161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2703 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_2703  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  100 
 
 
492 aa  968    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2516  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  36.54 
 
 
479 aa  305  2.0000000000000002e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.751632  normal  0.0734451 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0230  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  36.89 
 
 
486 aa  299  6e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.239977 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2210  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  34.34 
 
 
502 aa  272  8.000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2385  NCS1 nucleoside transporter family  34.69 
 
 
492 aa  259  1e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2101  NCS1 nucleoside transporter family  33.86 
 
 
500 aa  256  7e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0222  NCS1 nucleoside transporter  35.85 
 
 
509 aa  256  9e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1985  NCS1 nucleoside transporter family  34.9 
 
 
517 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.671932  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3590  NCS1 nucleoside transporter  32.59 
 
 
490 aa  246  6.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.483466 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4536  NCS1 nucleoside transporter family  33.26 
 
 
533 aa  246  6.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.854613  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4056  NCS1 nucleoside transporter  33.27 
 
 
515 aa  244  3e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5168  NCS1 nucleoside transporter family  33.47 
 
 
524 aa  243  6e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.409771 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3444  NCS1 nucleoside transporter family  33.82 
 
 
507 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000477865  normal  0.0865773 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0968  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  33.95 
 
 
489 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.553781  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0338  NCS1 nucleoside transporter  32.47 
 
 
496 aa  234  3e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1430  NCS1 family nucleobase/cation symporter  32.65 
 
 
503 aa  233  5e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1803  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  33.33 
 
 
496 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.666463  normal  0.799889 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4035  NCS1 nucleoside transporter  33.33 
 
 
496 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3440  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  32.68 
 
 
494 aa  229  9e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.709152  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2688  NCS1 nucleoside transporter family  31.87 
 
 
503 aa  228  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.931856  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3637  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  33.54 
 
 
505 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2863  NCS1 nucleoside transporter  32.5 
 
 
497 aa  228  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1111  NCS1 nucleoside transporter  32.65 
 
 
494 aa  226  5.0000000000000005e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.502762  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1233  transporter transmembrane protein  32.45 
 
 
502 aa  226  7e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0759006  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1533  NCS1 nucleoside transporter  31.58 
 
 
503 aa  225  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.578632  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5352  NCS1 nucleoside transporter  32.14 
 
 
502 aa  225  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.157454 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1594  NCS1 nucleoside transporter  32.51 
 
 
502 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6237  NCS1 nucleoside transporter  32.51 
 
 
502 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.155037 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5964  NCS1 nucleoside transporter  31.71 
 
 
502 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0145337  normal  0.627469 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6713  NCS1 nucleoside transporter  32.37 
 
 
502 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.997894 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5720  NCS1 nucleoside transporter  31.71 
 
 
502 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244182  normal  0.497544 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05790  putative transporter  31.54 
 
 
496 aa  217  4e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4150  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  29.94 
 
 
494 aa  217  4e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1837  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  32.26 
 
 
500 aa  216  7e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.524757  normal  0.0916284 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00768  cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin transporter  30.72 
 
 
499 aa  215  9.999999999999999e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0546  putative transporter  31.34 
 
 
496 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1918  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  31.01 
 
 
503 aa  211  2e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.991169 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6657  cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin transporter  32.16 
 
 
502 aa  210  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal  0.0268783 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49824  NCS1 family transporter: cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin  32.24 
 
 
532 aa  209  1e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0553  allantoin permease  31.24 
 
 
484 aa  204  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.962113 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0547  allantoin permease  32.02 
 
 
484 aa  205  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3112  allantoin permease  31.39 
 
 
484 aa  204  3e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.379099 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00461  predicted allantoin transporter  31.39 
 
 
484 aa  204  3e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.592868  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3102  NCS1 nucleoside transporter family  31.39 
 
 
484 aa  204  3e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00466  hypothetical protein  31.39 
 
 
484 aa  204  3e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.955616  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3170  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  30.88 
 
 
536 aa  204  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185762  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0584  allantoin permease  31.39 
 
 
484 aa  204  3e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0611  allantoin permease  31.61 
 
 
463 aa  204  4e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3430  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  27.5 
 
 
520 aa  202  8e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0568  allantoin permease  30.61 
 
 
484 aa  202  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3194  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  30.43 
 
 
522 aa  202  9e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0575  allantoin permease  31.08 
 
 
484 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.240762  normal  0.88047 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0570  allantoin permease  31.08 
 
 
484 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.635464  normal  0.884181 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0629  allantoin permease  30.87 
 
 
484 aa  199  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5845  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  27.09 
 
 
499 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149577 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1098  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  28.12 
 
 
514 aa  195  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.286175  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2027  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  30.4 
 
 
515 aa  193  7e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1302  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  28.25 
 
 
498 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155408  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0774  NCS1 nucleoside transporter family protein  27.67 
 
 
494 aa  189  1e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.182472 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0335  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  28.48 
 
 
483 aa  189  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4869  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  29.55 
 
 
518 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4958  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  29.55 
 
 
518 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1558  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  28.6 
 
 
510 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462684  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0932  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  29.17 
 
 
517 aa  187  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5237  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  29.35 
 
 
543 aa  187  5e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.111402  normal  0.975867 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4309  NCS1 nucleoside transporter  28.66 
 
 
510 aa  186  7e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747865  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4336  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  29.21 
 
 
516 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0269962  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4030  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  29.21 
 
 
516 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0915622  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3875  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  28.78 
 
 
510 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.245681  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3769  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  28.33 
 
 
547 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1880  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  28.42 
 
 
494 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425689  normal  0.296294 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5280  permease  27.66 
 
 
494 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0491741 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0075  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  27.27 
 
 
485 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.82012  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2834  NCS1 nucleoside transporter  27.85 
 
 
482 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3413  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  30.97 
 
 
569 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4033  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  26.53 
 
 
497 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3494  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  28.96 
 
 
516 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000614437 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1756  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  28.33 
 
 
514 aa  184  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2039  cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin transporter  28.87 
 
 
516 aa  184  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0859563  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0656  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.51 
 
 
494 aa  184  3e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.871285  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6112  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  28.84 
 
 
494 aa  183  6e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1965  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  28.84 
 
 
494 aa  183  6e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2331  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  28.39 
 
 
493 aa  183  7e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.55059 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1989  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  28.48 
 
 
494 aa  183  7e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.598133  normal  0.623135 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2065  NCS1 nucleoside transporter family protein  27.63 
 
 
496 aa  182  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1305  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  28.3 
 
 
494 aa  182  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0354634 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1953  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  28.33 
 
 
494 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3810  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  26.07 
 
 
497 aa  181  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0400  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  28.02 
 
 
483 aa  180  4e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0904039 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1924  NCS1 family nucleobase/cation symporter  27.54 
 
 
493 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.713736 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3636  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  28.84 
 
 
510 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.542262  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2764  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  28.31 
 
 
517 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.63902 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1298  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  28.12 
 
 
496 aa  180  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0843718  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2434  NCS1 nucleoside transporter family protein  27.38 
 
 
510 aa  179  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1836  NCS1 nucleoside transporter family protein  27.27 
 
 
487 aa  179  8e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.729443  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2535  NCS1 nucleoside transporter family protein  27.38 
 
 
534 aa  179  9e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.173195  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3301  NCS1 nucleoside transporter family protein  27.38 
 
 
534 aa  179  9e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2009  NCS1 nucleoside transporter family protein  27.38 
 
 
510 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2390  NCS1 nucleoside transporter family protein  27.38 
 
 
496 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1281  NCS1 nucleoside transporter family protein  27.38 
 
 
496 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.425173  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>