197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0262 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0262  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  100 
 
 
468 aa  946    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2959  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  61.51 
 
 
468 aa  598  1e-170  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0676  NCS1 nucleoside transporter  31.32 
 
 
486 aa  204  2e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.579692  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0405  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  31.54 
 
 
452 aa  186  5e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0202053  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4351  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  31.71 
 
 
490 aa  186  5e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3911  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  32.1 
 
 
499 aa  183  6e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.971412  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0968  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  32.28 
 
 
489 aa  181  4e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.553781  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3174  NCS1 nucleoside transporter  31.88 
 
 
499 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1430  NCS1 family nucleobase/cation symporter  28.49 
 
 
503 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0678  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  29.8 
 
 
450 aa  174  3.9999999999999995e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.232179  normal  0.0587875 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0076  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  30.44 
 
 
449 aa  172  9e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00450378  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2688  NCS1 nucleoside transporter family  28.69 
 
 
503 aa  172  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.931856  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4150  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  30.04 
 
 
494 aa  171  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1985  NCS1 nucleoside transporter family  28.83 
 
 
517 aa  171  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.671932  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2385  NCS1 nucleoside transporter family  28.92 
 
 
492 aa  169  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2863  NCS1 nucleoside transporter  29.56 
 
 
497 aa  168  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0333  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  30.47 
 
 
451 aa  168  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1533  NCS1 nucleoside transporter  27.77 
 
 
503 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.578632  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1176  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  28.51 
 
 
464 aa  159  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1233  transporter transmembrane protein  27.44 
 
 
502 aa  158  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0759006  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3444  NCS1 nucleoside transporter family  27.8 
 
 
507 aa  158  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000477865  normal  0.0865773 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3590  NCS1 nucleoside transporter  29.44 
 
 
490 aa  157  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.483466 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6713  NCS1 nucleoside transporter  29.5 
 
 
502 aa  157  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.997894 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1594  NCS1 nucleoside transporter  29.28 
 
 
502 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6237  NCS1 nucleoside transporter  29.28 
 
 
502 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.155037 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6657  cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin transporter  28.69 
 
 
502 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal  0.0268783 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5964  NCS1 nucleoside transporter  28.67 
 
 
502 aa  153  7e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0145337  normal  0.627469 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2703  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.15 
 
 
492 aa  152  1e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0222  NCS1 nucleoside transporter  28.37 
 
 
509 aa  152  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5720  NCS1 nucleoside transporter  28.22 
 
 
502 aa  151  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244182  normal  0.497544 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5352  NCS1 nucleoside transporter  27.94 
 
 
502 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.157454 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2210  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.51 
 
 
502 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49824  NCS1 family transporter: cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin  29.91 
 
 
532 aa  144  4e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3112  allantoin permease  27.23 
 
 
484 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.379099 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00461  predicted allantoin transporter  27.23 
 
 
484 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.592868  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3102  NCS1 nucleoside transporter family  27.23 
 
 
484 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0584  allantoin permease  27.23 
 
 
484 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00466  hypothetical protein  27.23 
 
 
484 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.955616  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4056  NCS1 nucleoside transporter  28.66 
 
 
515 aa  140  6e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0338  NCS1 nucleoside transporter  27.53 
 
 
496 aa  139  8.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4536  NCS1 nucleoside transporter family  27.27 
 
 
533 aa  139  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.854613  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0547  allantoin permease  26.82 
 
 
484 aa  139  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0553  allantoin permease  27.79 
 
 
484 aa  139  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.962113 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00768  cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin transporter  29.07 
 
 
499 aa  139  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0568  allantoin permease  26.34 
 
 
484 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0575  allantoin permease  27 
 
 
484 aa  138  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.240762  normal  0.88047 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0570  allantoin permease  27 
 
 
484 aa  138  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.635464  normal  0.884181 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3637  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  29.31 
 
 
505 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4035  NCS1 nucleoside transporter  29.46 
 
 
496 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0611  allantoin permease  28.02 
 
 
463 aa  137  4e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1803  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  29.46 
 
 
496 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.666463  normal  0.799889 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3440  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  29.28 
 
 
494 aa  137  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.709152  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0629  allantoin permease  27.23 
 
 
484 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1837  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  30.51 
 
 
500 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.524757  normal  0.0916284 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1111  NCS1 nucleoside transporter  27.01 
 
 
494 aa  135  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.502762  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2101  NCS1 nucleoside transporter family  26.62 
 
 
500 aa  133  7.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4336  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  25.57 
 
 
516 aa  131  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0269962  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05790  putative transporter  30.08 
 
 
496 aa  131  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4030  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  25.57 
 
 
516 aa  131  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0915622  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3494  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.57 
 
 
516 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000614437 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0230  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.82 
 
 
486 aa  130  6e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.239977 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2039  cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin transporter  25.26 
 
 
516 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0859563  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1756  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  25 
 
 
514 aa  128  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0546  putative transporter  29.87 
 
 
496 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5168  NCS1 nucleoside transporter family  26.9 
 
 
524 aa  126  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.409771 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4309  NCS1 nucleoside transporter  24.8 
 
 
510 aa  121  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747865  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1558  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  24.8 
 
 
510 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462684  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3194  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.86 
 
 
522 aa  119  9e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4599  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  26.35 
 
 
490 aa  119  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3875  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.25 
 
 
510 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.245681  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3636  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.41 
 
 
510 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.542262  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3170  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  22.95 
 
 
536 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185762  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3935  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.29 
 
 
497 aa  115  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461112  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4265  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  26.35 
 
 
503 aa  113  7.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.864327 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1431  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  23.94 
 
 
486 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2516  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  23.6 
 
 
479 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.751632  normal  0.0734451 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2834  NCS1 nucleoside transporter  24.95 
 
 
482 aa  111  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0843  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.28 
 
 
488 aa  110  5e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1098  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  25.12 
 
 
514 aa  108  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.286175  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1836  NCS1 nucleoside transporter family protein  27.42 
 
 
487 aa  109  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.729443  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1918  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  24.8 
 
 
503 aa  107  4e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.991169 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3413  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  26.09 
 
 
569 aa  107  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2027  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.35 
 
 
515 aa  107  6e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4033  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  22.48 
 
 
497 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06230  putative permease  24.38 
 
 
575 aa  104  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.037417 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5845  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.07 
 
 
499 aa  105  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149577 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0913  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.95 
 
 
486 aa  103  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0774  NCS1 nucleoside transporter family protein  25.85 
 
 
494 aa  103  7e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.182472 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1778  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  22.66 
 
 
506 aa  103  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1908  NCS1 nucleoside transporter family protein  27.19 
 
 
487 aa  102  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.535002  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08416  conserved hypothetical protein  24.67 
 
 
527 aa  102  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0400  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  26.06 
 
 
483 aa  102  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0904039 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3810  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  23.92 
 
 
497 aa  102  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5371  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  27.21 
 
 
484 aa  101  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.583261  normal  0.663394 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0582  putative permease  23.97 
 
 
575 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1298  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.77 
 
 
496 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0843718  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1280  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.51 
 
 
483 aa  100  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0075  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  24.22 
 
 
485 aa  99.8  9e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.82012  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02280  hypothetical protein  24.6 
 
 
573 aa  98.6  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.104271  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1302  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.01 
 
 
498 aa  98.2  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155408  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>