78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMAA0601 on replicon NC_006349
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0801  cytosine permease  82.1 
 
 		 431 aa  680    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141599  normal  0.241333 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1118  cytosine permease  99.52 
 
 		 441 aa  820    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0866  cytosine permease  100 
 
 		 441 aa  825    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1032  cytosine permease  99.29 
 
 		 441 aa  819    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1641  cytosine permease  96.9 
 
 		 420 aa  750    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.18791  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1833  cytosine permease  100 
 
 		 441 aa  825    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0184024  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2333  cytosine permease  98.81 
 
 		 420 aa  816    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0601  cytosine permease  100 
 
 		 420 aa  827    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2529  cytosine permease  75.89 
 
 		 421 aa  625  1e-178  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0365158  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0779  cytosine permease  76.1 
 
 		 421 aa  625  1e-178  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.99673  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3187  cytosine permease  76.13 
 
 		 421 aa  623  1e-177  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2208  cytosine permease  75.85 
 
 		 421 aa  618  1e-176  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.739585 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2654  cytosine permease  75.66 
 
 		 421 aa  616  1e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2351  cytosine permease  60.15 
 
 		 411 aa  482  1e-135  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3778  cytosine permease  60.34 
 
 		 423 aa  461  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1584  cytosine permease  57.14 
 
 		 417 aa  459  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0843  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  54.59 
 
 		 420 aa  401  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.27545  normal  0.552006 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2453  cytosine permease  49.87 
 
 		 414 aa  352  8.999999999999999e-96  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00980  purine-cytosine permease-like transporter  38.15 
 
 		 427 aa  235  9e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05320  cytosine permease  34.54 
 
 		 412 aa  226  7e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0863  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  40.3 
 
 		 440 aa  224  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000566  cytosine/purine/uracil/thiamine/allantoin permease family protein  35.01 
 
 		 412 aa  222  8e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113273  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0539  cytosine permease  33.17 
 
 		 416 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05700  cytosine permease  32.93 
 
 		 416 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0360  cytosine permease  32.62 
 
 		 419 aa  216  7e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0401  cytosine permease  32.62 
 
 		 419 aa  216  7e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0409  cytosine permease  32.62 
 
 		 419 aa  216  7e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3289  cytosine permease  32.62 
 
 		 419 aa  216  8e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0367  cytosine permease  32.62 
 
 		 419 aa  216  8e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.506759 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00290  cytosine transporter  32.62 
 
 		 419 aa  216  8e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00294  hypothetical protein  32.62 
 
 		 419 aa  216  8e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3270  NCS1 nucleoside transporter family  32.62 
 
 		 419 aa  216  8e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3596  cytosine permease  33.41 
 
 		 417 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3524  cytosine permease  33.41 
 
 		 417 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0630  cytosine permease  36.71 
 
 		 417 aa  214  2.9999999999999995e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.201877  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3631  cytosine permease  32.94 
 
 		 425 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.822935 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3693  cytosine permease  32.94 
 
 		 425 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3526  cytosine permease  32.94 
 
 		 449 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0016  cytosine permease  31.62 
 
 		 417 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2802  cytosine permease  33.01 
 
 		 421 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.018065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2188  cytosine permease  32.14 
 
 		 421 aa  187  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1854  cytosine permease  33.93 
 
 		 395 aa  166  5e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.382094  hitchhiker  0.0000028856 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0157  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin family permease  25.71 
 
 		 460 aa  127  4.0000000000000003e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.489113  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1725  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  26.25 
 
 		 434 aa  114  5e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1828  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.81 
 
 		 455 aa  108  2e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1993  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  26.37 
 
 		 443 aa  106  7e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1545  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  27.55 
 
 		 441 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0426  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  26.02 
 
 		 448 aa  97.1  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.203282  normal  0.440595 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2449  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  23.23 
 
 		 453 aa  96.7  6e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2198  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25 
 
 		 445 aa  95.1  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0171933  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3584  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.25 
 
 		 438 aa  94.4  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4194  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  23.42 
 
 		 431 aa  94.4  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0650  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  28.66 
 
 		 472 aa  94  5e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0343903 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22900  purine-cytosine permease-like transporter  25.68 
 
 		 455 aa  89.4  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.383587 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3060  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.32 
 
 		 460 aa  87.4  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0815  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.07 
 
 		 438 aa  86.7  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1591  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  26.1 
 
 		 456 aa  86.7  8e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1044  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  22.94 
 
 		 438 aa  83.6  0.000000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.955284  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0862  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  23.04 
 
 		 455 aa  82  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000967478  normal  0.747959 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1965  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  22.41 
 
 		 439 aa  80.5  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0413  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.12 
 
 		 432 aa  79  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3279  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  23.33 
 
 		 431 aa  78.6  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00201301  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3201  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  22.75 
 
 		 424 aa  76.6  0.0000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3367  putative cytosine permease  24.42 
 
 		 439 aa  76.3  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.130336  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3467  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  22.98 
 
 		 439 aa  73.2  0.000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4197  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin family permease  24.12 
 
 		 407 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118639 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03710  putative permease  24.67 
 
 		 407 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03659  hypothetical protein  24.67 
 
 		 407 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1794  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  23.34 
 
 		 446 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2771  putative hydroxymethylpyrimidine transporter CytX  24.24 
 
 		 446 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0255944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2434  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  25.56 
 
 		 434 aa  46.2  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.116228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09360  probable hydroxymethylpyrimidine transporter CytX  23.7 
 
 		 416 aa  45.4  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.268783 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0690  transmembrane prediction  25.3 
 
 		 471 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0774  NCS1 nucleoside transporter family protein  23.74 
 
 		 494 aa  44.7  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.182472 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0676  NCS1 nucleoside transporter  27.27 
 
 		 486 aa  44.7  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.579692  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4921  NCS1 nucleoside transporter  23.95 
 
 		 427 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0951814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0628  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin permease family protein  25.06 
 
 		 474 aa  43.9  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.309989  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0831  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin permease family protein  25.17 
 
 		 474 aa  43.1  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.831321  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>