171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A0570 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_0553  allantoin permease  90.91 
 
 
484 aa  860    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.962113 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0570  allantoin permease  100 
 
 
484 aa  967    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.635464  normal  0.884181 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3112  allantoin permease  91.53 
 
 
484 aa  859    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.379099 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00461  predicted allantoin transporter  91.53 
 
 
484 aa  859    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.592868  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3102  NCS1 nucleoside transporter family  91.53 
 
 
484 aa  859    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0584  allantoin permease  91.32 
 
 
484 aa  857    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00466  hypothetical protein  91.53 
 
 
484 aa  859    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.955616  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0568  allantoin permease  98.97 
 
 
484 aa  958    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0629  allantoin permease  98.97 
 
 
484 aa  959    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0575  allantoin permease  100 
 
 
484 aa  967    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.240762  normal  0.88047 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0547  allantoin permease  91.53 
 
 
484 aa  861    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0611  allantoin permease  92.64 
 
 
463 aa  833    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0774  NCS1 nucleoside transporter family protein  46.99 
 
 
494 aa  434  1e-120  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.182472 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5168  NCS1 nucleoside transporter family  32.86 
 
 
524 aa  243  7e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.409771 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0913  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  28.51 
 
 
486 aa  240  5e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2680  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin family permease  29.24 
 
 
494 aa  236  6e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0268197 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1056  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin family permease  29.24 
 
 
494 aa  236  6e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1110  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  29.24 
 
 
494 aa  236  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.852121  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4265  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  29.62 
 
 
503 aa  228  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.864327 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0866  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  28.45 
 
 
494 aa  227  3e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1985  NCS1 nucleoside transporter family  31.67 
 
 
517 aa  227  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.671932  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2385  NCS1 nucleoside transporter family  31.46 
 
 
492 aa  227  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2101  NCS1 nucleoside transporter family  30.74 
 
 
500 aa  226  9e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2834  NCS1 nucleoside transporter  29.72 
 
 
482 aa  223  8e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0656  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  29.46 
 
 
494 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.871285  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5237  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  28.43 
 
 
543 aa  221  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.111402  normal  0.975867 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4869  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  28.43 
 
 
518 aa  220  5e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4958  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  28.43 
 
 
518 aa  220  5e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0932  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  31.14 
 
 
517 aa  220  5e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0898  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  28.6 
 
 
493 aa  219  7.999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3444  NCS1 nucleoside transporter family  31.03 
 
 
507 aa  215  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000477865  normal  0.0865773 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2863  NCS1 nucleoside transporter  30.53 
 
 
497 aa  215  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1302  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  30.87 
 
 
498 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155408  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3430  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  28.97 
 
 
520 aa  215  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3810  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  28.91 
 
 
497 aa  214  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2516  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  28.33 
 
 
479 aa  214  2.9999999999999995e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.751632  normal  0.0734451 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2703  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  31.08 
 
 
492 aa  212  1e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5845  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  28.57 
 
 
499 aa  212  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149577 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3935  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  27.45 
 
 
497 aa  212  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461112  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3769  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  29.89 
 
 
547 aa  211  2e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5280  permease  30.57 
 
 
494 aa  210  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0491741 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2331  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  30 
 
 
493 aa  210  6e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.55059 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1814  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  30.64 
 
 
522 aa  209  7e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.627915  normal  0.010101 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5352  NCS1 nucleoside transporter  30.21 
 
 
502 aa  208  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.157454 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1989  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  30.66 
 
 
494 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.598133  normal  0.623135 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1305  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  30.15 
 
 
494 aa  209  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0354634 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3590  NCS1 nucleoside transporter  31.78 
 
 
490 aa  209  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.483466 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1953  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  30.53 
 
 
494 aa  208  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3531  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  27.88 
 
 
483 aa  207  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0729525 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2065  NCS1 nucleoside transporter family protein  29.66 
 
 
496 aa  207  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4336  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  29.52 
 
