246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5964 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6713  NCS1 nucleoside transporter  95.22 
 
 		 502 aa  923    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.997894 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1233  transporter transmembrane protein  86.65 
 
 		 502 aa  863    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0759006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6657  cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin transporter  95.22 
 
 		 502 aa  907    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal  0.0268783 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1430  NCS1 family nucleobase/cation symporter  85.69 
 
 		 503 aa  850    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1594  NCS1 nucleoside transporter  96.22 
 
 		 502 aa  935    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5964  NCS1 nucleoside transporter  100 
 
 		 502 aa  996    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0145337  normal  0.627469 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5352  NCS1 nucleoside transporter  93.63 
 
 		 502 aa  911    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.157454 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6237  NCS1 nucleoside transporter  96.22 
 
 		 502 aa  935    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.155037 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5720  NCS1 nucleoside transporter  99.2 
 
 		 502 aa  994    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244182  normal  0.497544 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2688  NCS1 nucleoside transporter family  86.28 
 
 		 503 aa  853    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.931856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1533  NCS1 nucleoside transporter  86.68 
 
 		 503 aa  857    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.578632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2863  NCS1 nucleoside transporter  65.9 
 
 		 497 aa  654    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2385  NCS1 nucleoside transporter family  62.97 
 
 		 492 aa  591  1e-167  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1985  NCS1 nucleoside transporter family  63.18 
 
 		 517 aa  588  1e-167  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.671932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3590  NCS1 nucleoside transporter  60.41 
 
 		 490 aa  578  1e-164  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.483466 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00768  cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin transporter  59.09 
 
 		 499 aa  566  1e-160  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1111  NCS1 nucleoside transporter  57.17 
 
 		 494 aa  525  1e-148  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.502762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0338  NCS1 nucleoside transporter  57.17 
 
 		 496 aa  497  1e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4536  NCS1 nucleoside transporter family  52.54 
 
 		 533 aa  462  1e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.854613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3444  NCS1 nucleoside transporter family  50 
 
 		 507 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000477865  normal  0.0865773 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4150  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  48.61 
 
 		 494 aa  422  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0968  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  46.9 
 
 		 489 aa  404  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.553781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0222  NCS1 nucleoside transporter  47 
 
 		 509 aa  398  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49824  NCS1 family transporter: cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin  45.92 
 
 		 532 aa  385  1e-105  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5168  NCS1 nucleoside transporter family  44.38 
 
 		 524 aa  374  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.409771 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2101  NCS1 nucleoside transporter family  45.7 
 
 		 500 aa  372  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2210  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  41.94 
 
 		 502 aa  352  8.999999999999999e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4056  NCS1 nucleoside transporter  38.06 
 
 		 515 aa  316  5e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3637  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  40.38 
 
 		 505 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1803  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  40.38 
 
 		 496 aa  312  9e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.666463  normal  0.799889 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4035  NCS1 nucleoside transporter  40.38 
 
 		 496 aa  312  9e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3440  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  38.26 
 
 		 494 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.709152  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1837  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  40.17 
 
 		 500 aa  299  8e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.524757  normal  0.0916284 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05790  putative transporter  39.56 
 
 		 496 aa  295  9e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0546  putative transporter  39.76 
 
 		 496 aa  294  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2834  NCS1 nucleoside transporter  34.7 
 
 		 482 aa  267  4e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0230  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  32.46 
 
 		 486 aa  253  5.000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.239977 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0866  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  33.2 
 
 		 494 aa  248  1e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0898  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  31.94 
 
 		 493 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4599  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  35.45 
 
 		 490 aa  244  3e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1918  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  34.94 
 
 		 503 aa  243  3.9999999999999997e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.991169 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3578  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  34.86 
 
 		 486 aa  243  5e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.190049 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4033  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  33.18 
 
 		 497 aa  242  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0075  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  33.68 
 
 		 485 aa  242  1e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.82012  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5091  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  32.11 
 
 		 483 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415087  normal  0.0197454 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0400  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  32.59 
 
 		 483 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0904039 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1431  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  32.94 
 
