218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0968 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0968  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  100 
 
 
489 aa  969    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.553781  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4150  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  84.87 
 
 
494 aa  818    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2863  NCS1 nucleoside transporter  49.48 
 
 
497 aa  443  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2385  NCS1 nucleoside transporter family  48.44 
 
 
492 aa  436  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00768  cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin transporter  49.9 
 
 
499 aa  435  1e-121  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1985  NCS1 nucleoside transporter family  48.65 
 
 
517 aa  437  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.671932  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1430  NCS1 family nucleobase/cation symporter  47.05 
 
 
503 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2688  NCS1 nucleoside transporter family  46.84 
 
 
503 aa  415  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.931856  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1533  NCS1 nucleoside transporter  46.82 
 
 
503 aa  414  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.578632  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1233  transporter transmembrane protein  45.98 
 
 
502 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0759006  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1111  NCS1 nucleoside transporter  46.43 
 
 
494 aa  404  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.502762  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3590  NCS1 nucleoside transporter  47.46 
 
 
490 aa  399  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.483466 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1594  NCS1 nucleoside transporter  47.03 
 
 
502 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6237  NCS1 nucleoside transporter  47.03 
 
 
502 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.155037 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0338  NCS1 nucleoside transporter  45.78 
 
 
496 aa  395  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5964  NCS1 nucleoside transporter  46.9 
 
 
502 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0145337  normal  0.627469 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5720  NCS1 nucleoside transporter  47.12 
 
 
502 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244182  normal  0.497544 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5352  NCS1 nucleoside transporter  45.42 
 
 
502 aa  393  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.157454 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6713  NCS1 nucleoside transporter  46.61 
 
 
502 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.997894 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6657  cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin transporter  46.61 
 
 
502 aa  388  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal  0.0268783 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4536  NCS1 nucleoside transporter family  43.95 
 
 
533 aa  387  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.854613  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3444  NCS1 nucleoside transporter family  41.96 
 
 
507 aa  362  7.0000000000000005e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000477865  normal  0.0865773 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0222  NCS1 nucleoside transporter  43.25 
 
 
509 aa  350  2e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5168  NCS1 nucleoside transporter family  40.76 
 
 
524 aa  325  9e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.409771 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49824  NCS1 family transporter: cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin  40.8 
 
 
532 aa  315  9.999999999999999e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2210  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  38.19 
 
 
502 aa  310  4e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2101  NCS1 nucleoside transporter family  40.08 
 
 
500 aa  306  7e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4056  NCS1 nucleoside transporter  39.43 
 
 
515 aa  299  9e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3440  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  39.03 
 
 
494 aa  298  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.709152  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3637  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  41.15 
 
 
505 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4035  NCS1 nucleoside transporter  39.71 
 
 
496 aa  293  6e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1803  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  39.71 
 
 
496 aa  293  6e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.666463  normal  0.799889 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05790  putative transporter  41.12 
 
 
496 aa  286  5e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0546  putative transporter  40.5 
 
 
496 aa  286  9e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1837  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  38.96 
 
 
500 aa  282  9e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.524757  normal  0.0916284 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2703  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  33.87 
 
 
492 aa  238  2e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0230  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  37.44 
 
 
486 aa  238  2e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.239977 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1836  NCS1 nucleoside transporter family protein  33.75 
 
 
487 aa  233  5e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.729443  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1908  NCS1 nucleoside transporter family protein  33.96 
 
 
487 aa  227  4e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.535002  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0400  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  34.15 
 
 
483 aa  224  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0904039 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0898  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  33.13 
 
 
493 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0866  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  33.06 
 
 
494 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5091  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  33.81 
 
 
483 aa  220  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415087  normal  0.0197454 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2834  NCS1 nucleoside transporter  32.56 
 
 
482 aa  220  5e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5371  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  33.2 
 
 
484 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.583261  normal  0.663394 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4599  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  35.55 
 
