162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_1965 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1302  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  86.76 
 
 		 498 aa  832    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1989  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  99.6 
 
 		 494 aa  978    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.598133  normal  0.623135 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2331  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  83.54 
 
 		 493 aa  798    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.55059 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1510  NCS1 nucleoside transporter family protein  87.5 
 
 		 496 aa  838    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3935  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  68.11 
 
 		 497 aa  688    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461112  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5845  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  69.68 
 
 		 499 aa  678    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149577 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2535  NCS1 nucleoside transporter family protein  87.5 
 
 		 534 aa  838    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.173195  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5280  permease  96.76 
 
 		 494 aa  939    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0491741 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2065  NCS1 nucleoside transporter family protein  88.1 
 
 		 496 aa  844    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1924  NCS1 family nucleobase/cation symporter  84.96 
 
 		 493 aa  813    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.713736 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6112  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  100 
 
 		 494 aa  981    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4869  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  67.37 
 
 		 518 aa  647    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1298  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  68.17 
 
 		 496 aa  642    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0843718  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1953  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  96.96 
 
 		 494 aa  915    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1965  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  100 
 
 		 494 aa  981    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4958  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  67.37 
 
 		 518 aa  647    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0932  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  67.79 
 
 		 517 aa  645    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1098  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  69.26 
 
 		 514 aa  690    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.286175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2009  NCS1 nucleoside transporter family protein  87.5 
 
 		 510 aa  838    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3810  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  66.74 
 
 		 497 aa  656    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3301  NCS1 nucleoside transporter family protein  87.5 
 
 		 534 aa  838    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2390  NCS1 nucleoside transporter family protein  87.5 
 
 		 496 aa  838    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2434  NCS1 nucleoside transporter family protein  87.5 
 
 		 510 aa  839    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5237  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  67.37 
 
 		 543 aa  646    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.111402  normal  0.975867 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1281  NCS1 nucleoside transporter family protein  87.5 
 
 		 496 aa  838    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.425173  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1880  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  97.37 
 
 		 494 aa  920    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425689  normal  0.296294 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1305  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  95.74 
 
 		 494 aa  931    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0354634 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1814  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  66.11 
 
 		 522 aa  616  1e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.627915  normal  0.010101 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3531  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  66.38 
 
 		 483 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0729525 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1871  cytosine/purine/uracil/thiamine/allantoin permease family protein  65.86 
 
 		 483 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3430  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  61.71 
 
 		 520 aa  583  1.0000000000000001e-165  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1056  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin family permease  60.82 
 
 		 494 aa  575  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2680  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin family permease  60.82 
 
 		 494 aa  575  1.0000000000000001e-163  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0268197 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1110  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  60.61 
 
 		 494 aa  573  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.852121  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3769  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  62.45 
 
 		 547 aa  570  1e-161  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0866  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  60.04 
 
 		 494 aa  566  1e-160  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0913  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  59.66 
 
 		 486 aa  568  1e-160  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0898  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  59.4 
 
 		 493 aa  558  1e-158  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0656  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  58.54 
 
 		 494 aa  556  1e-157  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.871285  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0472  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  55.6 
 
 		 478 aa  497  1e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2834  NCS1 nucleoside transporter  52.44 
 
 		 482 aa  465  1e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4033  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  47.1 
 
 		 497 aa  438  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4265  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  42.98 
 
 		 503 aa  384  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.864327 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0843  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  43.52 
 
 		 488 aa  373  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1756  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  40.95 
 
 		 514 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2039  cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin transporter  41.22 
 
 		 516 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0859563  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4336  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  41.36 
 
 		 516 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0269962  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4030  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  41.36 
 
 		 516 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0915622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3494  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  41.15 
 
 		 516 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000614437 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4599  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  42.58 
 
 		 490 aa  362  1e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1778  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  43.04 
 
 		 506 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4309  NCS1 nucleoside transporter  41.85 
 
 		 510 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3875  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  41.77 
 