 		 486 aa  240  5.999999999999999e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4336  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  33.2 
 
 		 516 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0269962  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4030  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  33.2 
 
 		 516 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0915622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1389  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  35.68 
 
 		 530 aa  238  2e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.461228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1836  NCS1 nucleoside transporter family protein  32.52 
 
 		 487 aa  238  3e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.729443  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1908  NCS1 nucleoside transporter family protein  32.32 
 
 		 487 aa  236  6e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.535002  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3494  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  33.2 
 
 		 516 aa  236  6e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000614437 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5371  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  32.24 
 
 		 484 aa  236  7e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.583261  normal  0.663394 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2680  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin family permease  33.33 
 
 		 494 aa  236  8e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0268197 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1056  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin family permease  33.33 
 
 		 494 aa  236  8e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0843  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  36.47 
 
 		 488 aa  234  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1110  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  33.12 
 
 		 494 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.852121  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0913  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  33 
 
 		 486 aa  234  3e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2039  cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin transporter  32.59 
 
 		 516 aa  232  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0859563  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4265  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  34.15 
 
 		 503 aa  231  2e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.864327 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2703  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  31.85 
 
 		 492 aa  230  4e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0656  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  31.36 
 
 		 494 aa  229  6e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.871285  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2516  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  33.02 
 
 		 479 aa  227  3e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.751632  normal  0.0734451 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1280  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  33.06 
 
 		 483 aa  227  4e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1756  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  32.91 
 
 		 514 aa  226  9e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1871  cytosine/purine/uracil/thiamine/allantoin permease family protein  31.31 
 
 		 483 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08416  conserved hypothetical protein  32.3 
 
 		 527 aa  223  4e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3531  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  31.98 
 
 		 483 aa  223  8e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0729525 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2764  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  33.33 
 
 		 517 aa  223  8e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.63902 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06230  putative permease  35.55 
 
 		 575 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.037417 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0582  putative permease  34.79 
 
 		 575 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3935  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  31.68 
 
 		 497 aa  217  4e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461112  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2087  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  32.72 
 
 		 485 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.611219 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4869  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  30.54 
 
 		 518 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4958  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  30.54 
 
 		 518 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5237  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  30.54 
 
 		 543 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.111402  normal  0.975867 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0335  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  31.88 
 
 		 483 aa  213  7e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5845  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  31.85 
 
 		 499 aa  211  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149577 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1558  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  30.18 
 
 		 510 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3875  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  30.7 
 
 		 510 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.245681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3810  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  31.07 
 
 		 497 aa  211  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3170  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  32.5 
 
 		 536 aa  211  3e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185762  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4309  NCS1 nucleoside transporter  30.18 
 
 		 510 aa  210  5e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1778  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  33.68 
 
 		 506 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00461  predicted allantoin transporter  28.63 
 
 		 484 aa  207  3e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.592868  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3102  NCS1 nucleoside transporter family  28.63 
 
 		 484 aa  207  3e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3112  allantoin permease  28.63 
 
 		 484 aa  207  3e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.379099 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0547  allantoin permease  28.63 
 
 		 484 aa  207  3e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00466  hypothetical protein  28.63 
 
 		 484 aa  207  3e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.955616  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3636  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  31.01 
 
 		 510 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.542262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0584  allantoin permease  28.63 
 
 		 484 aa  207  4e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0472  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  31.93 
 
 		 478 aa  206  7e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0553  allantoin permease  29.05 
 
 		 484 aa  205  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.962113 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0568  allantoin permease  29.05 
 
 		 484 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2027  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  34.3 
 
 		 515 aa  203  7e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0575  allantoin permease  28.84 
 
 		 484 aa  202  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.240762  normal  0.88047 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0570  allantoin permease  28.84 
 
 		 484 aa  202  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.635464  normal  0.884181 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1298  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  31.67 
 
 		 496 aa  202  9e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0843718  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0774  NCS1 nucleoside transporter family protein  31.64 
 
 		 494 aa  201  3e-50  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.182472 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>