256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2863 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6713  NCS1 nucleoside transporter  64.94 
 
 		 502 aa  634    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.997894 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1430  NCS1 family nucleobase/cation symporter  65.09 
 
 		 503 aa  635    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5352  NCS1 nucleoside transporter  67.74 
 
 		 502 aa  638    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.157454 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1533  NCS1 nucleoside transporter  65.15 
 
 		 503 aa  641    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.578632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2863  NCS1 nucleoside transporter  100 
 
 		 497 aa  996    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2688  NCS1 nucleoside transporter family  64.89 
 
 		 503 aa  633  1e-180  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.931856  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1233  transporter transmembrane protein  66.53 
 
 		 502 aa  628  1e-179  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0759006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5720  NCS1 nucleoside transporter  65.62 
 
 		 502 aa  628  1e-179  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244182  normal  0.497544 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1594  NCS1 nucleoside transporter  66.39 
 
 		 502 aa  630  1e-179  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5964  NCS1 nucleoside transporter  65.62 
 
 		 502 aa  628  1e-179  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0145337  normal  0.627469 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6237  NCS1 nucleoside transporter  66.39 
 
 		 502 aa  630  1e-179  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.155037 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6657  cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin transporter  65.54 
 
 		 502 aa  626  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal  0.0268783 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2385  NCS1 nucleoside transporter family  60.21 
 
 		 492 aa  591  1e-168  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1985  NCS1 nucleoside transporter family  60.21 
 
 		 517 aa  588  1e-166  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.671932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3590  NCS1 nucleoside transporter  62.32 
 
 		 490 aa  579  1e-164  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.483466 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00768  cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin transporter  57.57 
 
 		 499 aa  540  9.999999999999999e-153  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1111  NCS1 nucleoside transporter  53.62 
 
 		 494 aa  521  1e-146  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.502762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0338  NCS1 nucleoside transporter  54.18 
 
 		 496 aa  502  1e-141  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4536  NCS1 nucleoside transporter family  50 
 
 		 533 aa  457  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.854613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4150  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  48.36 
 
 		 494 aa  452  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3444  NCS1 nucleoside transporter family  48.74 
 
 		 507 aa  449  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000477865  normal  0.0865773 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0968  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  49.26 
 
 		 489 aa  438  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.553781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0222  NCS1 nucleoside transporter  47.67 
 
 		 509 aa  417  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5168  NCS1 nucleoside transporter family  48.17 
 
 		 524 aa  401  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.409771 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2101  NCS1 nucleoside transporter family  47.17 
 
 		 500 aa  396  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49824  NCS1 family transporter: cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin  45.03 
 
 		 532 aa  390  1e-107  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2210  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  43.98 
 
 		 502 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4056  NCS1 nucleoside transporter  39.88 
 
 		 515 aa  342  7e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3637  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  40.65 
 
 		 505 aa  341  2e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4035  NCS1 nucleoside transporter  40.76 
 
 		 496 aa  335  9e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1837  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  42.02 
 
 		 500 aa  335  9e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.524757  normal  0.0916284 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1803  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  40.76 
 
 		 496 aa  335  9e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.666463  normal  0.799889 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3440  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  40.76 
 
 		 494 aa  334  3e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.709152  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05790  putative transporter  41.99 
 
 		 496 aa  332  9e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0546  putative transporter  42.19 
 
 		 496 aa  331  2e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2834  NCS1 nucleoside transporter  35.02 
 
 		 482 aa  265  1e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1918  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  34.84 
 
 		 503 aa  262  1e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.991169 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0230  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  33.41 
 
 		 486 aa  252  8.000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.239977 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5371  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  34.16 
 
 		 484 aa  252  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.583261  normal  0.663394 
 
 
-
 
NC_004310  BR1908  NCS1 nucleoside transporter family protein  32.39 
 
 		 487 aa  251  3e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.535002  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4033  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  32.92 
 
 		 497 aa  249  8e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0075  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  33.6 
 
 		 485 aa  248  1e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.82012  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1836  NCS1 nucleoside transporter family protein  32.38 
 
