167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1953 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1302  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  86.65 
 
 		 498 aa  828    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5845  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  72.29 
 
 		 499 aa  682    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149577 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1510  NCS1 nucleoside transporter family protein  87.68 
 
 		 496 aa  838    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2535  NCS1 nucleoside transporter family protein  87.68 
 
 		 534 aa  839    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.173195  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3935  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  69.04 
 
 		 497 aa  692    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461112  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5280  permease  96.15 
 
 		 494 aa  932    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0491741 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2065  NCS1 nucleoside transporter family protein  87.68 
 
 		 496 aa  840    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1924  NCS1 family nucleobase/cation symporter  84.73 
 
 		 493 aa  808    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.713736 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6112  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  96.96 
 
 		 494 aa  915    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4869  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  67.22 
 
 		 518 aa  650    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1880  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  98.79 
 
 		 494 aa  974    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425689  normal  0.296294 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1953  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  100 
 
 		 494 aa  984    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1298  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  68.98 
 
 		 496 aa  641    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0843718  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1965  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  96.96 
 
 		 494 aa  915    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1989  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  96.96 
 
 		 494 aa  917    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.598133  normal  0.623135 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4958  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  67.22 
 
 		 518 aa  650    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0932  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  67.42 
 
 		 517 aa  650    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1098  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  70.28 
 
 		 514 aa  693    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.286175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2009  NCS1 nucleoside transporter family protein  87.68 
 
 		 510 aa  838    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3810  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  67.71 
 
 		 497 aa  657    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3301  NCS1 nucleoside transporter family protein  87.68 
 
 		 534 aa  839    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2390  NCS1 nucleoside transporter family protein  87.68 
 
 		 496 aa  838    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2434  NCS1 nucleoside transporter family protein  87.68 
 
 		 510 aa  840    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1305  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  94.93 
 
 		 494 aa  924    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0354634 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5237  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  67.22 
 
 		 543 aa  649    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.111402  normal  0.975867 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1281  NCS1 nucleoside transporter family protein  87.68 
 
 		 496 aa  838    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.425173  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2331  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  83.5 
 
 		 493 aa  795    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.55059 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1814  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  66.94 
 
 		 522 aa  622  1e-177  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.627915  normal  0.010101 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1871  cytosine/purine/uracil/thiamine/allantoin permease family protein  66.08 
 
 		 483 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3531  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  66.38 
 
 		 483 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0729525 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3430  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  62.12 
 
 		 520 aa  585  1e-166  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3769  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  61.55 
 
 		 547 aa  573  1.0000000000000001e-162  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2680  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin family permease  60.17 
 
 		 494 aa  572  1.0000000000000001e-162  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0268197 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1056  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin family permease  60.17 
 
 		 494 aa  572  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1110  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  59.96 
 
 		 494 aa  570  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.852121  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0866  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  60.34 
 
 		 494 aa  565  1e-160  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0913  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  60.48 
 
 		 486 aa  566  1e-160  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0656  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  59.58 
 
 		 494 aa  559  1e-158  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.871285  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0898  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  59.91 
 
 		 493 aa  556  1e-157  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0472  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  55.63 
 
 		 478 aa  496  1e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2834  NCS1 nucleoside transporter  53.02 
 
 		 482 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4033  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  47.51 
 
 		 497 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4265  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  42.89 
 
 		 503 aa  382  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.864327 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0843  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  42.86 
 
 		 488 aa  373  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1756  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  40.25 
 
 		 514 aa  362  9e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4599  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  43.02 
 
 		 490 aa  360  2e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2039  cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin transporter  40 
 
 		 516 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0859563  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4336  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  41.13 
 
 		 516 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0269962  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4030  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  41.13 
 
 		 516 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0915622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1778  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  41.68 
 
 		 506 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3494  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  40.91 
 
 		 516 aa  352  7e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000614437 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4309  NCS1 nucleoside transporter  41.34 
 
 		 510 aa  348  9e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3875  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  41.13 
 