 		 510 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.245681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1558  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  41.63 
 
 		 510 aa  352  8.999999999999999e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3636  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  42.28 
 
 		 510 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.542262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0582  putative permease  40.99 
 
 		 575 aa  340  2e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06230  putative permease  40.87 
 
 		 575 aa  339  7e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.037417 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1918  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  39.62 
 
 		 503 aa  337  1.9999999999999998e-91  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.991169 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0075  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  41.1 
 
 		 485 aa  336  7e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.82012  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0335  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  41.13 
 
 		 483 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3170  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  41.4 
 
 		 536 aa  327  3e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2764  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  40.22 
 
 		 517 aa  323  4e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.63902 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3194  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  39.96 
 
 		 522 aa  323  5e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2027  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  42.58 
 
 		 515 aa  318  1e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1836  NCS1 nucleoside transporter family protein  38.7 
 
 		 487 aa  307  3e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.729443  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1908  NCS1 nucleoside transporter family protein  38.7 
 
 		 487 aa  303  4.0000000000000003e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.535002  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3413  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  39.31 
 
 		 569 aa  302  1e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0400  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  37.81 
 
 		 483 aa  301  1e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0904039 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3578  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  39.49 
 
 		 486 aa  293  4e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.190049 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5091  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  38.19 
 
 		 483 aa  290  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415087  normal  0.0197454 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2087  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  40.5 
 
 		 485 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.611219 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1280  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  38 
 
 		 483 aa  289  7e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5371  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  37.55 
 
 		 484 aa  286  8e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.583261  normal  0.663394 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2101  NCS1 nucleoside transporter family  33.47 
 
 		 500 aa  240  4e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4536  NCS1 nucleoside transporter family  34.95 
 
 		 533 aa  228  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.854613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2385  NCS1 nucleoside transporter family  32.72 
 
 		 492 aa  216  5e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5168  NCS1 nucleoside transporter family  32.04 
 
 		 524 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.409771 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1985  NCS1 nucleoside transporter family  32.15 
 
 		 517 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.671932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0222  NCS1 nucleoside transporter  35.51 
 
 		 509 aa  209  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0230  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  32.43 
 
 		 486 aa  209  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.239977 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2863  NCS1 nucleoside transporter  29.62 
 
 		 497 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0570  allantoin permease  29.94 
 
 		 484 aa  203  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.635464  normal  0.884181 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0568  allantoin permease  29.94 
 
 		 484 aa  203  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0575  allantoin permease  29.94 
 
 		 484 aa  203  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.240762  normal  0.88047 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0629  allantoin permease  29.94 
 
 		 484 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0553  allantoin permease  29.54 
 
 		 484 aa  200  5e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.962113 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3590  NCS1 nucleoside transporter  32.51 
 
 		 490 aa  199  9e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.483466 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1533  NCS1 nucleoside transporter  30.2 
 
 		 503 aa  197  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.578632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3444  NCS1 nucleoside transporter family  30.53 
 
 		 507 aa  197  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000477865  normal  0.0865773 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0547  allantoin permease  29.3 
 
 		 484 aa  197  3e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0611  allantoin permease  29.16 
 
 		 463 aa  196  7e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00461  predicted allantoin transporter  29.09 
 
 		 484 aa  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.592868  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3102  NCS1 nucleoside transporter family  29.09 
 
 		 484 aa  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00466  hypothetical protein  29.09 
 
 		 484 aa  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.955616  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3112  allantoin permease  29.09 
 
 		 484 aa  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.379099 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4056  NCS1 nucleoside transporter  29.88 
 
 		 515 aa  196  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1430  NCS1 family nucleobase/cation symporter  29.76 
 
 		 503 aa  194  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0584  allantoin permease  29.03 
 
 		 484 aa  194  3e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2703  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  28.51 
 
 		 492 aa  191  2e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2688  NCS1 nucleoside transporter family  30 
 
 		 503 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.931856  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>