216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2027 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3194  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  67.77 
 
 
522 aa  675    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2027  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  100 
 
 
515 aa  1009    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3413  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  68.32 
 
 
569 aa  669    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3170  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  79.42 
 
 
536 aa  727    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185762  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1756  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  60.08 
 
 
514 aa  615  1e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4309  NCS1 nucleoside transporter  60.63 
 
 
510 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747865  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3875  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  58.32 
 
 
510 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.245681  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3636  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  58.51 
 
 
510 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.542262  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1558  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  57.73 
 
 
510 aa  600  1e-170  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462684  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2039  cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin transporter  56.09 
 
 
516 aa  592  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0859563  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4336  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  56.77 
 
 
516 aa  591  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0269962  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3494  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  56.77 
 
 
516 aa  591  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000614437 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4030  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  56.77 
 
 
516 aa  591  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0915622  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1778  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  58.96 
 
 
506 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06230  putative permease  58.51 
 
 
575 aa  568  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.037417 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0582  putative permease  58.32 
 
 
575 aa  567  1e-160  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2834  NCS1 nucleoside transporter  46.54 
 
 
482 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4265  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  43.56 
 
 
503 aa  409  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.864327 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0843  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  43.74 
 
 
488 aa  383  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0866  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  42.07 
 
 
494 aa  377  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0898  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  41.85 
 
 
493 aa  370  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4599  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  41.91 
 
 
490 aa  370  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1098  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  42.12 
 
 
514 aa  371  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.286175  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0913  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  40.04 
 
 
486 aa  362  7.0000000000000005e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1302  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  42.42 
 
 
498 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155408  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3810  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  41.32 
 
 
497 aa  362  7.0000000000000005e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5845  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  42.12 
 
 
499 aa  362  9e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149577 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1924  NCS1 family nucleobase/cation symporter  43.1 
 
 
493 aa  360  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.713736 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1110  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  39 
 
 
494 aa  360  2e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.852121  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1056  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin family permease  39 
 
 
494 aa  360  3e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2680  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin family permease  39 
 
 
494 aa  360  3e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0268197 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3935  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  39.67 
 
 
497 aa  360  5e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461112  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2331  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  42.8 
 
 
493 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.55059 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0656  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  39.83 
 
 
494 aa  355  8.999999999999999e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.871285  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4033  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  39.96 
 
 
497 aa  355  1e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1814  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  40.16 
 
 
522 aa  353  5e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.627915  normal  0.010101 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1298  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  40.37 
 
 
496 aa  351  2e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0843718  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4869  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  41.03 
 
 
518 aa  350  4e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4958  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  41.03 
 
 
518 aa  350  4e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5280  permease  42.89 
 
 
494 aa  348  1e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0491741 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0932  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  39.34 
 
 
517 aa  348  1e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5237  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  40.6 
 
 
543 aa  347  2e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.111402  normal  0.975867 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3769  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  38.51 
 
 
547 aa  342  8e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3531  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  40.35 
 
 
483 aa  341  2e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0729525 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6112  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  41.63 
 
 
494 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1965  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  41.63 
 
 
494 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1880  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  41.58 
 
 
494 aa  341  2e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425689  normal  0.296294 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1305  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  42.24 
 
 
494 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0354634 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1953  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  41.06 
 
 
494 aa  340  4e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1989  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  41.63 
 
 
494 aa  340  4e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.598133  normal  0.623135 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1871  cytosine/purine/uracil/thiamine/allantoin permease family protein  39.69 
 
 
483 aa  340  5e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2434  NCS1 nucleoside transporter family protein  42.15 
 
 
510 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2535  NCS1 nucleoside transporter family protein  42.15 
 
 
534 aa  339  7e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.173195  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3301  NCS1 nucleoside transporter family protein  42.15 
 
 
534 aa  339  7e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1510  NCS1 nucleoside transporter family protein  42.15 
 
 
496 aa  339  8e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2009  NCS1 nucleoside transporter family protein  42.15 
 
