171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_3060 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_3060  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  100 
 
 		 460 aa  908    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1545  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  54.99 
 
 		 441 aa  489  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2198  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  51.88 
 
 		 445 aa  462  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0171933  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3584  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  51.88 
 
 		 438 aa  456  1e-127  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1965  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  42.79 
 
 		 439 aa  381  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3279  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  43.6 
 
 		 431 aa  347  2e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00201301  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0413  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  43.33 
 
 		 432 aa  341  2e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0815  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  42.6 
 
 		 438 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0426  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  41.76 
 
 		 448 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.203282  normal  0.440595 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1044  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  40.43 
 
 		 438 aa  330  2e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.955284  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4194  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  41.4 
 
 		 431 aa  329  5.0000000000000004e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22900  purine-cytosine permease-like transporter  42.11 
 
 		 455 aa  318  1e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.383587 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3201  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  39.73 
 
 		 424 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3367  putative cytosine permease  42.69 
 
 		 439 aa  310  5e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.130336  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1725  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  31.17 
 
 		 434 aa  167  5e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1993  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  30.72 
 
 		 443 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000566  cytosine/purine/uracil/thiamine/allantoin permease family protein  31.25 
 
 		 412 aa  139  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113273  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0016  cytosine permease  30.68 
 
 		 417 aa  138  2e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05320  cytosine permease  32.55 
 
 		 412 aa  136  9e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3596  cytosine permease  29.23 
 
 		 417 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3524  cytosine permease  29.23 
 
 		 417 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0539  cytosine permease  28.85 
 
 		 416 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3631  cytosine permease  29.01 
 
 		 425 aa  131  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.822935 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05700  cytosine permease  28.85 
 
 		 416 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0401  cytosine permease  27.35 
 
 		 419 aa  126  7e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00290  cytosine transporter  27.35 
 
 		 419 aa  126  8.000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3270  NCS1 nucleoside transporter family  27.35 
 
 		 419 aa  126  8.000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00294  hypothetical protein  27.35 
 
 		 419 aa  126  8.000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3289  cytosine permease  27.35 
 
 		 419 aa  126  8.000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0367  cytosine permease  27.35 
 
 		 419 aa  126  8.000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.506759 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0360  cytosine permease  27.35 
 
 		 419 aa  126  9e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0409  cytosine permease  27.35 
 
 		 419 aa  126  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2449  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  27.25 
 
 		 453 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0862  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  27.53 
 
 		 455 aa  120  3.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000967478  normal  0.747959 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3693  cytosine permease  29.45 
 
 		 425 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3526  cytosine permease  29.23 
 
 		 449 aa  120  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0630  cytosine permease  29.77 
 
 		 417 aa  118  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.201877  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0157  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin family permease  28.71 
 
 		 460 aa  112  2.0000000000000002e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.489113  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2802  cytosine permease  28.41 
 
 		 421 aa  111  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.018065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2188  cytosine permease  28.88 
 
 		 421 aa  111  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0843  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  26.24 
 
 		 420 aa  107  4e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.27545  normal  0.552006 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1828  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  26.11 
 
 		 455 aa  104  4e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2453  cytosine permease  26.42 
 
 		 414 aa  102  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1584  cytosine permease  23.64 
 
 		 417 aa  102  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0863  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.07 
 
 		 440 aa  98.6  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1591  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.3 
 
 		 456 aa  92  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1854  cytosine permease  29.61 
 
 		 395 aa  92  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.382094  hitchhiker  0.0000028856 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3778  cytosine permease  23.48 
 
 		 423 aa  92  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00980  purine-cytosine permease-like transporter  26.44 
 
 		 427 aa  92.4  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4598  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  25.3 
 
 		 493 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1118  cytosine permease  25.58 
 
 		 441 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2333  cytosine permease  25.58 
 
 		 420 aa  88.2  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1641  cytosine permease  25.46 
 
 		 420 aa  87.8  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.18791  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0650  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  30.9 
 
 		 472 aa  87.4  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0343903 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0779  cytosine permease  24.67 
 
 		 421 aa  87.4  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.99673  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1032  cytosine permease  25.32 
 
 		 441 aa  87  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2529  cytosine permease  23.13 
 
 		 421 aa  87  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0365158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0866  cytosine permease  25.32 
 
 		 441 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1833  cytosine permease  25.32 
 
 		 441 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0184024  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0601  cytosine permease  25.32 
 
 		 420 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3187  cytosine permease  23.13 
 
 		 421 aa  84  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3467  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  27.33 
 
 		 439 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0801  cytosine permease  25.39 
 
 		 431 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141599  normal  0.241333 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2351  cytosine permease  24.07 
 
 		 411 aa  82  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2208  cytosine permease  25.47 
 
 		 421 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.739585 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2654  cytosine permease  25.2 
 
 		 421 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2863  NCS1 nucleoside transporter  25.44 
 
 		 497 aa  69.7  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4035  NCS1 nucleoside transporter  25.95 
 
 		 496 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1803  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  25.95 
 
 		 496 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.666463  normal  0.799889 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3637  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.71 
 
 		 505 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3440  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  24.76 
 
 		 494 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.709152  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2759  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  22.7 
 
 		 457 aa  65.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05790  putative transporter  27.83 
 
 		 496 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4974  hydroxymethylpyrimidine transporter CytX  26.79 
 
 		 427 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4197  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin family permease  24.37 
 
 		 407 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118639 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5720  NCS1 nucleoside transporter  24.16 
 
 		 502 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244182  normal  0.497544 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5964  NCS1 nucleoside transporter  24.38 
 
 		 502 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0145337  normal  0.627469 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.41 
 
 		 555 aa  62  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1233  transporter transmembrane protein  24.46 
 
 		 502 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0759006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1918  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  25.87 
 
 		 503 aa  61.6  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.991169 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2959  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.78 
 
 		 468 aa  61.6  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2066  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.23 
 
 		 534 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4797  putative hydroxymethylpyrimidine transporter CytX  26.07 
 
 		 427 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1221  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.16 
 
 		 476 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0546  putative transporter  27.36 
 
 		 496 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1140  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.16 
 
 		 476 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.146583 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0768  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  24.16 
 
 		 435 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.283527  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1249  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  24.16 
 
 		 476 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0960267  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03710  putative permease  25.06 
 
 		 407 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03659  hypothetical protein  25.06 
 
 		 407 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4921  NCS1 nucleoside transporter  25.59 
 
 		 427 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0951814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09360  probable hydroxymethylpyrimidine transporter CytX  23.27 
 
 		 416 aa  59.3  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.268783 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4383  cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin transporter  23.9 
 
 		 476 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3052  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  25.31 
 
 		 459 aa  58.9  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.700557  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4150  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  24.75 
 
 		 494 aa  59.3  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5352  NCS1 nucleoside transporter  23.81 
 
 		 502 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.157454 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1430  NCS1 family nucleobase/cation symporter  23.36 
 
 		 503 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2688  NCS1 nucleoside transporter family  23.36 
 
 		 503 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.931856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2385  NCS1 nucleoside transporter family  26.67 
 
 		 492 aa  58.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3100  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.25 
 
 		 489 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>