198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_1965 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_1965  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  100 
 
 
439 aa  871    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3584  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  53.76 
 
 
438 aa  481  1e-135  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1545  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  53.26 
 
 
441 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2198  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  47.09 
 
 
445 aa  437  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0171933  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3060  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  42.79 
 
 
460 aa  388  1e-107  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1044  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  45.22 
 
 
438 aa  365  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.955284  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0426  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  44.2 
 
 
448 aa  362  1e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.203282  normal  0.440595 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0815  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  43.3 
 
 
438 aa  358  9.999999999999999e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3279  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  42.89 
 
 
431 aa  344  2e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00201301  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0413  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  42.17 
 
 
432 aa  343  4e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4194  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  41.85 
 
 
431 aa  342  7e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22900  purine-cytosine permease-like transporter  42.75 
 
 
455 aa  331  1e-89  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.383587 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3201  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  41.09 
 
 
424 aa  317  2e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3367  putative cytosine permease  39.95 
 
 
439 aa  312  7.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.130336  normal  0.0781791 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2449  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  29.72 
 
 
453 aa  155  1e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0862  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  31.16 
 
 
455 aa  155  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000967478  normal  0.747959 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000566  cytosine/purine/uracil/thiamine/allantoin permease family protein  27.27 
 
 
412 aa  138  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113273  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0539  cytosine permease  29.12 
 
 
416 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05700  cytosine permease  29.12 
 
 
416 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1828  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  26.59 
 
 
455 aa  135  9.999999999999999e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05320  cytosine permease  27.29 
 
 
412 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00290  cytosine transporter  27.88 
 
 
419 aa  134  3e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3270  NCS1 nucleoside transporter family  27.88 
 
 
419 aa  134  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3289  cytosine permease  27.88 
 
 
419 aa  134  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3524  cytosine permease  28.54 
 
 
417 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0367  cytosine permease  27.88 
 
 
419 aa  134  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.506759 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00294  hypothetical protein  27.88 
 
 
419 aa  134  3e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0360  cytosine permease  27.88 
 
 
419 aa  134  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3631  cytosine permease  28.54 
 
 
425 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.822935 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0409  cytosine permease  27.88 
 
 
419 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0401  cytosine permease  27.88 
 
 
419 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3596  cytosine permease  28.3 
 
 
417 aa  133  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1725  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  27.27 
 
 
434 aa  127  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0016  cytosine permease  26.12 
 
 
417 aa  124  4e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2188  cytosine permease  27.94 
 
 
421 aa  123  6e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3693  cytosine permease  29.02 
 
 
425 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3526  cytosine permease  28.78 
 
 
449 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2802  cytosine permease  28.54 
 
 
421 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.018065  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0157  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin family permease  27.06 
 
 
460 aa  116  8.999999999999998e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.489113  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0630  cytosine permease  27.1 
 
 
417 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.201877  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1993  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  26.57 
 
 
443 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0843  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.47 
 
 
420 aa  114  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.27545  normal  0.552006 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0863  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.13 
 
 
440 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3778  cytosine permease  26.74 
 
 
423 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4197  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin family permease  25.63 
 
 
407 aa  107  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118639 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3467  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  27.11 
 
 
439 aa  106  7e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00980  purine-cytosine permease-like transporter  25 
 
 
427 aa  103  7e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1584  cytosine permease  23.71 
 
 
417 aa  102  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1854  cytosine permease  28.76 
 
 
395 aa  101  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.382094  hitchhiker  0.0000028856 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03710  putative permease  25.63 
 
 
407 aa  101  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03659  hypothetical protein  25.63 
 
 
407 aa  101  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2529  cytosine permease  22.87 
 
 
421 aa  99.8  9e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0365158  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3187  cytosine permease  22.63 
 
 
421 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2351  cytosine permease  23.02 
 
 
411 aa  96.3  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0779  cytosine permease  23.47 
 
 
421 aa  94.7  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.99673  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2654  cytosine permease  22.53 
 
 
421 aa  94  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1591  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.19 
 
 
456 aa  92.8  9e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2208  cytosine permease  22.41 
 
 
421 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.739585 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2453  cytosine permease  26.89 
 
 
414 aa  89.7  9e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0801  cytosine permease  22.78 
 
 
431 aa  89.4  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141599  normal  0.241333 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2759  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.94 
 
 
457 aa  89  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4598  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  22.51 
 
 
493 aa  87  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4035  NCS1 nucleoside transporter  26.75 
 
 
496 aa  87  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1803  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  26.75 
 
 
496 aa  87  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.666463  normal  0.799889 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3637  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  26.49 
 
 
505 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1118  cytosine permease  20.95 
 
 
441 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1032  cytosine permease  20.95 
 
 
441 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2333  cytosine permease  20.95 
 
 
420 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05790  putative transporter  24.4 
 
 
496 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3440  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  25.81 
 
 
494 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.709152  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0546  putative transporter  24.4 
 
 
496 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1111  NCS1 nucleoside transporter  27.03 
 
 
494 aa  84  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.502762  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0866  cytosine permease  20.69 
 
 
441 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1833  cytosine permease  20.69 
 
 
441 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0184024  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0601  cytosine permease  20.69 
 
 
420 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1641  cytosine permease  20.42 
 
 
420 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.18791  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1837  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  26.23 
 
 
500 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.524757  normal  0.0916284 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2841  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  25.96 
 
 
444 aa  77.8  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.810699  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0650  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.82 
 
 
472 aa  76.6  0.0000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0343903 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0640  hydroxymethylpyrimidine transporter CytX  23.87 
 
 
438 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1794  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  25.06 
 
 
446 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2771  putative hydroxymethylpyrimidine transporter CytX  21.59 
 
 
446 aa  72.4  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0255944  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0338  NCS1 nucleoside transporter  24.75 
 
 
496 aa  69.7  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0257  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  22.12 
 
 
458 aa  65.5  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000119311  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0843  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.34 
 
 
488 aa  65.1  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00768  cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin transporter  25.4 
 
 
499 aa  64.7  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0564  hypothetical protein  22.6 
 
 
487 aa  65.1  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.824593 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2688  NCS1 nucleoside transporter family  24.8 
 
 
503 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.931856  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1430  NCS1 family nucleobase/cation symporter  24.52 
 
 
503 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4056  NCS1 nucleoside transporter  22.93 
 
 
515 aa  63.9  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3437  nucleobase/cation symporter, (NCS1) family  22.67 
 
 
438 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1533  NCS1 nucleoside transporter  24.44 
 
 
503 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.578632  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4797  putative hydroxymethylpyrimidine transporter CytX  23.83 
 
 
427 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3590  NCS1 nucleoside transporter  25.13 
 
 
490 aa  62.8  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.483466 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2863  NCS1 nucleoside transporter  26.15 
 
 
497 aa  62.8  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4536  NCS1 nucleoside transporter family  23.49 
 
 
533 aa  62.4  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.854613  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1042  hydroxymethylpyrimidine transporter CytX  21.9 
 
 
438 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144538  normal  0.528331 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2959  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.2 
 
 
468 aa  60.8  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3034  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  24.42 
 
 
448 aa  60.5  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4921  NCS1 nucleoside transporter  23.1 
 
 
427 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0951814  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>