  22.4 
 
 		 1128 aa  44.3  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3865  ATP-binding region, ATPase-like  23.68 
 
 		 1122 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3146  histidine kinase  25.79 
 
 		 1140 aa  43.5  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.353593  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3691  histidine kinase  31.16 
 
 		 1071 aa  43.1  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3573  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.4 
 
 		 1120 aa  43.1  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>