47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2380 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2476  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  85.71 
 
 		 431 aa  734    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.584476  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2380  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  100 
 
 		 432 aa  865    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.87122  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1718  hypothetical protein  62.84 
 
 		 451 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1885  hypothetical protein  62.61 
 
 		 451 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2161  hypothetical protein  62.61 
 
 		 451 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0269  hypothetical protein  62.61 
 
 		 451 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.14281  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0360  hypothetical protein  62.61 
 
 		 451 aa  501  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1184  hypothetical protein  62.61 
 
 		 451 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.171029  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6285  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin tranporter  62.79 
 
 		 451 aa  504  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.359285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0898  hypothetical protein  63.02 
 
 		 448 aa  501  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2956  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin transporter  61.19 
 
 		 451 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0619223  normal  0.882833 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0364  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  62.1 
 
 		 451 aa  481  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4407  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin tranporter  59.85 
 
 		 440 aa  429  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.34 
 
 		 555 aa  73.6  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1446  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  26.18 
 
 		 1131 aa  72  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.705679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  24.52 
 
 		 1127 aa  67.8  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4079  sensor histidine kinase/response regulator  25.82 
 
 		 1161 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4598  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  23.65 
 
 		 493 aa  64.3  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0978  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  24.74 
 
 		 1175 aa  63.9  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0670  sensor histidine kinase/response regulator  24.72 
 
 		 1170 aa  63.2  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.315036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1730  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.1 
 
 		 1195 aa  61.2  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.479441  normal  0.752594 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3525  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  23.04 
 
 		 1197 aa  60.8  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471601 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1762  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  23.98 
 
 		 1146 aa  60.1  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.468259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3398  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  23.83 
 
 		 1202 aa  60.1  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.613847  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1353  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  26.58 
 
 		 1197 aa  58.9  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1251  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.09 
 
 		 1122 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0612415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3868  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  25.18 
 
 		 1127 aa  56.2  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4239  histidine kinase  23.83 
 
 		 1211 aa  55.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3865  ATP-binding region, ATPase-like  24.81 
 
 		 1122 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3065  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  23.06 
 
 		 1128 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3320  histidine kinase  22.84 
 
 		 1128 aa  55.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.515444 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6438  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  23.37 
 
 		 573 aa  54.3  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1082  histidine kinase  25.62 
 
 		 1220 aa  53.9  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00879  two-component hybrid sensor and regulator  23.02 
 
 		 1100 aa  53.9  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2001  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  25.62 
 
 		 1121 aa  53.1  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3731  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  24.59 
 
 		 1140 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4637  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  24.59 
 
 		 1140 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.619414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5667  histidine kinase  24.31 
 
 		 1140 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4180  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  22.59 
 
 		 1126 aa  51.6  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0796198 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1442  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  25 
 
 		 1122 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3586  sensor histidine kinase/response regulator  24.06 
 
 		 1153 aa  50.4  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3146  histidine kinase  25.88 
 
 		 1140 aa  48.9  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.353593  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3498  two component sensor kinase  25.66 
 
 		 1125 aa  48.9  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1280  hypothetical protein  23.35 
 
 		 596 aa  47.4  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.961931  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3568  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.28 
 
 		 874 aa  46.2  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.489697 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0653  sensor histidine kinase  25.55 
 
 		 1124 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.450749  normal  0.469118 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1894  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.29 
 
 		 1085 aa  44.3  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>