194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3367 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3367  putative cytosine permease  100 
 
 		 439 aa  846    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.130336  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0426  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  56.37 
 
 		 448 aa  479  1e-134  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.203282  normal  0.440595 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22900  purine-cytosine permease-like transporter  54.82 
 
 		 455 aa  430  1e-119  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.383587 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3584  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  45.77 
 
 		 438 aa  365  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1545  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  45.15 
 
 		 441 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2198  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  42.15 
 
 		 445 aa  330  4e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0171933  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0815  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  42.55 
 
 		 438 aa  324  2e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1044  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  41.83 
 
 		 438 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.955284  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4194  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  42.23 
 
 		 431 aa  320  1.9999999999999998e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3060  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  42.69 
 
 		 460 aa  318  2e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3279  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  42.72 
 
 		 431 aa  312  7.999999999999999e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00201301  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1965  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  39.95 
 
 		 439 aa  306  6e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3201  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  43.99 
 
 		 424 aa  302  8.000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0413  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  43.37 
 
 		 432 aa  301  2e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1725  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  30.44 
 
 		 434 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1993  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  30.08 
 
 		 443 aa  125  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05700  cytosine permease  31.09 
 
 		 416 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000566  cytosine/purine/uracil/thiamine/allantoin permease family protein  29.4 
 
 		 412 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113273  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0539  cytosine permease  31.09 
 
 		 416 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1828  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  28.51 
 
 		 455 aa  117  3.9999999999999997e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05320  cytosine permease  30.81 
 
 		 412 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2449  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  26.9 
 
 		 453 aa  114  5e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3596  cytosine permease  28.37 
 
 		 417 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3631  cytosine permease  28.1 
 
 		 425 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.822935 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0409  cytosine permease  27.12 
 
 		 419 aa  107  5e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0401  cytosine permease  27.12 
 
 		 419 aa  106  7e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00290  cytosine transporter  27.12 
 
 		 419 aa  106  8e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3270  NCS1 nucleoside transporter family  27.12 
 
 		 419 aa  106  8e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0367  cytosine permease  27.12 
 
 		 419 aa  106  8e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.506759 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00294  hypothetical protein  27.12 
 
 		 419 aa  106  8e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3524  cytosine permease  27.55 
 
 		 417 aa  106  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0360  cytosine permease  27.12 
 
 		 419 aa  106  8e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3289  cytosine permease  27.12 
 
 		 419 aa  106  8e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3778  cytosine permease  26.82 
 
 		 423 aa  106  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0862  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  27.17 
 
 		 455 aa  103  5e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000967478  normal  0.747959 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0843  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  26.01 
 
 		 420 aa  100  5e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.27545  normal  0.552006 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2802  cytosine permease  31.4 
 
 		 421 aa  100  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.018065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0016  cytosine permease  27.17 
 
 		 417 aa  100  5e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00980  purine-cytosine permease-like transporter  25.95 
 
 		 427 aa  100  8e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0650  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  32.5 
 
 		 472 aa  99.4  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0343903 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0630  cytosine permease  28.92 
 
 		 417 aa  97.1  6e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.201877  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0863  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  28.47 
 
 		 440 aa  95.1  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3693  cytosine permease  28.1 
 
 		 425 aa  93.2  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3526  cytosine permease  27.82 
 
 		 449 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2188  cytosine permease  30.03 
 
 		 421 aa  91.3  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3467  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  23.42 
 
 		 439 aa  90.9  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1584  cytosine permease  26.37 
 
 		 417 aa  90.1  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1854  cytosine permease  32.3 
 
 		 395 aa  88.2  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.382094  hitchhiker  0.0000028856 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0157  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin family permease  23.71 
 
 		 460 aa  86.3  9e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.489113  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0779  cytosine permease  23.63 
 
 		 421 aa  84  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.99673  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2654  cytosine permease  24.38 
 
 		 421 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2529  cytosine permease  24.86 
 
 		 421 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0365158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2208  cytosine permease  24.93 
 
 		 421 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.739585 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3187  cytosine permease  25.14 
 
 		 421 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2385  NCS1 nucleoside transporter family  26.68 
 
 		 492 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1985  NCS1 nucleoside transporter family  26.52 
 
 		 517 aa  80.5  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.671932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2453  cytosine permease  27.14 
 
 		 414 aa  79  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2351  cytosine permease  24.49 
 
 		 411 aa  78.2  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1032  cytosine permease  24.61 
 
 		 441 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3440  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  26.4 
 
 		 494 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.709152  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1118  cytosine permease  25.26 
 
 		 441 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2333  cytosine permease  22.99 
 
 		 420 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1591  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.03 
 
 		 456 aa  75.9  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0601  cytosine permease  25.33 
 
 		 420 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0866  cytosine permease  26.07 
 
 		 441 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1833  cytosine permease  26.07 
 
 		 441 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0184024  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0801  cytosine permease  25.5 
 
 		 431 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141599  normal  0.241333 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4197  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin family permease  26.16 
 
 		 407 aa  75.1  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118639 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4035  NCS1 nucleoside transporter  26.5 
 
 		 496 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1641  cytosine permease  23.51 
 
 		 420 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.18791  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1803  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  26.5 
 
 		 496 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.666463  normal  0.799889 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03710  putative permease  26.1 
 
 		 407 aa  73.6  0.000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3637  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.67 
 
 		 505 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03659  hypothetical protein  26.1 
 
 		 407 aa  73.6  0.000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2863  NCS1 nucleoside transporter  24.5 
 
 		 497 aa  73.2  0.000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05790  putative transporter  26.54 
 
 		 496 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0546  putative transporter  25.93 
 
 		 496 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1837  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  26.14 
 
 		 500 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.524757  normal  0.0916284 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4056  NCS1 nucleoside transporter  24.15 
 
 		 515 aa  67  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1353  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.44 
 
 		 1197 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1111  NCS1 nucleoside transporter  25.25 
 
 		 494 aa  65.1  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.502762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4598  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  23.12 
 
 		 493 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4239  histidine kinase  33.54 
 
 		 1211 aa  63.5  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1446  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  32.69 
 
 		 1131 aa  63.2  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.705679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3398  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.86 
 
 		 1202 aa  62.4  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.613847  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0978  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.86 
 
 		 1175 aa  62.8  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1730  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.54 
 
 		 1195 aa  62.4  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.479441  normal  0.752594 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00768  cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin transporter  25.43 
 
 		 499 aa  60.8  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0219  histidine kinase  30.13 
 
 		 1166 aa  60.8  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.803779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0230  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  27.34 
 
 		 486 aa  60.5  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.239977 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1871  cytosine/purine/uracil/thiamine/allantoin permease family protein  23.41 
 
 		 483 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3525  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.54 
 
 		 1197 aa  60.5  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471601 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1794  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  25.77 
 
 		 446 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1430  NCS1 family nucleobase/cation symporter  23.16 
 
 		 503 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3531  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  22.36 
 
 		 483 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0729525 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1762  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  29.45 
 
 		 1146 aa  57.8  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.468259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0610  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin family protein  25.76 
 
 		 568 aa  58.2  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3573  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.67 
 
 		 1120 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1533  NCS1 nucleoside transporter  23.28 
 
 		 503 aa  57  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.578632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2771  putative hydroxymethylpyrimidine transporter CytX  26.24 
 
 		 446 aa  57  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0255944  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>