More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0257 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0257  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  100 
 
 
458 aa  913    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000119311  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2759  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  26.98 
 
 
457 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1794  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  26.28 
 
 
446 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6281  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.73 
 
 
491 aa  110  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.575901 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0640  hydroxymethylpyrimidine transporter CytX  23.18 
 
 
438 aa  110  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0564  hypothetical protein  28.3 
 
 
487 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.824593 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4072  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.75 
 
 
450 aa  106  9e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5706  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  26.3 
 
 
479 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.829822  normal  0.11286 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2557  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.83 
 
 
484 aa  103  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266727  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2771  putative hydroxymethylpyrimidine transporter CytX  25 
 
 
446 aa  103  8e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0255944  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2863  NCS1 nucleoside transporter  25.29 
 
 
497 aa  102  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2841  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  24 
 
 
444 aa  101  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.810699  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4150  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  27.01 
 
 
494 aa  100  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2654  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.18 
 
 
489 aa  99.8  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0867  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.74 
 
 
487 aa  96.7  7e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.460457  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0460  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  24.36 
 
 
502 aa  96.3  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1918  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  25.26 
 
 
503 aa  93.2  9e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.991169 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5168  NCS1 nucleoside transporter family  25.86 
 
 
524 aa  92  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.409771 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3437  nucleobase/cation symporter, (NCS1) family  22.45 
 
 
438 aa  92  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0075  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  26.55 
 
 
485 aa  92  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.82012  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3697  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  27.25 
 
 
538 aa  90.9  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4056  NCS1 nucleoside transporter  25.35 
 
 
515 aa  90.1  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3440  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  25.95 
 
 
494 aa  90.1  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.709152  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0968  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  27.03 
 
 
489 aa  89.7  9e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.553781  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2834  NCS1 nucleoside transporter  24.63 
 
 
482 aa  89.4  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09360  probable hydroxymethylpyrimidine transporter CytX  27.07 
 
 
416 aa  89.4  1e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.268783 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4412  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  24.38 
 
 
476 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.274319 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1042  hydroxymethylpyrimidine transporter CytX  22 
 
 
438 aa  88.6  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144538  normal  0.528331 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4797  putative hydroxymethylpyrimidine transporter CytX  23.77 
 
 
427 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0546  putative transporter  26.35 
 
 
496 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4185  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  24.51 
 
 
476 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4251  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  24.51 
 
 
476 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.236014 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4921  NCS1 nucleoside transporter  22.42 
 
 
427 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0951814  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05790  putative transporter  26.35 
 
 
496 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1533  NCS1 nucleoside transporter  25.27 
 
 
503 aa  86.7  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.578632  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4974  hydroxymethylpyrimidine transporter CytX  22.65 
 
 
427 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2688  NCS1 nucleoside transporter family  24.09 
 
 
503 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.931856  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3297  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  27.52 
 
 
520 aa  85.5  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1430  NCS1 family nucleobase/cation symporter  24.2 
 
 
503 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2142  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.82 
 
 
453 aa  84.7  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.32672 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0055  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  27.39 
 
 
461 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.119028 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0125  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  21.57 
 
 
448 aa  84  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371605  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6019  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.7 
 
 
480 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.213946  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1280  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.52 
 
 
483 aa  83.6  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1111  NCS1 nucleoside transporter  23.74 
 
 
494 aa  83.2  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.502762  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2764  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  26.49 
 
 
517 aa  83.2  0.000000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.63902 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4035  NCS1 nucleoside transporter  24.48 
 
 
496 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0041  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  23.87 
 
 
457 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.758493  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1803  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  24.48 
 
 
496 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.666463  normal  0.799889 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0862  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  26.01 
 
 
507 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.472129  normal  0.0659585 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0338  NCS1 nucleoside transporter  22.88 
 
 
496 aa  81.3  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0222  NCS1 nucleoside transporter  23.4 
 
 
509 aa  81.3  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3637  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.24 
 
 
505 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3590  NCS1 nucleoside transporter  24.89 
 
 
490 aa  80.9  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.483466 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15160  purine-cytosine permease-like transporter  25.06 
 
 
483 aa  80.5  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.280122  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1233  transporter transmembrane protein  24.79 
 
 
502 aa  80.5  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0759006  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1599  putative hydroxymethylpyrimidine transporter CytX  24.66 
 
 
389 aa  80.1  0.00000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0130344  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1837  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.91 
 
 
500 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.524757  normal  0.0916284 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3578  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  24.63 
 
 
486 aa  79.3  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.190049 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0545  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  20.9 
 
 
429 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2922  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  26.62 
 
 
489 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.185419  normal  0.664118 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1843  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.81 
 
 
451 aa  79  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.82356  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4536  NCS1 nucleoside transporter family  25.05 
 
 
533 aa  79  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.854613  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1836  NCS1 nucleoside transporter family protein  24.43 
 
 
487 aa  78.2  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.729443  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0405  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  25.4 
 
 
452 aa  78.2  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0202053  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0262  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  24.05 
 
 
468 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0678  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  23.45 
 
 
450 aa  77.4  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.232179  normal  0.0587875 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4820  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  23.98 
 
 
487 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0335  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  24.31 
 
 
483 aa  77  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2286  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.01 
 
 
484 aa  76.6  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3607  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.08 
 
 
474 aa  76.6  0.0000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5352  NCS1 nucleoside transporter  25.11 
 
 
502 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.157454 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4713  hydroxymethylpyrimidine transporter CytX  23.42 
 
 
427 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.244042 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4975  cytosine/purine/uracil/thiamine/allantoin permease family protein  21.25 
 
 
429 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3810  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  22.62 
 
 
497 aa  75.1  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5091  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  23.27 
 
 
483 aa  75.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415087  normal  0.0197454 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1431  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  23.15 
 
 
486 aa  75.5  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1908  NCS1 nucleoside transporter family protein  23.95 
 
 
487 aa  74.7  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.535002  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1725  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.13 
 
 
434 aa  74.7  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0611  allantoin permease  24.94 
 
 
463 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4136  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  24.59 
 
 
488 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0121815  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3430  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  23.33 
 
 
520 aa  74.7  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0158  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  23.95 
 
 
450 aa  73.9  0.000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18030  purine-cytosine permease-like transporter  24.35 
 
 
488 aa  73.9  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.046034  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00461  predicted allantoin transporter  25.28 
 
 
484 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.592868  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3102  NCS1 nucleoside transporter family  25.28 
 
 
484 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0584  allantoin permease  25.28 
 
 
484 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3112  allantoin permease  25.28 
 
 
484 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.379099 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1594  NCS1 nucleoside transporter  24.28 
 
 
502 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0843  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.88 
 
 
488 aa  72.8  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3052  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  23.61 
 
 
459 aa  72.4  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.700557  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1469  purine-cytosine permease or related protein  24.21 
 
 
452 aa  72.8  0.00000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.454286  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00466  hypothetical protein  25.28 
 
 
484 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.955616  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6237  NCS1 nucleoside transporter  24.28 
 
 
502 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.155037 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0547  allantoin permease  25.06 
 
 
484 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0774  NCS1 nucleoside transporter family protein  22.25 
 
 
494 aa  72  0.00000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.182472 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0553  allantoin permease  24.77 
 
 
484 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.962113 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6713  NCS1 nucleoside transporter  24.06 
 
 
502 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.997894 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0076  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  23.67 
 
 
449 aa  72.4  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00450378  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2959  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  22.27 
 
 
468 aa  72  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>