 
490 aa  219  1e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1431  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  30.74 
 
 
486 aa  219  1e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1918  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  30 
 
 
503 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.991169 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3578  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  33.12 
 
 
486 aa  214  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.190049 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0913  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  33.4 
 
 
486 aa  213  3.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2516  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  33.64 
 
 
479 aa  214  3.9999999999999995e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.751632  normal  0.0734451 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1056  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin family permease  33.88 
 
 
494 aa  213  7e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2680  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin family permease  33.88 
 
 
494 aa  213  7e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0268197 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1110  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  33.41 
 
 
494 aa  213  7e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.852121  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0843  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  33.49 
 
 
488 aa  210  6e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08416  conserved hypothetical protein  31.17 
 
 
527 aa  209  9e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3769  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  32.65 
 
 
547 aa  209  1e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0075  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  31.03 
 
 
485 aa  206  8e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.82012  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1280  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  32.44 
 
 
483 aa  205  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4265  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  33.62 
 
 
503 aa  202  9e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.864327 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2087  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  32.99 
 
 
485 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.611219 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3935  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  33.48 
 
 
497 aa  200  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461112  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1871  cytosine/purine/uracil/thiamine/allantoin permease family protein  33.41 
 
 
483 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3430  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  30.41 
 
 
520 aa  197  3e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00461  predicted allantoin transporter  32.43 
 
 
484 aa  196  6e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.592868  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3102  NCS1 nucleoside transporter family  32.43 
 
 
484 aa  196  6e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3112  allantoin permease  32.43 
 
 
484 aa  196  6e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.379099 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00466  hypothetical protein  32.43 
 
 
484 aa  196  6e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.955616  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3531  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  33.41 
 
 
483 aa  196  7e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0729525 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0584  allantoin permease  32.43 
 
 
484 aa  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4033  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  29.78 
 
 
497 aa  196  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4336  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  32.73 
 
 
516 aa  196  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0269962  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4030  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  32.73 
 
 
516 aa  196  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0915622  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3494  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  32.39 
 
 
516 aa  195  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000614437 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2039  cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin transporter  32.92 
 
 
516 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0859563  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0656  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  31.58 
 
 
494 aa  194  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.871285  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3810  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  31.45 
 
 
497 aa  194  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1389  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  31.2 
 
 
530 aa  194  3e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.461228  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5237  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  31.67 
 
 
543 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.111402  normal  0.975867 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0547  allantoin permease  32.2 
 
 
484 aa  194  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4869  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  31.74 
 
 
518 aa  193  5e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4958  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  31.74 
 
 
518 aa  193  5e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0553  allantoin permease  31.97 
 
 
484 aa  193  6e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.962113 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0611  allantoin permease  32.2 
 
 
463 aa  192  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0335  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  30.18 
 
 
483 aa  192  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1814  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  31.92 
 
 
522 aa  190  4e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.627915  normal  0.010101 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0932  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  32.44 
 
 
517 aa  190  5.999999999999999e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0575  allantoin permease  31.14 
 
 
484 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.240762  normal  0.88047 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0570  allantoin permease  31.14 
 
 
484 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.635464  normal  0.884181 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0568  allantoin permease  31.14 
 
 
484 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1558  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  29.78 
 
 
510 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462684  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1756  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  28.72 
 
 
514 aa  186  6e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0629  allantoin permease  31.14 
 
 
484 aa  186  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2331  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  31.79 
 
 
493 aa  186  7e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.55059 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2764  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  29.74 
 
 
517 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.63902 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1098  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  31.31 
 
 
514 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.286175  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3636  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  30.71 
 
 
510 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.542262  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4309  NCS1 nucleoside transporter  29.57 
 
 
510 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747865  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3875  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  29.63 
 
 
510 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.245681  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1924  NCS1 family nucleobase/cation symporter  31.57 
 
 
493 aa  182  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.713736 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>