 		 510 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.245681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1558  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  41.13 
 
 		 510 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3636  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  41.77 
 
 		 510 aa  341  1e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.542262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06230  putative permease  40.91 
 
 		 575 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.037417 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0582  putative permease  41.2 
 
 		 575 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1918  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  38.99 
 
 		 503 aa  333  4e-90  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.991169 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0075  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  40.38 
 
 		 485 aa  333  6e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.82012  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0335  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  40.91 
 
 		 483 aa  326  6e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3170  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  41.13 
 
 		 536 aa  322  9.000000000000001e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2764  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  40 
 
 		 517 aa  320  3e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.63902 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3194  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  39.02 
 
 		 522 aa  319  7.999999999999999e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2027  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  41.97 
 
 		 515 aa  315  9.999999999999999e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1836  NCS1 nucleoside transporter family protein  39.61 
 
 		 487 aa  309  5.9999999999999995e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.729443  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1908  NCS1 nucleoside transporter family protein  39.61 
 
 		 487 aa  305  2.0000000000000002e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.535002  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0400  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  38.62 
 
 		 483 aa  301  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0904039 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3413  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  40.6 
 
 		 569 aa  299  6e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3578  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  39.33 
 
 		 486 aa  293  4e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.190049 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5091  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  38.19 
 
 		 483 aa  289  9e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415087  normal  0.0197454 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1280  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  38.54 
 
 		 483 aa  287  2.9999999999999996e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5371  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  37.55 
 
 		 484 aa  286  7e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.583261  normal  0.663394 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2087  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  40.6 
 
 		 485 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.611219 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2101  NCS1 nucleoside transporter family  34.73 
 
 		 500 aa  232  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4536  NCS1 nucleoside transporter family  35.99 
 
 		 533 aa  226  6e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.854613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2385  NCS1 nucleoside transporter family  33.95 
 
 		 492 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5168  NCS1 nucleoside transporter family  33.33 
 
 		 524 aa  212  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.409771 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0222  NCS1 nucleoside transporter  35.89 
 
 		 509 aa  212  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1985  NCS1 nucleoside transporter family  32.78 
 
 		 517 aa  210  5e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.671932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2863  NCS1 nucleoside transporter  29.7 
 
 		 497 aa  208  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0230  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  32.4 
 
 		 486 aa  205  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.239977 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0575  allantoin permease  29.81 
 
 		 484 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.240762  normal  0.88047 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0570  allantoin permease  29.81 
 
 		 484 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.635464  normal  0.884181 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0568  allantoin permease  29.81 
 
 		 484 aa  202  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3590  NCS1 nucleoside transporter  32.64 
 
 		 490 aa  201  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.483466 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0629  allantoin permease  29.81 
 
 		 484 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0553  allantoin permease  29.18 
 
 		 484 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.962113 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3444  NCS1 nucleoside transporter family  30 
 
 		 507 aa  197  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000477865  normal  0.0865773 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1533  NCS1 nucleoside transporter  30.68 
 
 		 503 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.578632  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4056  NCS1 nucleoside transporter  29.79 
 
 		 515 aa  195  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0547  allantoin permease  28.96 
 
 		 484 aa  194  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00461  predicted allantoin transporter  28.75 
 
 		 484 aa  193  6e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.592868  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3102  NCS1 nucleoside transporter family  28.75 
 
 		 484 aa  193  6e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00466  hypothetical protein  28.75 
 
 		 484 aa  193  6e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.955616  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3112  allantoin permease  28.75 
 
 		 484 aa  193  6e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.379099 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1430  NCS1 family nucleobase/cation symporter  30.33 
 
 		 503 aa  193  8e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0611  allantoin permease  28.73 
 
 		 463 aa  192  9e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0584  allantoin permease  28.69 
 
 		 484 aa  192  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2688  NCS1 nucleoside transporter family  30.33 
 
 		 503 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.931856  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4035  NCS1 nucleoside transporter  30.63 
 
 		 496 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>