 
510 aa  339  8e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2390  NCS1 nucleoside transporter family protein  42.15 
 
 
496 aa  339  8e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1281  NCS1 nucleoside transporter family protein  42.15 
 
 
496 aa  339  8e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.425173  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3430  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  37.79 
 
 
520 aa  338  9.999999999999999e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2065  NCS1 nucleoside transporter family protein  42.15 
 
 
496 aa  337  5e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0472  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  39.69 
 
 
478 aa  328  2.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0075  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  34.78 
 
 
485 aa  292  9e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.82012  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1918  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  34.37 
 
 
503 aa  292  1e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.991169 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0335  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  36.44 
 
 
483 aa  290  3e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1836  NCS1 nucleoside transporter family protein  36.82 
 
 
487 aa  280  6e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.729443  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1908  NCS1 nucleoside transporter family protein  36.02 
 
 
487 aa  279  8e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.535002  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5371  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  34.5 
 
 
484 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.583261  normal  0.663394 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0400  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  35.05 
 
 
483 aa  278  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0904039 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5091  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  34.45 
 
 
483 aa  278  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415087  normal  0.0197454 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1280  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  35.1 
 
 
483 aa  274  3e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3578  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  36.58 
 
 
486 aa  273  4.0000000000000004e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.190049 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2087  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  35 
 
 
485 aa  266  8e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.611219 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2764  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  33.83 
 
 
517 aa  264  3e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.63902 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2101  NCS1 nucleoside transporter family  34.75 
 
 
500 aa  254  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2385  NCS1 nucleoside transporter family  35.5 
 
 
492 aa  249  9e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1985  NCS1 nucleoside transporter family  35.08 
 
 
517 aa  247  4e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.671932  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5168  NCS1 nucleoside transporter family  32.95 
 
 
524 aa  243  6e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.409771 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0222  NCS1 nucleoside transporter  34.04 
 
 
509 aa  232  1e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4536  NCS1 nucleoside transporter family  33.01 
 
 
533 aa  229  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.854613  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2863  NCS1 nucleoside transporter  33.05 
 
 
497 aa  227  5.0000000000000005e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1430  NCS1 family nucleobase/cation symporter  33.76 
 
 
503 aa  225  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0230  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  32.13 
 
 
486 aa  225  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.239977 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3444  NCS1 nucleoside transporter family  32.53 
 
 
507 aa  225  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000477865  normal  0.0865773 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1533  NCS1 nucleoside transporter  34.53 
 
 
503 aa  224  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.578632  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2688  NCS1 nucleoside transporter family  34.32 
 
 
503 aa  223  6e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.931856  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00768  cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin transporter  33.81 
 
 
499 aa  223  6e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3590  NCS1 nucleoside transporter  33.54 
 
 
490 aa  223  8e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.483466 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5964  NCS1 nucleoside transporter  34.89 
 
 
502 aa  223  8e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0145337  normal  0.627469 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5720  NCS1 nucleoside transporter  35.11 
 
 
502 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244182  normal  0.497544 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1594  NCS1 nucleoside transporter  34.44 
 
 
502 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6237  NCS1 nucleoside transporter  34.44 
 
 
502 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.155037 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6713  NCS1 nucleoside transporter  34.56 
 
 
502 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.997894 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0338  NCS1 nucleoside transporter  33.33 
 
 
496 aa  219  7e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0570  allantoin permease  30.72 
 
 
484 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.635464  normal  0.884181 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0575  allantoin permease  30.72 
 
 
484 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.240762  normal  0.88047 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1233  transporter transmembrane protein  33.4 
 
 
502 aa  219  7.999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0759006  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6657  cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin transporter  33.68 
 
 
502 aa  219  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal  0.0268783 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0629  allantoin permease  30.51 
 
 
484 aa  219  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2516  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  31.59 
 
 
479 aa  219  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.751632  normal  0.0734451 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0568  allantoin permease  30.74 
 
 
484 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>