73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_03710 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03710  putative permease  100 
 
 		 407 aa  799    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03659  hypothetical protein  100 
 
 		 407 aa  799    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4197  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin family permease  99.26 
 
 		 407 aa  793    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118639 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3467  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  29.6 
 
 		 439 aa  139  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1725  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.92 
 
 		 434 aa  117  5e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1993  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  26.3 
 
 		 443 aa  106  9e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05320  cytosine permease  26.72 
 
 		 412 aa  104  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1965  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  25.8 
 
 		 439 aa  103  6e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000566  cytosine/purine/uracil/thiamine/allantoin permease family protein  25.95 
 
 		 412 aa  102  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113273  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0016  cytosine permease  24.54 
 
 		 417 aa  97.1  5e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05700  cytosine permease  28.43 
 
 		 416 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0539  cytosine permease  28.18 
 
 		 416 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3584  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  27.49 
 
 		 438 aa  91.7  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1545  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  23.66 
 
 		 441 aa  90.9  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0409  cytosine permease  26.5 
 
 		 419 aa  89.7  9e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3289  cytosine permease  26.5 
 
 		 419 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00290  cytosine transporter  26.5 
 
 		 419 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00294  hypothetical protein  26.5 
 
 		 419 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0360  cytosine permease  26.5 
 
 		 419 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0401  cytosine permease  26.5 
 
 		 419 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0367  cytosine permease  26.5 
 
 		 419 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.506759 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3270  NCS1 nucleoside transporter family  26.5 
 
 		 419 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0862  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  26.81 
 
 		 455 aa  87.4  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000967478  normal  0.747959 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2198  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.2 
 
 		 445 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0171933  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0843  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.72 
 
 		 420 aa  82.4  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.27545  normal  0.552006 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2802  cytosine permease  26.68 
 
 		 421 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.018065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3596  cytosine permease  27.02 
 
 		 417 aa  80.5  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4194  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  26.09 
 
 		 431 aa  80.5  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3631  cytosine permease  26.4 
 
 		 425 aa  80.1  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.822935 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0413  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.16 
 
 		 432 aa  79.7  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2351  cytosine permease  24.01 
 
 		 411 aa  79.7  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3524  cytosine permease  26.4 
 
 		 417 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3187  cytosine permease  26.02 
 
 		 421 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2453  cytosine permease  24.12 
 
 		 414 aa  77  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0630  cytosine permease  23.64 
 
 		 417 aa  76.3  0.0000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.201877  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2529  cytosine permease  26.02 
 
 		 421 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0365158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3526  cytosine permease  26.73 
 
 		 449 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3693  cytosine permease  26.73 
 
 		 425 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0779  cytosine permease  22.91 
 
 		 421 aa  73.6  0.000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.99673  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0863  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.33 
 
 		 440 aa  72.4  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1584  cytosine permease  24.69 
 
 		 417 aa  72.8  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2654  cytosine permease  26.32 
 
 		 421 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3279  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25 
 
 		 431 aa  71.6  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00201301  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3367  putative cytosine permease  26.16 
 
 		 439 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.130336  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0815  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  23.1 
 
 		 438 aa  67.8  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0801  cytosine permease  22.45 
 
 		 431 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141599  normal  0.241333 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2188  cytosine permease  25.44 
 
 		 421 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2208  cytosine permease  24.32 
 
 		 421 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.739585 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1854  cytosine permease  25.76 
 
 		 395 aa  65.5  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.382094  hitchhiker  0.0000028856 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22900  purine-cytosine permease-like transporter  24.27 
 
 		 455 aa  64.7  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.383587 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1641  cytosine permease  23.6 
 
 		 420 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.18791  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2759  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  21.73 
 
 		 457 aa  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1032  cytosine permease  23.68 
 
 		 441 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1118  cytosine permease  23.68 
 
 		 441 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2333  cytosine permease  23.68 
 
 		 420 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0157  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin family permease  23.96 
 
 		 460 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.489113  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00980  purine-cytosine permease-like transporter  22.91 
 
 		 427 aa  61.6  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0601  cytosine permease  24.55 
 
 		 420 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0866  cytosine permease  24.55 
 
 		 441 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1833  cytosine permease  24.55 
 
 		 441 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0184024  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1044  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  21.75 
 
 		 438 aa  60.1  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.955284  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3778  cytosine permease  23.41 
 
 		 423 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3060  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.83 
 
 		 460 aa  59.3  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1828  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  22.52 
 
 		 455 aa  57  0.0000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2449  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.49 
 
 		 453 aa  57.4  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1591  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  27.31 
 
 		 456 aa  55.8  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0426  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.42 
 
 		 448 aa  55.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.203282  normal  0.440595 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0650  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  27.34 
 
 		 472 aa  53.9  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0343903 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4072  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  26.37 
 
 		 450 aa  50.8  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5706  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  22.95 
 
 		 479 aa  50.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.829822  normal  0.11286 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2841  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  23.94 
 
 		 444 aa  48.9  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.810699  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3201  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.44 
 
 		 424 aa  48.1  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1794  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  23.69 
 
 		 446 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>