78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0801 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A2333  cytosine permease  82.34 
 
 
420 aa  659    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1032  cytosine permease  82.34 
 
 
441 aa  659    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1118  cytosine permease  82.58 
 
 
441 aa  661    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0801  cytosine permease  100 
 
 
431 aa  857    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141599  normal  0.241333 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1641  cytosine permease  82.82 
 
 
420 aa  659    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.18791  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1833  cytosine permease  82.1 
 
 
441 aa  633  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0184024  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0601  cytosine permease  82.1 
 
 
420 aa  634  1e-180  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0866  cytosine permease  82.1 
 
 
441 aa  633  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0779  cytosine permease  76.72 
 
 
421 aa  614  9.999999999999999e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.99673  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2529  cytosine permease  73.44 
 
 
421 aa  596  1e-169  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0365158  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3187  cytosine permease  73.68 
 
 
421 aa  595  1e-169  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2208  cytosine permease  73.65 
 
 
421 aa  588  1e-167  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.739585 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2654  cytosine permease  72.73 
 
 
421 aa  587  1e-166  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2351  cytosine permease  58.98 
 
 
411 aa  482  1e-135  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1584  cytosine permease  57.39 
 
 
417 aa  461  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3778  cytosine permease  60.49 
 
 
423 aa  457  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0843  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  57.03 
 
 
420 aa  414  1e-114  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.27545  normal  0.552006 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2453  cytosine permease  49.11 
 
 
414 aa  347  2e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00980  purine-cytosine permease-like transporter  36.46 
 
 
427 aa  229  8e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0863  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  37.65 
 
 
440 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0539  cytosine permease  35.08 
 
 
416 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05700  cytosine permease  34.84 
 
 
416 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000566  cytosine/purine/uracil/thiamine/allantoin permease family protein  34.62 
 
 
412 aa  219  7e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113273  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3524  cytosine permease  34.69 
 
 
417 aa  217  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3596  cytosine permease  34.69 
 
 
417 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3631  cytosine permease  34.45 
 
 
425 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.822935 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05320  cytosine permease  33.73 
 
 
412 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0409  cytosine permease  34.99 
 
 
419 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0401  cytosine permease  34.99 
 
 
419 aa  213  5.999999999999999e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0360  cytosine permease  34.99 
 
 
419 aa  213  5.999999999999999e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0367  cytosine permease  34.99 
 
 
419 aa  213  7e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.506759 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00290  cytosine transporter  34.99 
 
 
419 aa  213  7e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3270  NCS1 nucleoside transporter family  34.99 
 
 
419 aa  213  7e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3289  cytosine permease  34.99 
 
 
419 aa  213  7e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00294  hypothetical protein  34.99 
 
 
419 aa  213  7e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0016  cytosine permease  34.13 
 
 
417 aa  209  1e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3693  cytosine permease  34.45 
 
 
425 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3526  cytosine permease  34.45 
 
 
449 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0630  cytosine permease  34.04 
 
 
417 aa  200  5e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.201877  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2802  cytosine permease  34.22 
 
 
421 aa  194  3e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.018065  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2188  cytosine permease  33.17 
 
 
421 aa  189  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1854  cytosine permease  34.46 
 
 
395 aa  166  9e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.382094  hitchhiker  0.0000028856 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0157  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin family permease  24.57 
 
 
460 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.489113  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1993  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  27.12 
 
 
443 aa  112  9e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1828  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  26.54 
 
 
455 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1725  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  26.22 
 
 
434 aa  110  6e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1545  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  27.2 
 
 
441 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0426  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.88 
 
 
448 aa  103  9e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.203282  normal  0.440595 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2449  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  23.75 
 
 
453 aa  95.9  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0650  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  26.03 
 
 
472 aa  95.1  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0343903 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0862  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.77 
 
 
455 aa  94.4  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000967478  normal  0.747959 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4194  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  22.4 
 
 
431 aa  92  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22900  purine-cytosine permease-like transporter  26.58 
 
 
455 aa  90.5  5e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.383587 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0815  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.88 
 
 
438 aa  90.5  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1591  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  26.01 
 
 
456 aa  89.7  8e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3060  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.39 
 
 
460 aa  88.2  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2198  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  23.59 
 
 
445 aa  87  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0171933  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3584  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.94 
 
 
438 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3201  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.52 
 
 
424 aa  85.5  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1044  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.17 
 
 
438 aa  85.1  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.955284  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1965  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  22.89 
 
 
439 aa  82.8  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0413  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  23.6 
 
 
432 aa  81.6  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3279  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.41 
 
 
431 aa  76.6  0.0000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00201301  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3367  putative cytosine permease  24.46 
 
 
439 aa  76.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.130336  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4197  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin family permease  22.45 
 
 
407 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118639 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3467  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  21.71 
 
 
439 aa  67  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03710  putative permease  23.13 
 
 
407 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03659  hypothetical protein  23.13 
 
 
407 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1794  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  23.43 
 
 
446 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5168  NCS1 nucleoside transporter family  25.3 
 
 
524 aa  50.1  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.409771 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09360  probable hydroxymethylpyrimidine transporter CytX  23.59 
 
 
416 aa  48.9  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.268783 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0774  NCS1 nucleoside transporter family protein  23.53 
 
 
494 aa  48.1  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.182472 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0676  NCS1 nucleoside transporter  22.27 
 
 
486 aa  47  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.579692  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1233  transporter transmembrane protein  24.8 
 
 
502 aa  46.6  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0759006  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0257  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  23.01 
 
 
458 aa  46.2  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000119311  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6657  cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin transporter  23.9 
 
 
502 aa  45.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal  0.0268783 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1111  NCS1 nucleoside transporter  22.66 
 
 
494 aa  43.9  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.502762  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5706  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  23.38 
 
 
479 aa  43.9  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.829822  normal  0.11286 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>