122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2453 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2453  cytosine permease  100 
 
 		 414 aa  809    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2351  cytosine permease  54.92 
 
 		 411 aa  404  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1584  cytosine permease  53 
 
 		 417 aa  396  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3778  cytosine permease  56.61 
 
 		 423 aa  369  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0843  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  52.51 
 
 		 420 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.27545  normal  0.552006 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2529  cytosine permease  49.38 
 
 		 421 aa  353  4e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0365158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2208  cytosine permease  50.26 
 
 		 421 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.739585 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2654  cytosine permease  50.37 
 
 		 421 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0779  cytosine permease  48.97 
 
 		 421 aa  351  2e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.99673  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0801  cytosine permease  49.11 
 
 		 431 aa  350  4e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141599  normal  0.241333 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3187  cytosine permease  49.13 
 
 		 421 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1641  cytosine permease  50.64 
 
 		 420 aa  343  4e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.18791  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1118  cytosine permease  50.13 
 
 		 441 aa  343  4e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1032  cytosine permease  49.87 
 
 		 441 aa  342  8e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2333  cytosine permease  50.13 
 
 		 420 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0601  cytosine permease  49.87 
 
 		 420 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0866  cytosine permease  49.87 
 
 		 441 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1833  cytosine permease  49.87 
 
 		 441 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0184024  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05700  cytosine permease  42.79 
 
 		 416 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05320  cytosine permease  39.5 
 
 		 412 aa  240  4e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0539  cytosine permease  42.79 
 
 		 416 aa  239  5e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000566  cytosine/purine/uracil/thiamine/allantoin permease family protein  40.78 
 
 		 412 aa  237  3e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113273  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0863  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  44.5 
 
 		 440 aa  236  8e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0016  cytosine permease  35.52 
 
 		 417 aa  228  2e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00980  purine-cytosine permease-like transporter  38.9 
 
 		 427 aa  225  1e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0630  cytosine permease  40.43 
 
 		 417 aa  215  9.999999999999999e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.201877  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3524  cytosine permease  39.01 
 
 		 417 aa  210  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3631  cytosine permease  39.01 
 
 		 425 aa  210  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.822935 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2802  cytosine permease  39.45 
 
 		 421 aa  209  6e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.018065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3596  cytosine permease  38.77 
 
 		 417 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0360  cytosine permease  37.71 
 
 		 419 aa  205  1e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0409  cytosine permease  37.71 
 
 		 419 aa  204  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00290  cytosine transporter  37.71 
 
 		 419 aa  204  3e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3270  NCS1 nucleoside transporter family  37.71 
 
 		 419 aa  204  3e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0401  cytosine permease  38 
 
 		 419 aa  204  3e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3289  cytosine permease  37.71 
 
 		 419 aa  204  3e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0367  cytosine permease  37.71 
 
 		 419 aa  204  3e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.506759 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00294  hypothetical protein  37.71 
 
 		 419 aa  204  3e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2188  cytosine permease  37.66 
 
 		 421 aa  203  4e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3526  cytosine permease  39.01 
 
 		 449 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3693  cytosine permease  38.77 
 
 		 425 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1854  cytosine permease  38.83 
 
 		 395 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.382094  hitchhiker  0.0000028856 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0157  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin family permease  27.4 
 
 		 460 aa  127  4.0000000000000003e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.489113  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0426  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  28.8 
 
 		 448 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.203282  normal  0.440595 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2198  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  27.3 
 
 		 445 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0171933  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3279  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  27.37 
 
 		 431 aa  107  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00201301  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3060  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  26.42 
 
 		 460 aa  106  8e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1725  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  27.3 
 
 		 434 aa  104  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22900  purine-cytosine permease-like transporter  28.08 
 
 		 455 aa  103  5e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.383587 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4194  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.69 
 
 		 431 aa  103  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0862  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.64 
 
 		 455 aa  101  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000967478  normal  0.747959 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1993  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.38 
 
 		 443 aa  97.1  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3584  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.81 
 
 		 438 aa  94.4  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0815  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  26.29 
 
 		 438 aa  93.6  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1965  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  26.89 
 
 		 439 aa  91.7  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2449  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.35 
 
 		 453 aa  90.9  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1044  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.8 
 
 		 438 aa  90.9  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.955284  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1828  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  26.12 
 
 		 455 aa  87.4  5e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0413  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.58 
 
 		 432 aa  85.1  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3201  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  26.47 
 
 		 424 aa  84  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3367  putative cytosine permease  27.65 
 
 		 439 aa  82  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.130336  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1545  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  26.56 
 
 		 441 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4197  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin family permease  24.46 
 
 		 407 aa  77  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118639 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0650  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  26.59 
 
 		 472 aa  75.5  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0343903 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03710  putative permease  23.91 
 
 		 407 aa  73.6  0.000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03659  hypothetical protein  23.91 
 
 		 407 aa  73.6  0.000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3467  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  23.17 
 
 		 439 aa  72.4  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1591  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  23.6 
 
 		 456 aa  66.2  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4035  NCS1 nucleoside transporter  25.47 
 
 		 496 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1803  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  25.47 
 
 		 496 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.666463  normal  0.799889 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3637  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.2 
 
 		 505 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1140  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  26.15 
 
 		 476 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.146583 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2066  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.61 
 
 		 534 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4150  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  24.81 
 
 		 494 aa  55.5  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4797  putative hydroxymethylpyrimidine transporter CytX  24.09 
 
 		 427 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1249  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  27.01 
 
 		 476 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0960267  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1221  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  27.01 
 
 		 476 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2759  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  22.5 
 
 		 457 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4921  NCS1 nucleoside transporter  24.09 
 
 		 427 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0951814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0768  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  27.01 
 
 		 435 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.283527  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3440  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  24.8 
 
 		 494 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.709152  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4072  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.13 
 
 		 450 aa  53.1  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3697  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  26.22 
 
 		 538 aa  53.1  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5168  NCS1 nucleoside transporter family  28.46 
 
 		 524 aa  53.1  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.409771 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4974  hydroxymethylpyrimidine transporter CytX  23.3 
 
 		 427 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4383  cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin transporter  26.53 
 
 		 476 aa  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67340  putative permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  27.27 
 
 		 480 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1129  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  24.86 
 
 		 476 aa  51.2  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1233  transporter transmembrane protein  22.98 
 
 		 502 aa  50.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0759006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05790  putative transporter  25.71 
 
 		 496 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2863  NCS1 nucleoside transporter  23.42 
 
 		 497 aa  50.4  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0417  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin permease family protein  27.82 
 
 		 474 aa  50.1  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.370818  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1795  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin permease family protein  27.82 
 
 		 474 aa  50.1  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2380  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin family permease  26.92 
 
 		 474 aa  50.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0465  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin family permease  27.82 
 
 		 474 aa  50.1  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.446257  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0546  putative transporter  25.99 
 
 		 496 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4713  hydroxymethylpyrimidine transporter CytX  24.71 
 
 		 427 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.244042 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0831  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin permease family protein  26.92 
 
 		 474 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.831321  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2519  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin family permease  27.55 
 
 		 474 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1794  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  24.85 
 
 		 446 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>