170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1924 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1880  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  84.73 
 
 		 494 aa  803    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425689  normal  0.296294 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2331  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  95.94 
 
 		 493 aa  928    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.55059 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5845  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  71.92 
 
 		 499 aa  688    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149577 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1510  NCS1 nucleoside transporter family protein  82.63 
 
 		 496 aa  796    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1989  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  84.55 
 
 		 494 aa  805    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.598133  normal  0.623135 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2535  NCS1 nucleoside transporter family protein  82.63 
 
 		 534 aa  798    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.173195  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5280  permease  85.74 
 
 		 494 aa  825    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0491741 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2065  NCS1 nucleoside transporter family protein  83.5 
 
 		 496 aa  803    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1924  NCS1 family nucleobase/cation symporter  100 
 
 		 493 aa  981    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.713736 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6112  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  84.55 
 
 		 494 aa  805    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4869  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  67.92 
 
 		 518 aa  652    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1953  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  84.73 
 
 		 494 aa  805    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1965  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  84.55 
 
 		 494 aa  805    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1302  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  90.67 
 
 		 498 aa  884    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4958  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  67.92 
 
 		 518 aa  652    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0932  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  66.27 
 
 		 517 aa  657    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3935  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  68.92 
 
 		 497 aa  701    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461112  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1098  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  72.82 
 
 		 514 aa  713    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.286175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2009  NCS1 nucleoside transporter family protein  82.63 
 
 		 510 aa  797    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3810  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  70.93 
 
 		 497 aa  699    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3301  NCS1 nucleoside transporter family protein  82.63 
 
 		 534 aa  798    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2390  NCS1 nucleoside transporter family protein  82.63 
 
 		 496 aa  796    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2434  NCS1 nucleoside transporter family protein  82.83 
 
 		 510 aa  799    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5237  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  67.71 
 
 		 543 aa  650    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.111402  normal  0.975867 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1305  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  85.37 
 
 		 494 aa  823    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0354634 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1281  NCS1 nucleoside transporter family protein  82.63 
 
 		 496 aa  796    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.425173  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1298  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  72.57 
 
 		 496 aa  677    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0843718  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1814  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  68.88 
 
 		 522 aa  630  1e-179  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.627915  normal  0.010101 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1871  cytosine/purine/uracil/thiamine/allantoin permease family protein  66.67 
 
 		 483 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3531  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  66.09 
 
 		 483 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0729525 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3430  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  60.48 
 
 		 520 aa  598  1e-170  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0866  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  63.03 
 
 		 494 aa  596  1e-169  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0913  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  62.69 
 
 		 486 aa  597  1e-169  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1110  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  61.54 
 
 		 494 aa  591  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.852121  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2680  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin family permease  61.75 
 
 		 494 aa  592  1e-168  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0268197 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1056  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin family permease  61.75 
 
 		 494 aa  592  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3769  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  62.5 
 
 		 547 aa  587  1e-166  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0656  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  62.85 
 
 		 494 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.871285  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0898  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  61.8 
 
 		 493 aa  580  1e-164  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0472  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  57.86 
 
 		 478 aa  511  1e-144  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2834  NCS1 nucleoside transporter  52.45 
 
 		 482 aa  477  1e-133  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4033  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  47.11 
 
 		 497 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4265  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  43.8 
 
 		 503 aa  398  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.864327 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0843  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  43.79 
 
 		 488 aa  387  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1756  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  41.34 
 
 		 514 aa  379  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2039  cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin transporter  41.46 
 
 		 516 aa  380  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0859563  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4336  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  41.56 
 
 		 516 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0269962  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3494  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  41.35 
 
 		 516 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000614437 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4030  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  41.56 
 
 		 516 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0915622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4599  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  43.2 
 
 		 490 aa  374  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4309  NCS1 nucleoside transporter  42.76 
 
 		 510 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1778  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  43.16 
 
 		 506 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1558  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  42.27 
 