 		 487 aa  248  2e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.729443  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5091  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  34.24 
 
 		 483 aa  247  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415087  normal  0.0197454 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2764  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  36.03 
 
 		 517 aa  247  4e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.63902 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0400  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  31.86 
 
 		 483 aa  241  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0904039 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3578  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  33.05 
 
 		 486 aa  239  9e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.190049 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3531  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  31.26 
 
 		 483 aa  238  3e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0729525 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4599  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  34.39 
 
 		 490 aa  236  5.0000000000000005e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0913  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  31.1 
 
 		 486 aa  236  8e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1871  cytosine/purine/uracil/thiamine/allantoin permease family protein  30.84 
 
 		 483 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0335  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  34.39 
 
 		 483 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08416  conserved hypothetical protein  31.6 
 
 		 527 aa  232  1e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1756  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  33.68 
 
 		 514 aa  231  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1110  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  29.51 
 
 		 494 aa  231  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.852121  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1056  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin family permease  29.51 
 
 		 494 aa  230  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2680  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin family permease  29.51 
 
 		 494 aa  230  4e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0268197 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0866  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  31.06 
 
 		 494 aa  230  5e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1431  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  32.45 
 
 		 486 aa  229  7e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1389  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  32.3 
 
 		 530 aa  229  1e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.461228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5237  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  30.59 
 
 		 543 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.111402  normal  0.975867 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2516  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  31.67 
 
 		 479 aa  228  2e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.751632  normal  0.0734451 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2703  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  32.5 
 
 		 492 aa  228  3e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1778  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  33.4 
 
 		 506 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4869  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  30.59 
 
 		 518 aa  228  3e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4958  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  30.59 
 
 		 518 aa  228  3e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0843  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  33.79 
 
 		 488 aa  227  5.0000000000000005e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00690  uracil permease, putative  32.04 
 
 		 560 aa  225  1e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2039  cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin transporter  32.63 
 
 		 516 aa  225  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0859563  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4336  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  32.98 
 
 		 516 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0269962  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0898  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  30.93 
 
 		 493 aa  225  2e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4030  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  32.98 
 
 		 516 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0915622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3494  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  32.98 
 
 		 516 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000614437 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1558  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  32.98 
 
 		 510 aa  223  6e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3875  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  32.77 
 
 		 510 aa  223  7e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.245681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3636  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  33.18 
 
 		 510 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.542262  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4309  NCS1 nucleoside transporter  32.77 
 
 		 510 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1280  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  32.22 
 
 		 483 aa  221  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2087  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  32.28 
 
 		 485 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.611219 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3935  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  30.72 
 
 		 497 aa  220  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461112  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0582  putative permease  34.08 
 
 		 575 aa  219  7e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0932  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  31.52 
 
 		 517 aa  219  8.999999999999998e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06230  putative permease  33.88 
 
 		 575 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.037417 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1098  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  31.52 
 
 		 514 aa  218  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.286175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3769  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  30.77 
 
 		 547 aa  216  8e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0656  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  30.31 
 
 		 494 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.871285  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1298  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  31.75 
 
 		 496 aa  212  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0843718  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3430  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  31.45 
 
 		 520 aa  211  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1302  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  31.41 
 
 		 498 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2331  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  31.47 
 
 		 493 aa  210  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.55059 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0472  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  30.08 
 
 		 478 aa  210  6e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00461  predicted allantoin transporter  31.49 
 
 		 484 aa  209  1e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.592868  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3102  NCS1 nucleoside transporter family  31.49 
 
 		 484 aa  209  1e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3112  allantoin permease  31.49 
 
 		 484 aa  209  1e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.379099 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3810  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  31.86 
 
 		 497 aa  209  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4265  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  32.22 
 
 		 503 aa  209  1e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.864327 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00466  hypothetical protein  31.49 
 
 		 484 aa  209  1e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.955616  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0584  allantoin permease  31.49 
 
 		 484 aa  208  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0547  allantoin permease  31.49 
 
 		 484 aa  208  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0553  allantoin permease  31.15 
 
 		 484 aa  206  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.962113 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>