 
516 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0269962  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6112  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  29.94 
 
 
494 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1965  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  29.94 
 
 
494 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4030  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  29.52 
 
 
516 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0915622  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3494  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  29.52 
 
 
516 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000614437 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1098  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  28.27 
 
 
514 aa  207  4e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.286175  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1510  NCS1 nucleoside transporter family protein  30.08 
 
 
496 aa  206  5e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2039  cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin transporter  29.11 
 
 
516 aa  207  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0859563  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2390  NCS1 nucleoside transporter family protein  30.08 
 
 
496 aa  206  5e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1281  NCS1 nucleoside transporter family protein  30.08 
 
 
496 aa  206  5e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.425173  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2535  NCS1 nucleoside transporter family protein  30.08 
 
 
534 aa  206  7e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.173195  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2009  NCS1 nucleoside transporter family protein  30.08 
 
 
510 aa  206  7e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3301  NCS1 nucleoside transporter family protein  30.08 
 
 
534 aa  206  7e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1880  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  30.15 
 
 
494 aa  206  7e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425689  normal  0.296294 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3194  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  32.69 
 
 
522 aa  206  8e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1871  cytosine/purine/uracil/thiamine/allantoin permease family protein  27.62 
 
 
483 aa  205  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2434  NCS1 nucleoside transporter family protein  29.87 
 
 
510 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3170  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  31.24 
 
 
536 aa  204  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185762  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5964  NCS1 nucleoside transporter  28.84 
 
 
502 aa  204  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0145337  normal  0.627469 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5720  NCS1 nucleoside transporter  28.84 
 
 
502 aa  203  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244182  normal  0.497544 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1594  NCS1 nucleoside transporter  29.44 
 
 
502 aa  203  6e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6237  NCS1 nucleoside transporter  29.44 
 
 
502 aa  203  6e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.155037 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4033  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  27.48 
 
 
497 aa  203  7e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1778  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  31.36 
 
 
506 aa  202  9e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1924  NCS1 family nucleobase/cation symporter  29.39 
 
 
493 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.713736 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4599  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  30.11 
 
 
490 aa  202  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1533  NCS1 nucleoside transporter  27.79 
 
 
503 aa  201  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.578632  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1298  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  27.7 
 
 
496 aa  200  5e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0843718  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2210  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  28.06 
 
 
502 aa  200  5e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6713  NCS1 nucleoside transporter  29.75 
 
 
502 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.997894 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1233  transporter transmembrane protein  28.78 
 
 
502 aa  199  7.999999999999999e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0759006  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0230  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  28.82 
 
 
486 aa  198  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.239977 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1430  NCS1 family nucleobase/cation symporter  28 
 
 
503 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6657  cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin transporter  29.02 
 
 
502 aa  197  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal  0.0268783 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1756  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  29.03 
 
 
514 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2027  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  31.48 
 
 
515 aa  197  4.0000000000000005e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0472  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  29 
 
 
478 aa  197  5.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0968  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  30.52 
 
 
489 aa  196  8.000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.553781  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0075  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  30.13 
 
 
485 aa  196  9e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.82012  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2688  NCS1 nucleoside transporter family  28.21 
 
 
503 aa  195  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.931856  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4150  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  31.79 
 
 
494 aa  195  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06230  putative permease  31.15 
 
 
575 aa  195  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.037417 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0335  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  29.81 
 
 
483 aa  192  8e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00768  cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin transporter  28.39 
 
 
499 aa  192  9e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1918  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  28.75 
 
 
503 aa  192  1e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.991169 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1558  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  28.95 
 
 
510 aa  191  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462684  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0582  putative permease  30.74 
 
 
575 aa  190  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4309  NCS1 nucleoside transporter  28.95 
 
 
510 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747865  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4536  NCS1 nucleoside transporter family  28.73 
 
 
533 aa  187  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.854613  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2764  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  29.39 
 
 
517 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.63902 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>