215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_0676 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009707  JJD26997_0676  NCS1 nucleoside transporter  100 
 
 
486 aa  966    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.579692  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4351  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  56.77 
 
 
490 aa  520  1e-146  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3911  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  53.48 
 
 
499 aa  475  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.971412  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3174  NCS1 nucleoside transporter  52.87 
 
 
499 aa  472  1e-132  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0262  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  31.32 
 
 
468 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2959  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  29.23 
 
 
468 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0968  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  30 
 
 
489 aa  176  7e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.553781  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4150  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  29.37 
 
 
494 aa  175  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0222  NCS1 nucleoside transporter  28.74 
 
 
509 aa  169  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0333  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  28.73 
 
 
451 aa  160  6e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1111  NCS1 nucleoside transporter  29.22 
 
 
494 aa  159  8e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.502762  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0076  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  28.47 
 
 
449 aa  158  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00450378  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0678  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  28.89 
 
 
450 aa  158  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.232179  normal  0.0587875 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2210  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  26.71 
 
 
502 aa  155  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2863  NCS1 nucleoside transporter  26.42 
 
 
497 aa  154  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4056  NCS1 nucleoside transporter  27.56 
 
 
515 aa  154  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4536  NCS1 nucleoside transporter family  27.43 
 
 
533 aa  154  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.854613  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0405  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  29.51 
 
 
452 aa  152  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0202053  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0338  NCS1 nucleoside transporter  28.24 
 
 
496 aa  150  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2385  NCS1 nucleoside transporter family  26.4 
 
 
492 aa  150  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1985  NCS1 nucleoside transporter family  26.4 
 
 
517 aa  149  8e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.671932  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00768  cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin transporter  28.2 
 
 
499 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5168  NCS1 nucleoside transporter family  27.71 
 
 
524 aa  148  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.409771 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1176  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  27.8 
 
 
464 aa  143  8e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2101  NCS1 nucleoside transporter family  28.7 
 
 
500 aa  143  8e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5964  NCS1 nucleoside transporter  27.59 
 
 
502 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0145337  normal  0.627469 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5720  NCS1 nucleoside transporter  27.59 
 
 
502 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244182  normal  0.497544 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3590  NCS1 nucleoside transporter  27.65 
 
 
490 aa  141  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.483466 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1594  NCS1 nucleoside transporter  26.88 
 
 
502 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6237  NCS1 nucleoside transporter  26.88 
 
 
502 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.155037 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3444  NCS1 nucleoside transporter family  27.1 
 
 
507 aa  140  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000477865  normal  0.0865773 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2688  NCS1 nucleoside transporter family  25.71 
 
 
503 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.931856  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5352  NCS1 nucleoside transporter  27.4 
 
 
502 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.157454 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1533  NCS1 nucleoside transporter  26.19 
 
 
503 aa  140  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.578632  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6657  cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin transporter  26.64 
 
 
502 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal  0.0268783 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6713  NCS1 nucleoside transporter  27.09 
 
 
502 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.997894 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1430  NCS1 family nucleobase/cation symporter  25.49 
 
 
503 aa  139  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1803  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  26.01 
 
 
496 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.666463  normal  0.799889 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1233  transporter transmembrane protein  25.97 
 
 
502 aa  137  5e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0759006  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4035  NCS1 nucleoside transporter  26.01 
 
 
496 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3637  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.78 
 
 
505 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3440  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  25.49 
 
 
494 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.709152  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49824  NCS1 family transporter: cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin  26.19 
 
 
532 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1837  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.87 
 
 
500 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.524757  normal  0.0916284 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0774  NCS1 nucleoside transporter family protein  26.81 
 
 
494 aa  120  7e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.182472 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2516  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.22 
 
 
479 aa  114  5e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.751632  normal  0.0734451 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05790  putative transporter  26.9 
 
 
496 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0546  putative transporter  26.9 
 
 
496 aa  111  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2039  cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin transporter  24.89 
 
 
516 aa  107  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0859563  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4336  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  24.89 
 
 
516 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0269962  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4030  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  24.89 
 
 
516 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0915622  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4599  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  22.45 
 
 
490 aa  105  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0230  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.35 
 
 
486 aa  104  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.239977 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3494  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.68 
 
 
516 aa  104  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000614437 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0568  allantoin permease  23.59 
 
 
484 aa  104  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4033  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  22.5 
 
 
497 aa  103  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0575  allantoin permease  23.39 
 
 
484 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.240762  normal  0.88047 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0570  allantoin permease  23.39 
 
 
484 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.635464  normal  0.884181 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2764  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  24.24 
 
 
517 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.63902 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1756  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  24.18 
 
 
514 aa  102  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3170  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  25.58 
 
 
536 aa  101  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185762  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0629  allantoin permease  23.39 
 
 
484 aa  101  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2834  NCS1 nucleoside transporter  24.79 
 
 
482 aa  100  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2703  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.23 
 
 
492 aa  99.8  9e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1389  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  22.69 
 
 
530 aa  100  9e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.461228  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0335  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  25.06 
 
 
483 aa  99.4  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3636  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.87 
 
 
510 aa  97.1  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.542262  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1918  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  23.08 
 
 
503 aa  96.7  9e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.991169 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3875  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.41 
 
 
510 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.245681  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1836  NCS1 nucleoside transporter family protein  23.73 
 
 
487 aa  95.9  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.729443  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3430  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  24.21 
 
 
520 aa  95.5  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4265  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  23.68 
 
 
503 aa  95.9  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.864327 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1558  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  25.17 
 
 
510 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462684  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3769  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  22.36 
 
 
547 aa  94.4  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3194  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.65 
 
 
522 aa  94  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08416  conserved hypothetical protein  26.61 
 
 
527 aa  93.2  8e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1908  NCS1 nucleoside transporter family protein  23.19 
 
 
487 aa  93.2  9e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.535002  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4309  NCS1 nucleoside transporter  25.35 
 
 
510 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747865  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1431  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  22.46 
 
 
486 aa  93.2  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3935  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  22.15 
 
 
497 aa  92.8  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461112  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3413  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  28.53 
 
 
569 aa  92.8  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5237  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  23.71 
 
 
543 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.111402  normal  0.975867 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5845  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  23.38 
 
 
499 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149577 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0932  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  23.42 
 
 
517 aa  91.3  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4869  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  23.45 
 
 
518 aa  90.9  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4958  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  23.45 
 
 
518 aa  90.9  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0075  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  25.19 
 
 
485 aa  90.1  8e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.82012  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1098  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  22.84 
 
 
514 aa  88.6  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.286175  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1110  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  23.43 
 
 
494 aa  88.2  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.852121  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2759  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  23.2 
 
 
457 aa  88.6  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2680  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin family permease  23.43 
 
 
494 aa  88.2  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0268197 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1056  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin family permease  23.43 
 
 
494 aa  88.2  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00461  predicted allantoin transporter  22.46 
 
 
484 aa  86.7  8e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.592868  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3102  NCS1 nucleoside transporter family  22.46 
 
 
484 aa  86.7  8e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3112  allantoin permease  22.46 
 
 
484 aa  86.7  8e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.379099 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00466  hypothetical protein  22.46 
 
 
484 aa  86.7  8e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.955616  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0843  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  23.18 
 
 
488 aa  85.9  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1814  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  22.82 
 
 
522 aa  86.7  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.627915  normal  0.010101 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0584  allantoin permease  22.46 
 
 
484 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0547  allantoin permease  22.27 
 
 
484 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>