50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_0364 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1885  hypothetical protein  85.33 
 
 
451 aa  736    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2956  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin transporter  93.79 
 
 
451 aa  800    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0619223  normal  0.882833 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0364  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  100 
 
 
451 aa  892    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2161  hypothetical protein  85.33 
 
 
451 aa  736    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0269  hypothetical protein  85.33 
 
 
451 aa  736    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.14281  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0360  hypothetical protein  85.11 
 
 
451 aa  733    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1184  hypothetical protein  85.11 
 
 
451 aa  733    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.171029  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0898  hypothetical protein  85.23 
 
 
448 aa  729    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1718  hypothetical protein  85.33 
 
 
451 aa  737    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6285  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin tranporter  92.9 
 
 
451 aa  803    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.359285  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2476  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  67.63 
 
 
431 aa  545  1e-154  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.584476  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2380  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  62.79 
 
 
432 aa  531  1e-149  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.87122  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4407  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin tranporter  64.45 
 
 
440 aa  468  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4598  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  24.48 
 
 
493 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3065  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  25.47 
 
 
1128 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6438  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  23.68 
 
 
573 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3498  two component sensor kinase  25.51 
 
 
1125 aa  57.8  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3320  histidine kinase  25.06 
 
 
1128 aa  57.4  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.515444 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2985  fused histidine kinase sensor/response regulator  22.14 
 
 
1121 aa  57.4  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.446873 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1251  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.39 
 
 
1122 aa  57  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0612415  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3568  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.46 
 
 
874 aa  54.7  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.489697 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3865  ATP-binding region, ATPase-like  24.67 
 
 
1122 aa  53.9  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0670  sensor histidine kinase/response regulator  24.73 
 
 
1170 aa  53.9  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.315036  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.93 
 
 
555 aa  53.5  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3525  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.05 
 
 
1197 aa  51.6  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.471601 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1965  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  22.98 
 
 
439 aa  51.2  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1730  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  24.34 
 
 
1195 aa  50.8  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.479441  normal  0.752594 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00879  two-component hybrid sensor and regulator  22.5 
 
 
1100 aa  50.4  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0653  sensor histidine kinase  25.26 
 
 
1124 aa  50.1  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.450749  normal  0.469118 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3868  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  25.2 
 
 
1127 aa  50.1  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4079  sensor histidine kinase/response regulator  23.12 
 
 
1161 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2198  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  21.04 
 
 
445 aa  49.7  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0171933  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1353  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  25.65 
 
 
1197 aa  48.5  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1446  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  24.23 
 
 
1131 aa  47.4  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.705679  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0978  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.93 
 
 
1175 aa  47.4  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1442  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  22.8 
 
 
1122 aa  47  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4637  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  24.4 
 
 
1140 aa  47  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.619414  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3731  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  24.4 
 
 
1140 aa  47  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5667  histidine kinase  24.4 
 
 
1140 aa  47  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1712  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  29.19 
 
 
1173 aa  46.6  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0980923  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 
1127 aa  46.2  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3691  histidine kinase  28.57 
 
 
1071 aa  45.1  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1082  histidine kinase  27.27 
 
 
1220 aa  44.7  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3382  ATPase domain-containing protein  28.57 
 
 
1071 aa  45.1  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525319  normal  0.740946 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4180  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.32 
 
 
1126 aa  45.1  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0796198 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1762  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  22.27 
 
 
1146 aa  44.7  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.468259  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4239  histidine kinase  26.13 
 
 
1211 aa  43.5  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2700  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.06 
 
 
1102 aa  43.5  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2001  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.83 
 
 
1121 aa  43.1  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3573  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.73 
 
 
1120 aa  43.1  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>