108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_00980 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_00980  purine-cytosine permease-like transporter  100 
 
 		 427 aa  820    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0863  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  62.72 
 
 		 440 aa  474  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3778  cytosine permease  40.65 
 
 		 423 aa  263  4e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1584  cytosine permease  38.66 
 
 		 417 aa  257  3e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0843  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  40.75 
 
 		 420 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.27545  normal  0.552006 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2351  cytosine permease  39.2 
 
 		 411 aa  242  9e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0539  cytosine permease  35.86 
 
 		 416 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1641  cytosine permease  39.66 
 
 		 420 aa  227  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.18791  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05700  cytosine permease  35.61 
 
 		 416 aa  226  6e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2333  cytosine permease  38.9 
 
 		 420 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1118  cytosine permease  38.87 
 
 		 441 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1032  cytosine permease  38.61 
 
 		 441 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2529  cytosine permease  35.98 
 
 		 421 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0365158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2654  cytosine permease  36.43 
 
 		 421 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3187  cytosine permease  35.59 
 
 		 421 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0779  cytosine permease  36.41 
 
 		 421 aa  216  5.9999999999999996e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.99673  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0801  cytosine permease  36.46 
 
 		 431 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141599  normal  0.241333 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2208  cytosine permease  34.92 
 
 		 421 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.739585 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000566  cytosine/purine/uracil/thiamine/allantoin permease family protein  33 
 
 		 412 aa  211  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113273  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0866  cytosine permease  38.61 
 
 		 441 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1833  cytosine permease  38.61 
 
 		 441 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0184024  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0601  cytosine permease  39.01 
 
 		 420 aa  211  3e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2453  cytosine permease  38.9 
 
 		 414 aa  210  5e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3524  cytosine permease  34.76 
 
 		 417 aa  209  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3596  cytosine permease  34.76 
 
 		 417 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3631  cytosine permease  34.76 
 
 		 425 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.822935 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0016  cytosine permease  33.17 
 
 		 417 aa  208  2e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0630  cytosine permease  33.16 
 
 		 417 aa  204  2e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.201877  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0409  cytosine permease  34.66 
 
 		 419 aa  204  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00290  cytosine transporter  34.41 
 
 		 419 aa  203  5e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3270  NCS1 nucleoside transporter family  34.41 
 
 		 419 aa  203  5e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0360  cytosine permease  34.41 
 
 		 419 aa  203  5e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3289  cytosine permease  34.41 
 
 		 419 aa  203  5e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0367  cytosine permease  34.41 
 
 		 419 aa  203  5e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.506759 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00294  hypothetical protein  34.41 
 
 		 419 aa  203  5e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05320  cytosine permease  32.41 
 
 		 412 aa  203  6e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0401  cytosine permease  34.41 
 
 		 419 aa  203  6e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3526  cytosine permease  34.76 
 
 		 449 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3693  cytosine permease  34.51 
 
 		 425 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2802  cytosine permease  32.07 
 
 		 421 aa  183  6e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.018065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2188  cytosine permease  32.41 
 
 		 421 aa  180  4e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1854  cytosine permease  30.93 
 
 		 395 aa  151  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.382094  hitchhiker  0.0000028856 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1044  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.46 
 
 		 438 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.955284  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0815  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  26.67 
 
 		 438 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0650  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  29.92 
 
 		 472 aa  110  6e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0343903 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1591  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.31 
 
 		 456 aa  105  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2198  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.64 
 
 		 445 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0171933  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0413  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.71 
 
 		 432 aa  99.8  9e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1725  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.58 
 
 		 434 aa  98.2  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4194  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  23.67 
 
 		 431 aa  97.4  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3584  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.23 
 
 		 438 aa  97.4  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3279  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.59 
 
 		 431 aa  96.7  6e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00201301  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1965  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  25 
 
 		 439 aa  94.7  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3367  putative cytosine permease  25.95 
 
 		 439 aa  94  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.130336  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0426  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  26.24 
 
 		 448 aa  91.7  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.203282  normal  0.440595 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1993  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  23.6 
 
 		 443 aa  90.9  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1545  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  26.62 
 
 		 441 aa  90.5  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3201  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.2 
 
 		 424 aa  89.7  8e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2449  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.34 
 
 		 453 aa  88.2  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3060  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  26.44 
 
 		 460 aa  88.6  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0157  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin family permease  23.29 
 
 		 460 aa  85.9  0.000000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.489113  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22900  purine-cytosine permease-like transporter  27.14 
 
 		 455 aa  82.8  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.383587 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1828  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  27.06 
 
 		 455 aa  80.1  0.00000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0862  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  23.34 
 
 		 455 aa  74.7  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000967478  normal  0.747959 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3467  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  21.04 
 
 		 439 aa  73.2  0.000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1111  NCS1 nucleoside transporter  22.47 
 
 		 494 aa  60.1  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.502762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1794  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  24.8 
 
 		 446 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4197  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin family permease  22.84 
 
 		 407 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118639 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1233  transporter transmembrane protein  26.63 
 
 		 502 aa  57  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0759006  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03710  putative permease  23.12 
 
 		 407 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03659  hypothetical protein  23.12 
 
 		 407 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5352  NCS1 nucleoside transporter  25.81 
 
 		 502 aa  54.3  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.157454 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5964  NCS1 nucleoside transporter  26.44 
 
 		 502 aa  53.1  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0145337  normal  0.627469 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4921  NCS1 nucleoside transporter  26.3 
 
 		 427 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0951814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1599  putative hydroxymethylpyrimidine transporter CytX  22.68 
 
 		 389 aa  52.4  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0130344  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00768  cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin transporter  22.02 
 
 		 499 aa  53.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0338  NCS1 nucleoside transporter  25.51 
 
 		 496 aa  52.4  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2863  NCS1 nucleoside transporter  22.85 
 
 		 497 aa  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1594  NCS1 nucleoside transporter  26.03 
 
 		 502 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6237  NCS1 nucleoside transporter  26.03 
 
 		 502 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.155037 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4797  putative hydroxymethylpyrimidine transporter CytX  25.83 
 
 		 427 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5720  NCS1 nucleoside transporter  25.58 
 
 		 502 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244182  normal  0.497544 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2688  NCS1 nucleoside transporter family  24.78 
 
 		 503 aa  50.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.931856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4974  hydroxymethylpyrimidine transporter CytX  26.49 
 
 		 427 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1176  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  27.64 
 
 		 464 aa  50.4  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1430  NCS1 family nucleobase/cation symporter  23.92 
 
 		 503 aa  50.1  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49824  NCS1 family transporter: cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin  25.49 
 
 		 532 aa  50.1  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1533  NCS1 nucleoside transporter  24.21 
 
 		 503 aa  50.1  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.578632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3440  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  22.87 
 
 		 494 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.709152  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0076  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  22.51 
 
 		 449 aa  49.3  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00450378  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2841  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  24.93 
 
 		 444 aa  49.3  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.810699  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6713  NCS1 nucleoside transporter  26.03 
 
 		 502 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.997894 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4035  NCS1 nucleoside transporter  23.08 
 
 		 496 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3413  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  39.34 
 
 		 569 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1803  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  23.08 
 
 		 496 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.666463  normal  0.799889 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3637  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  22.71 
 
 		 505 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5168  NCS1 nucleoside transporter family  23.85 
 
 		 524 aa  46.6  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.409771 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6657  cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin transporter  25.59 
 
 		 502 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal  0.0268783 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3194  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  36.07 
 
 		 522 aa  46.2  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1042  hydroxymethylpyrimidine transporter CytX  26.2 
 
 		 438 aa  44.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144538  normal  0.528331 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>