166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2331 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1880  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  83.71 
 
 
494 aa  797    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425689  normal  0.296294 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3935  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  69.33 
 
 
497 aa  704    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461112  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5845  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  69.51 
 
 
499 aa  689    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149577 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2331  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  100 
 
 
493 aa  984    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.55059 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1510  NCS1 nucleoside transporter family protein  82.22 
 
 
496 aa  792    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1298  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  71.1 
 
 
496 aa  678    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0843718  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2535  NCS1 nucleoside transporter family protein  82.22 
 
 
534 aa  793    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.173195  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5280  permease  83.91 
 
 
494 aa  808    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0491741 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2065  NCS1 nucleoside transporter family protein  83.17 
 
 
496 aa  796    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1924  NCS1 family nucleobase/cation symporter  95.94 
 
 
493 aa  928    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.713736 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6112  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  83.54 
 
 
494 aa  798    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4869  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  68.33 
 
 
518 aa  657    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1953  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  83.5 
 
 
494 aa  796    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1965  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  83.54 
 
 
494 aa  798    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1302  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  89.66 
 
 
498 aa  873    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155408  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4958  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  68.33 
 
 
518 aa  657    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0932  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  65.75 
 
 
517 aa  653    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1098  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  72.57 
 
 
514 aa  710    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.286175  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2009  NCS1 nucleoside transporter family protein  82.22 
 
 
510 aa  792    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3810  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  70.89 
 
 
497 aa  694    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3301  NCS1 nucleoside transporter family protein  82.22 
 
 
534 aa  793    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2390  NCS1 nucleoside transporter family protein  82.22 
 
 
496 aa  792    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2434  NCS1 nucleoside transporter family protein  82.42 
 
 
510 aa  794    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5237  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  68.12 
 
 
543 aa  655    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.111402  normal  0.975867 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1281  NCS1 nucleoside transporter family protein  82.22 
 
 
496 aa  792    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.425173  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1989  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  83.74 
 
 
494 aa  799    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.598133  normal  0.623135 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1305  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  83.94 
 
 
494 aa  809    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0354634 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1814  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  67.71 
 
 
522 aa  634  1e-180  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.627915  normal  0.010101 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1871  cytosine/purine/uracil/thiamine/allantoin permease family protein  66.88 
 
 
483 aa  608  1e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3531  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  66.31 
 
 
483 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0729525 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3430  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  61.52 
 
 
520 aa  598  1e-170  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0866  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  62.32 
 
 
494 aa  593  1e-168  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2680  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin family permease  60.5 
 
 
494 aa  589  1e-167  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0268197 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1056  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin family permease  60.5 
 
 
494 aa  589  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0913  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  61.83 
 
 
486 aa  591  1e-167  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1110  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  60.29 
 
 
494 aa  588  1e-166  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.852121  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3769  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  62.63 
 
 
547 aa  586  1e-166  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0656  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  62.63 
 
 
494 aa  578  1e-164  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.871285  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0898  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  61.8 
 
 
493 aa  575  1.0000000000000001e-163  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0472  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  57.58 
 
 
478 aa  511  1e-144  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2834  NCS1 nucleoside transporter  52.79 
 
 
482 aa  475  1e-133  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4033  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  45.05 
 
 
497 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4265  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  43.8 
 
 
503 aa  394  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.864327 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0843  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  43.87 
 
 
488 aa  386  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2039  cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin transporter  41.25 
 
 
516 aa  380  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0859563  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1756  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  41.67 
 
 
514 aa  373  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3494  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  40.83 
 
 
516 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000614437 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4336  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  41.04 
 
 
516 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0269962  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4030  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  41.04 
 
 
516 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0915622  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4599  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  43.23 
 
 
490 aa  369  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4309  NCS1 nucleoside transporter  42.83 
 
 
510 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747865  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1558  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  41.67 
 
 
510 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462684  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1778  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  43.34 
 
 
506 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3875  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  42.76 
 
 
510 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.245681  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1918  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  40.3 
 
 
503 aa  359  7e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.991169 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3636  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  41.67 
 
 
510 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.542262  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06230  putative permease  42.18 
 
 
575 aa  346  5e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.037417 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0582  putative permease  42.46 
 
 
575 aa  346  5e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0075  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  40.04 
 
 
485 aa  344  2e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.82012  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3194  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  41.02 
 
 
522 aa  342  1e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3170  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  42.23 
 
 
536 aa  341  1e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185762  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2027  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  42.8 
 
 
515 aa  334  2e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0335  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  40.44 
 
 
483 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1836  NCS1 nucleoside transporter family protein  40.34 
 
 
487 aa  327  4.0000000000000003e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.729443  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1908  NCS1 nucleoside transporter family protein  40.34 
 
 
487 aa  321  1.9999999999999998e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.535002  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2764  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  39.56 
 
 
517 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.63902 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3413  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  39.72 
 
 
569 aa  316  5e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0400  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  39.29 
 
 
483 aa  313  4.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0904039 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5371  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  38.53 
 
 
484 aa  302  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.583261  normal  0.663394 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5091  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  38.82 
 
 
483 aa  302  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415087  normal  0.0197454 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1280  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  39.08 
 
 
483 aa  298  1e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2087  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  40.13 
 
 
485 aa  290  4e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.611219 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3578  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  38 
 
 
486 aa  286  7e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.190049 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2101  NCS1 nucleoside transporter family  32.86 
 
 
500 aa  248  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4536  NCS1 nucleoside transporter family  35.44 
 
 
533 aa  242  1e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.854613  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5168  NCS1 nucleoside transporter family  32.8 
 
 
524 aa  232  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.409771 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2385  NCS1 nucleoside transporter family  34.31 
 
 
492 aa  229  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1985  NCS1 nucleoside transporter family  33.89 
 
 
517 aa  226  1e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.671932  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2863  NCS1 nucleoside transporter  31.42 
 
 
497 aa  222  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0222  NCS1 nucleoside transporter  36.61 
 
 
509 aa  221  3e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3444  NCS1 nucleoside transporter family  31.11 
 
 
507 aa  209  7e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000477865  normal  0.0865773 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0230  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  30.96 
 
 
486 aa  209  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.239977 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3590  NCS1 nucleoside transporter  32.51 
 
 
490 aa  207  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.483466 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00768  cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin transporter  32.53 
 
 
499 aa  206  5e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0575  allantoin permease  30 
 
 
484 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.240762  normal  0.88047 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0568  allantoin permease  29.79 
 
 
484 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0570  allantoin permease  30 
 
 
484 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.635464  normal  0.884181 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0629  allantoin permease  29.79 
 
 
484 aa  203  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1533  NCS1 nucleoside transporter  30.28 
 
 
503 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.578632  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1430  NCS1 family nucleobase/cation symporter  30.53 
 
 
503 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0611  allantoin permease  29.36 
 
 
463 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2688  NCS1 nucleoside transporter family  30.1 
 
 
503 aa  197  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.931856  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0553  allantoin permease  29.18 
 
 
484 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.962113 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0547  allantoin permease  29.15 
 
 
484 aa  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00461  predicted allantoin transporter  28.94 
 
 
484 aa  195  1e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.592868  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3102  NCS1 nucleoside transporter family  28.94 
 
 
484 aa  195  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00466  hypothetical protein  28.94 
 
 
484 aa  195  1e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.955616  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3112  allantoin permease  28.94 
 
 
484 aa  195  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.379099 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1233  transporter transmembrane protein  29.86 
 
 
502 aa  193  6e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0759006  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0584  allantoin permease  28.72 
 
 
484 aa  193  6e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>