More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2001 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0219  histidine kinase  45.76 
 
 		 1166 aa  904    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.803779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5667  histidine kinase  47.2 
 
 		 1140 aa  926    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4079  sensor histidine kinase/response regulator  47.18 
 
 		 1161 aa  1020    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3691  histidine kinase  50.33 
 
 		 1071 aa  990    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3065  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  49.69 
 
 		 1128 aa  1068    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1446  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  45.84 
 
 		 1131 aa  973    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.705679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0975  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  51.95 
 
 		 1130 aa  1114    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.537982 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2001  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 1121 aa  2257    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1082  histidine kinase  43.91 
 
 		 1220 aa  897    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0653  sensor histidine kinase  53.36 
 
 		 1124 aa  1140    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.450749  normal  0.469118 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4180  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  49.2 
 
 		 1126 aa  1055    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0796198 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3586  sensor histidine kinase/response regulator  46.3 
 
 		 1153 aa  965    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0670  sensor histidine kinase/response regulator  46.19 
 
 		 1170 aa  943    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.315036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1251  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.79 
 
 		 1122 aa  1160    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0612415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3398  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  44.88 
 
 		 1202 aa  945    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.613847  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2976  two-component hybrid sensor and regulator  45.71 
 
 		 1132 aa  1026    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.210238 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3868  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  49.42 
 
 		 1127 aa  1050    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1762  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  45.35 
 
 		 1146 aa  991    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.468259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  46.63 
 
 		 1127 aa  996    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1353  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  46.4 
 
 		 1197 aa  977    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1712  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  47.35 
 
 		 1173 aa  956    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0980923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3865  ATP-binding region, ATPase-like  51.65 
 
 		 1122 aa  1156    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3573  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  50 
 
 		 1120 aa  1017    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1730  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  44.9 
 
 		 1195 aa  915    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.479441  normal  0.752594 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1586  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  46.57 
 
 		 1178 aa  975    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.830805  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3731  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  47.02 
 
 		 1140 aa  926    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0961  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  44.37 
 
 		 1154 aa  957    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.544458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3498  two component sensor kinase  48.97 
 
 		 1125 aa  1039    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00879  two-component hybrid sensor and regulator  43.48 
 
 		 1100 aa  890    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4637  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  47.02 
 
 		 1140 aa  926    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.619414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0592  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  52.76 
 
 		 1113 aa  1120    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0114606 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5513  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  49.82 
 
 		 1124 aa  1013    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.168644  normal  0.269782 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4239  histidine kinase  43.97 
 
 		 1211 aa  935    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1442  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  51.07 
 
 		 1122 aa  1145    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3382  ATPase domain-containing protein  50.14 
 
 		 1071 aa  989    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525319  normal  0.740946 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3146  histidine kinase  46.21 
 
 		 1140 aa  919    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.353593  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0978  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  46.13 
 
 		 1175 aa  952    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3525  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  45.14 
 
 		 1197 aa  962    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471601 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3320  histidine kinase  49.56 
 
 		 1128 aa  1067    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.515444 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2985  fused histidine kinase sensor/response regulator  43.9 
 
 		 1121 aa  971    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.446873 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1894  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.77 
 
 		 1085 aa  551  1e-155  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.82 
 
 		 555 aa  537  1e-151  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6438  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  49.91 
 
 		 573 aa  528  1e-148  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3568  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 		 874 aa  476  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.489697 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0610  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin family protein  44.59 
 
 		 568 aa  414  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1280  hypothetical protein  42.57 
 
 		 596 aa  381  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.961931  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0985  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  42.77 
 
 		 575 aa  382  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0012046 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3405  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  41.31 
 
 		 570 aa  367  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.286515  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13491  integral membrane protein  40.53 
 
 		 443 aa  303  8.000000000000001e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.134076 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  34.18 
 
 		 2051 aa  269  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1664  histidine kinase  37.5 
 
 		 530 aa  267  8.999999999999999e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.586003  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3211  histidine kinase  39.3 
 
 		 781 aa  258  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.306218  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1017  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.67 
 
 		 1323 aa  253  1e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0385374  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2508  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.44 
 
 		 784 aa  253  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.033945 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5184  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.85 
 
 		 939 aa  252  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.0776559 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3975  Cache sensor hybrid histidine kinase  34.5 
 
 		 811 aa  251  7e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000222358  hitchhiker  0.00723661 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3243  PAS sensor protein  33.76 
 
 		 1323 aa  249  3e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1117  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.27 
 
 		 770 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6547  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.1 
 
 		 865 aa  246  1.9999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.325935 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4135  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.81 
 
 		 922 aa  246  3e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000370631  normal  0.0140414 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6237  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.04 
 
 		 721 aa  239  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703753 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6560  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.99 
 
 		 720 aa  233  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.646619 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.21 
 
 		 989 aa  229  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4154  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.75 
 
 		 750 aa  228  5.0000000000000005e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.22479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.94 
 
 		 935 aa  225  3e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1719  histidine kinase  33.4 
 
 		 1257 aa  226  3e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0583268  normal  0.402469 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1855  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.07 
 
 		 1285 aa  223  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.14 
 
 		 989 aa  219  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1349  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.06 
 
 		 1578 aa  219  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.06 
 
 		 1611 aa  219  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3135  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.18 
 
 		 1187 aa  218  4e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4464  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 		 945 aa  217  9.999999999999999e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.83 
 
 		 1058 aa  214  7e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  32.78 
 
 		 970 aa  214  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1511  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.54 
 
 		 1002 aa  214  9e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1484  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.54 
 
 		 1002 aa  214  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2148  Cache sensor hybrid histidine kinase  31.17 
 
 		 937 aa  212  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.53 
 
 		 1363 aa  211  5e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1082  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.26 
 
 		 1068 aa  210  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31862 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.28 
 
 		 823 aa  208  4e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.48 
 
 		 1691 aa  207  8e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0808  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.5 
 
 		 929 aa  206  3e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0107  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.45 
 
 		 774 aa  205  4e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.84 
 
 		 977 aa  203  9.999999999999999e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 791 aa  203  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108732  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.98 
 
 		 1362 aa  204  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.1 
 
 		 738 aa  202  3.9999999999999996e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0819  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.61 
 
 		 844 aa  201  5e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4225  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.17 
 
 		 1322 aa  201  5e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0848  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.61 
 
 		 844 aa  201  5e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.83 
 
 		 763 aa  200  1.0000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2174  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.32 
 
 		 633 aa  199  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.634157  normal  0.649523 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  33.09 
 
 		 1361 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0664  ATP-binding region, ATPase-like protein  31.52 
 
 		 853 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.01 
 
 		 874 aa  199  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.93 
 
 		 846 aa  199  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  31.92 
 
 		 823 aa  199  3e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0770  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.1 
 
 		 911 aa  199  3e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  32.42 
 
 		 882 aa  199  3e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0100  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.57 
 
 		 1182 aa  198  4.0000000000000005e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>