 		 510 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3875  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  42.33 
 
 		 510 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.245681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3636  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  42.55 
 
 		 510 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.542262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1918  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  39.66 
 
 		 503 aa  353  2.9999999999999997e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.991169 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06230  putative permease  40.79 
 
 		 575 aa  343  4e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.037417 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0582  putative permease  40.87 
 
 		 575 aa  342  8e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0075  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  39.83 
 
 		 485 aa  342  9e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.82012  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3170  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  42.04 
 
 		 536 aa  341  2e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185762  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2027  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  43.1 
 
 		 515 aa  336  7e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3194  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  40 
 
 		 522 aa  336  7e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1836  NCS1 nucleoside transporter family protein  39.87 
 
 		 487 aa  327  3e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.729443  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0335  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  40 
 
 		 483 aa  324  3e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1908  NCS1 nucleoside transporter family protein  39.66 
 
 		 487 aa  323  5e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.535002  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2764  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  39.78 
 
 		 517 aa  320  5e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.63902 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3413  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  40.9 
 
 		 569 aa  319  7e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0400  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  39.75 
 
 		 483 aa  317  3e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0904039 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5091  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  38.61 
 
 		 483 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415087  normal  0.0197454 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5371  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  38.57 
 
 		 484 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.583261  normal  0.663394 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1280  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  38.45 
 
 		 483 aa  302  1e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2087  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  39.71 
 
 		 485 aa  294  3e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.611219 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3578  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  38.43 
 
 		 486 aa  293  7e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.190049 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2101  NCS1 nucleoside transporter family  33.26 
 
 		 500 aa  241  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4536  NCS1 nucleoside transporter family  35.19 
 
 		 533 aa  235  1.0000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.854613  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5168  NCS1 nucleoside transporter family  32.6 
 
 		 524 aa  226  6e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.409771 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2385  NCS1 nucleoside transporter family  32.85 
 
 		 492 aa  221  3e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0222  NCS1 nucleoside transporter  36.98 
 
 		 509 aa  221  3e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1985  NCS1 nucleoside transporter family  32.43 
 
 		 517 aa  217  4e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.671932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2863  NCS1 nucleoside transporter  30.88 
 
 		 497 aa  215  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3444  NCS1 nucleoside transporter family  31.61 
 
 		 507 aa  209  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000477865  normal  0.0865773 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0230  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  31.21 
 
 		 486 aa  207  3e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.239977 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3590  NCS1 nucleoside transporter  32.23 
 
 		 490 aa  205  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.483466 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1533  NCS1 nucleoside transporter  31.21 
 
 		 503 aa  204  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.578632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1430  NCS1 family nucleobase/cation symporter  30.67 
 
 		 503 aa  204  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2688  NCS1 nucleoside transporter family  30.44 
 
 		 503 aa  204  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.931856  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1233  transporter transmembrane protein  30.33 
 
 		 502 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0759006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1594  NCS1 nucleoside transporter  31.6 
 
 		 502 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6237  NCS1 nucleoside transporter  31.6 
 
 		 502 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.155037 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0575  allantoin permease  28.66 
 
 		 484 aa  197  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.240762  normal  0.88047 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0570  allantoin permease  28.66 
 
 		 484 aa  197  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.635464  normal  0.884181 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0568  allantoin permease  28.45 
 
 		 484 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5352  NCS1 nucleoside transporter  30.48 
 
 		 502 aa  195  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.157454 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4150  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  33.05 
 
 		 494 aa  196  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0629  allantoin permease  28.45 
 
 		 484 aa  196  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0611  allantoin permease  28.7 
 
 		 463 aa  195  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0553  allantoin permease  28.33 
 
 		 484 aa  193  6e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.962113 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0547  allantoin permease  28.3 
 
 		 484 aa  192  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00461  predicted allantoin transporter  28.09 
 
 		 484 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.592868  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6657  cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin transporter  30.94 
 
 		 502 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal  0.0268783 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>