More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3586 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3320  histidine kinase  48.71 
 
 
1128 aa  1065    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.515444 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4079  sensor histidine kinase/response regulator  53.48 
 
 
1161 aa  1222    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1446  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  51.64 
 
 
1131 aa  1145    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.705679  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0653  sensor histidine kinase  50.85 
 
 
1124 aa  1094    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.450749  normal  0.469118 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3382  ATPase domain-containing protein  47.78 
 
 
1071 aa  915    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525319  normal  0.740946 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5513  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  48.84 
 
 
1124 aa  980    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.168644  normal  0.269782 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3573  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  48.15 
 
 
1120 aa  969    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3868  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  51.41 
 
 
1127 aa  1060    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4239  histidine kinase  48.54 
 
 
1211 aa  1070    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3525  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  49.06 
 
 
1197 aa  1092    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.471601 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0592  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  51.48 
 
 
1113 aa  1044    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0114606 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3498  two component sensor kinase  48.45 
 
 
1125 aa  1052    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1251  multi-sensor hybrid histidine kinase  52.01 
 
 
1122 aa  1149    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0612415  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0978  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  51.36 
 
 
1175 aa  1121    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3398  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  49.83 
 
 
1202 aa  1113    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.613847  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2976  two-component hybrid sensor and regulator  48.44 
 
 
1132 aa  1056    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.210238 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0219  histidine kinase  62.43 
 
 
1166 aa  1291    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.803779  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1762  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  52.53 
 
 
1146 aa  1187    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.468259  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2985  fused histidine kinase sensor/response regulator  46.22 
 
 
1121 aa  1011    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.446873 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  73.6 
 
 
1127 aa  1687    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1353  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  51.3 
 
 
1197 aa  1129    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1712  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  54.13 
 
 
1173 aa  1141    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0980923  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3146  histidine kinase  75.71 
 
 
1140 aa  1608    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.353593  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0961  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  45.67 
 
 
1154 aa  981    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.544458  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3865  ATP-binding region, ATPase-like  51.92 
 
 
1122 aa  1144    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3586  sensor histidine kinase/response regulator  100 
 
 
1153 aa  2342    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1586  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  49.96 
 
 
1178 aa  1099    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.830805  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3731  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  53.3 
 
 
1140 aa  1154    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0670  sensor histidine kinase/response regulator  50.74 
 
 
1170 aa  1076    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.315036  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1730  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  48.69 
 
 
1195 aa  1064    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.479441  normal  0.752594 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2001  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  46.39 
 
 
1121 aa  970    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3065  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  49.15 
 
 
1128 aa  1070    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1082  histidine kinase  49.16 
 
 
1220 aa  1069    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4637  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  53.3 
 
 
1140 aa  1154    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.619414  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1442  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  50.9 
 
 
1122 aa  1124    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0975  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  52.38 
 
 
1130 aa  1129    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.537982 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4180  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  46.89 
 
 
1126 aa  1023    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0796198 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3691  histidine kinase  47.87 
 
 
1071 aa  918    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00879  two-component hybrid sensor and regulator  44.2 
 
 
1100 aa  902    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5667  histidine kinase  53.3 
 
 
1140 aa  1152    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6438  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  54.7 
 
 
573 aa  596  1e-169  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1894  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.83 
 
 
1085 aa  597  1e-169  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53.6 
 
 
555 aa  596  1e-168  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3568  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.41 
 
 
874 aa  510  1e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.489697 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0610  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin family protein  43.32 
 
 
568 aa  425  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1280  hypothetical protein  44.64 
 
 
596 aa  417  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.961931  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0985  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  42.69 
 
 
575 aa  390  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0012046 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3405  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  42.44 
 
 
570 aa  380  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.286515  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6547  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.88 
 
 
865 aa  310  1.0000000000000001e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.325935 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13491  integral membrane protein  40.94 
 
 
443 aa  308  3e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.134076 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  36.65 
 
 
2051 aa  300  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6237  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.98 
 
 
721 aa  298  3e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.703753 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3975  Cache sensor hybrid histidine kinase  35.89 
 
 
811 aa  294  8e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000222358  hitchhiker  0.00723661 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3211  histidine kinase  40.85 
 
 
781 aa  292  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.306218  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1117  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.08 
 
 
770 aa  289  2.9999999999999996e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6560  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.24 
 
 
720 aa  288  4e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.646619 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3243  PAS sensor protein  37.82 
 
 
1323 aa  283  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2508  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.82 
 
 
784 aa  280  8e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.033945 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2148  Cache sensor hybrid histidine kinase  35.1 
 
 
937 aa  276  1.0000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1017  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.2 
 
 
1323 aa  276  2.0000000000000002e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0385374  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5184  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.08 
 
 
939 aa  276  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.0776559 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1719  histidine kinase  40.83 
 
 
1257 aa  275  4.0000000000000004e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0583268  normal  0.402469 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0072  histidine kinase  40.1 
 
 
810 aa  271  5e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4135  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.01 
 
 
922 aa  270  8.999999999999999e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000370631  normal  0.0140414 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4154  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.08 
 
 
750 aa  267  8.999999999999999e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.22479  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.02 
 
 
989 aa  266  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1349  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.32 
 
 
1578 aa  266  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3135  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.41 
 
 
1187 aa  265  3e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.09 
 
 
1611 aa  265  4e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2948  histidine kinase  40.35 
 
 
800 aa  262  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549542  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.24 
 
 
989 aa  261  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1005  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.67 
 
 
747 aa  259  3e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1082  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.93 
 
 
1068 aa  255  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31862 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4225  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.26 
 
 
1322 aa  253  1e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1855  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.47 
 
 
1285 aa  253  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.11 
 
 
1058 aa  251  4e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1302  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.02 
 
 
1090 aa  251  5e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0842919  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1273  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.02 
 
 
1090 aa  251  7e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3872  PAS  40.35 
 
 
853 aa  251  8e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.29 
 
 
846 aa  249  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1664  histidine kinase  38.7 
 
 
530 aa  248  4e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.586003  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2699  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.46 
 
 
1099 aa  246  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117538 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.24 
 
 
935 aa  245  3.9999999999999997e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0808  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.44 
 
 
929 aa  241  5e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  37.2 
 
 
970 aa  240  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0848  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.29 
 
 
844 aa  239  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0819  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.29 
 
 
844 aa  239  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0915  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.16 
 
 
822 aa  236  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.75 
 
 
995 aa  236  2.0000000000000002e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2174  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.65 
 
 
633 aa  234  6e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.634157  normal  0.649523 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.68 
 
 
817 aa  233  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.71 
 
 
1407 aa  232  4e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1511  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.48 
 
 
1002 aa  230  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4464  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.05 
 
 
945 aa  230  1e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3846  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.22 
 
 
860 aa  229  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.27 
 
 
791 aa  229  2e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108732  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1484  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.48 
 
 
1002 aa  229  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.89 
 
 
827 aa  229  3e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0232  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  36.7 
 
 
738 aa  226  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5067  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.91 
 
 
1002 aa  226  3e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>